滕人达
- 作品数：3 被引量：17H指数：2
- 供职机构：辽宁师范大学计算机与信息技术学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术更多>>
- 多核并行技术在分子动力学模拟中的应用被引量：8
- 2011年
- 为了充分利用多核处理器资源,研究了一种用于分子动力学模拟中的多核并行技术。在多核处理器上利用OpenMP技术实现多线程创建与同步、动态设置子线程的调度运行方式以及负载均衡以减少子线程执行等待时间。通过对不同分子体系结构下的动力学模型测试,得出在不同子线程下并行计算的时间,并且得到了良好的性能加速比。实验结果表明,采用OpenMP并行技术可有效地提高电荷求解过程在分子动力学模拟运算中的时间效率,以及多核计算机资源的利用率。
- 刘青昆滕人达刘凤宫利东张建强
- 关键词：多核多线程MPIOPENMP分子动力学模拟
- 基于ABEEMσπ模型能量求解并行处理的研究
- 目前,分子动力学模拟是应用前景最广泛的计算大型复杂生物体系的方法之一。伴随着分子力学模拟技术的的飞速发展,分子动力学模拟技术应用在许多生物大分子体系中,如水分子化合物、多肽化合物、多糖等。该技术使得多种大型复杂生物体系的...
- 滕人达
- 关键词：多线程分子动力学模拟数据竞争多核平台
- CUDA、MPI和OpenMP三级混合并行模型的研究被引量：9
- 2010年
- 采用CUDA+MPI+OpenMP的三级并行编程模式,实现节点间的粗粒度并行,节点内的细粒度并行以及将GPU作为并行计算设备的CUDA编程模型。这种新的三级并行混合编程模式为SMP机群提供了一种更为高效的并行策略。本文讨论了三级并行编程环境的快速搭建以及多粒度混合并行编程方法,并在多个节点的机群环境中完成测试工作。
- 滕人达刘青昆
- 关键词：CUDAMPIOPENMP图形处理器机群系统
