陈世良
- 作品数:40 被引量:42H指数:4
- 供职机构:广东省医学科学院更多>>
- 发文基金:广东省医学科学技术研究基金广东省科技计划工业攻关项目广东省中医药管理局基金更多>>
- 相关领域:医药卫生轻工技术与工程冶金工程更多>>
- 变性高效液相色谱法检测多种途径获取的非小细胞肺癌组织表皮生长因子受体基因突变被引量:4
- 2010年
- 背景与目的表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)是最重要的非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)治疗靶点,EGFR突变可预测酪氨酸激酶抑制剂(tyrosine kinase inhibitor,TKI)的疗效。DNA直接测序是检测EGFR突变最常用的方法,同时也作为突变检测的"金标准",但该方法耗时较长、所需组织量较多且敏感性较低。变性高效液相色谱法是一种快速、自动化、高敏感性的突变检测方法,本研究旨在探讨变性高效液相色谱法(denaturing high-performance liquidc hromatography,DHPLC)快速检测NSCLC肿瘤组织EGFR基因突变的诊断价值。方法通过检测已知按不同比例混合的野生型及突变型EGFR质粒DNA,评价DHPLC法的准确性和敏感性。选取经多种途径获取的83例NSCLC患者的冻存肿瘤组织,提取DNA并PCR扩增EGFR外显子19、21,用DHPLC法检测并与直接测序法进行比较。结果当突变型质粒与野生型质粒按1:100混合时,仍可被DHPLC法显著检出,而直接测序法仅可检出1:10水平。83例NSCLC组织标本中,DHPLC法检出22例EGFR突变(突变率26.51%),3例直接测序法结果为野生型,余19例EGFR突变及61例野生型均与直接测序法结果相符。DHPLC法的敏感度为100%,特异度为95.31%,对经皮细针肺穿刺活检、淋巴结活检以及外科切除等途径获取的肿瘤样本均具有较高的敏感度、特异度。EGFR突变与性别、病理类型显著相关,与吸烟状态、年龄等无相关性。结论 DHPLC法可作为NSCLC患者EGFR基因型的初筛方法。
- 陈思远陈志红郭爱林苏健黄迎陈世良张绪超杨学宁杨衿记吴一龙
- 关键词:表皮生长因子受体突变变性高效液相色谱
- 早期非小细胞肺癌患者hsa-mir-34b基因启动子甲基化水平检测被引量:5
- 2010年
- 目的 检测早期非小细胞肺癌(NSCLC)患者癌组织与癌旁组织hsa-mir-34b(mir-34b)基因启动子甲基化水平的差异.方法 采用重亚硫酸盐还原技术、降落巢式PCR扩增27例Ⅰ期NSCLC患者癌组织和癌旁组织配对样本中mir-34b基因启动子区DNA,克隆测序法分析甲基化谱变异,并与临床病理特征进行关联分析.结果 癌组织mir-34b基因启动子CpG岛整体甲基化水平为9.7%(6.8%~22.3%),而癌旁组织为8.5%(5.3%~11.0%),癌组织甲基化水平高于癌旁组织(Z=2.355, P=0.019).当前吸烟患者mir-34b基因启动子甲基化发生率高于以往吸烟及不吸烟者.癌组织mir-34b基因启动子甲基化水平与患者性别、年龄、PS评分无关.结论 早期NSCLC患者癌组织mir-34b基因启动子甲基化水平升高,吸烟可能与mir-34b基因启动子甲基化的发生有关.mir-34b基因甲基化与早期肿瘤发生相关的机制值得进一步研究.
- 宗飒张绪超苏健谢至陈世良黄迎陈志红陈剑光杨学宁唐红艳严红虹吴一龙
- 关键词:DNA甲基化肺癌
- EGFR/HER2基因敲减对SPC-A-1细胞株细胞生物学特性及相关信号通路的影响被引量:1
- 2009年
- 目的:探讨EGFR/HER2基因沉默对非小细胞肺癌细胞株EGFR酪氨酸激酶信号转导通路的交互影响及其与细胞增殖、凋亡和周期改变的关系。方法:设计并合成EGFR、HER2及EGFR/HER2共干扰序列,构建含干扰序列的载体,进行瞬时转染;应用实时荧光定量、蛋白印迹法检测基因沉默效果;用四甲基偶氮唑盐比色法、流式细胞仪检测基因沉默后生物学特性改变;蛋白印迹法检测EGFR下游信号通路蛋白Akt、p-Akt、p-Erk1/2、p-p38表达水平变化;采用SPSS13.0软件分析结果。结果:在SPC-A-1细胞系中,EGFR干扰组、HER2干扰组、EGFR联合HER2干扰组和EGFR-HER2共干扰组体外细胞增殖率均有下降趋势;除EGFR干扰外,其余各组均可诱发凋亡;各组的细胞周期G1期和S期细胞比例有显著改变;基因沉默效果检测显示EGFR和HER2基因蛋白水平被下调。下游信号通路蛋白检测示EGFR下游信号通路蛋白Akt、p-Akt、p-Erk1/2、p-p38表达水平和细胞增殖、凋亡以及细胞周期改变之间未发现明显相关规律。结论:单纯EGFR干扰SPC-A-1细胞不能诱发显著凋亡,HER2和EGFR/HER2基因共沉默后诱发的人肺腺癌SPC-A-1细胞凋亡比阴性对照显著增加。EGFR/HER2基因沉默后诱发的细胞增殖、凋亡和细胞周期改变与EGFR家族下游信号通路蛋白之间未发现显著相关关系。
- 苏健钟文昭郭爱林李文瑜陈志红安社娟陈世良谢至
- 关键词:RNA干扰受体表皮生长因子
- 非小细胞肺癌DDR2突变分析
- 目的:盘状结构域受体(DDRs)是一种跨膜酪氨酸酶受体,有DDR1及DDR2两个家族成员,两者结构相似,含同源性的盘状结构、茎、跨膜区、近膜区及激酶区;DDR2编码基因由19个外显子组成,编码mRNA全长为2568bp....
- 苏健黄小穗罗宪玲吴一龙安社娟张绪超陈世良郭伟浜黄迎陈志红谢至唐红艳
- 关键词:非小细胞肺癌病理机制基因突变
- 文献传递
- 肺癌细胞株中层粘连蛋白5多态性与其表达水平的关系被引量:1
- 2012年
- 目的探讨肺癌细胞株中层粘连蛋白5(LN5)5′非翻译区多态性与其表达水平的关系。方法应用测序及实时定量PCR方法检测12株肺癌细胞株中LN55′非翻译区多态性和LN5基因mRNA表达水平,分析相互之间的关系。结果 LN55′非翻译区-183G/A中GA基因型的LN5mRNA表达水平明显高于GG基因型(t=7.136,P<0.001)。本研究中尚未发现LN5基因-6C/A和-89A/G多态性位点与其mRNA表达的相关性。结论本研究提示LN5启动子区-183G/A多态性位点具有转录调控功能,为进一步的机制探讨提供了依据。
- 安社娟陈志红朱建权严红虹杨素清陈世良孟薇苏健黄迎谢至郭伟浜吴一龙
- 关键词:肺癌多态性
- 非小细胞肺癌EML4-ALK融合方式的多样性被引量:3
- 2012年
- 目的探讨在非小细胞肺癌(NSCLC)标本中棘皮动物微管相关蛋白样4与间变淋巴瘤激酶融合基因(EMIA-ALK)变异的复杂性,分析其酪氨酸激酶(TK)结构域是否存在突变。方法在用eDNA末端快速扩增联合测序法检出1例NSCLC患者标本存在EML4-ALK的新变体V3e基础上,进一步采用逆转录(RT)-PCR分析39例NSCLC患者标本,针对阳性产物采用T载体克隆测序技术分析潜在的EML4-ALK序列多样性。同时用RT—PCR和测序分析EML4.ALK酪氨酸激酶结构域序列信息。结果从40例NSCLC患者肿瘤标本中检出3例NSCLC患者存在EML4-ALK变异。1例患者标本中EML4-ALK存在V3e(64.6%)、V3d(25.0%)、V3e(2.1%)、V3f(4.2%)、V3g(2.1%)和V3h(2.1%)6种融合变体,但不存在V3a、V3b2种常见融合方式;1例为V1变体;1例为V2和V3a、V3b变体共存。3例阳性标本中未发现ALK基因的TK结构域有耐药基因突变。结论NSCLC患者中可同时共存多种EML4-ALK变体,即EML4-ALK融合方式存在多样性与序列复杂性,临床分子检测中应全面关注EMIA-ALK的多种融合变体,以提高检出率。
- 田红霞吴一龙张绪超陈世良郭伟浜陈剑光谢至黄迎苏健陈志红安社娟唐红艳
- 关键词:蛋白酪氨酸激酶类聚合酶链反应
- MassARRAY质谱分析肺癌多基因突变方法的建立与应用被引量:3
- 2015年
- 目的:以Mass ARRAY质谱i PLEX分析技术为平台建立适合中国肺癌人群多基因同步检测的方法。方法:通过文献检索并结合国内外研究进展,确定与中国肺癌人群发病、耐药以及转移等密切相关的13个靶基因或相关传导通路基因(EGFR、KRAS、ALK、FGFR1、FGFR2、FGFR3、PIK3CA、BRAF、PTEN、MET、ERBB2、AKT1、STK11)。对目的基因突变进行筛选并确定99个热点突变。按Mass ARRAY突变位点标示方法和引物设计固定格式,引物设计软件在线设计297条引物(正、反向扩增引物和延伸引物各99条)。以8个肺癌细胞系以及6例肿瘤组织样本建立检测方法,与Lung Carta试剂盒对比验证。扩大检测100例肺癌组织样本,与EGFR和KRAS直接测序法比较敏感度与特异度。结果:使用本方法检测肺癌细胞系的基因突变,其中1例肺癌组织新检测到FGFR2基因突变,其他结果与Lung Carta试剂盒一致。与直接测序法相比较灵敏度为100%,特异度为96.3%。结论:成功建立Mass ARRAY质谱分析肺癌多基因突变检测方法,适合中国肺癌人群且具有临床应用前景。
- 田红霞张绪超王震陈剑光陈世良郭伟浜杨素清吴一龙
- 关键词:肺癌突变
- FGFR1扩增及过表达与肺鳞癌患者的预后和治疗的初步研究
- 目的:国际上已有多项研究表明FGFR1扩增及其蛋白过表达与肺鳞癌患者预后密切相关,但由于入组标准及检测方法的差异导致研究结果仍有争议.TCGA数据显示FGFR1是肺鳞癌中的一个主要可作用靶点.针对这一靶点的多种靶向药物己...
- 张琪张绪超谢至陈世良郭伟浜吴一龙
- 结肠癌新鲜组织及石蜡组织中K-ras基因突变率的比较
- 郭爱林苏健陈世良黄迎唐红艳陈志红谢至吴一龙
- 应用QIAsymphony工作站抽提临床肺癌组织样本DNA的研究
- 目的:对比分析全自动核酸分离纯化工作站与手工提取临床标本核酸效率,确认临床分子检测中应用全自动核酸抽提仪的可行性.方法:日常工作中按时间顺序连续选取肺癌组织共349例,使用QIAsymphony全自动工作站(磁珠法)和Q...
- 陈世良吴一龙张绪超郭伟浜田红霞谢志陈宇