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1990～1997年云南IDUs HIV-1B亚型分离株膜蛋白V3环顶端四肽基因序列的变化趋势被引量：2: 2000年; 目的　观察云南静脉药瘾 (IDUs)HIV 1分离株env基因V3环顶端四肽氨基酸和相应核苷酸序列随时间推移的变化。方法　根据 1990～ 1997年间 6 2株HIV 1分离株env基因C2 V3区DNA序列 ,对HIV 1膜蛋白V3环顶端四肽基因序列 (基序 )及其编码核苷酸进行分析 ,并探讨其随时间推移的变化趋势。结果　 1990～ 1997年间 6 2株HIV 1毒株膜蛋白V3环顶端四肽基序有程度不同的氨基酸变异 ,主要表现在第四位氨基酸的改变 ,变异呈现一定的趋向性。 6 2株云南标本中有 46例(74 2 % )为GPGR ,10例 (16 1% )为GPGQ ,4例 (6 4% )为GPGK ,另有 2例 (3 3% )为GPER且四肽基序编码核苷酸的变异主要表现为A→G的改变。结论　 1990～ 1997年这一时期内 ,云南IDUs特定感染者范围内HIV 1分离株膜蛋白V3环顶端四肽序列已表现出较大的趋向性 ,符合HIV; 吴虹王斌方荣路永波钱冬萌曾毅; 关键词：静脉药瘾艾滋病毒

1997～2000年我国华东地区HIV-1分离株抗原决定簇氨基酸及其编码核苷酸序列的变化: 2003年; ①目的　对 1997～ 2 0 0 0年来自华东地区 5 2例HIV 1分离株env基因C2～V3区序列及其V3环顶端主要中和抗原决定簇 (PND)氨基酸序列的变化规律进行分析。②方法　以来自同时期上述地区的HIV 1感染者PBMC基因组为模板 ,采用套式PCR扩增HIV 1env基因C2～V3区片段 ,产物经克隆、测序。DNA测序结果经DNAStar软件分析HIV 1分离株的基因分型 ,比较HIV 1膜蛋白V3环顶端PND相关八肽氨基酸及其编码核苷酸序列的变化特征及出现频率并测其共享序列。③结果　 1997～ 2 0 0 0年华东地区HIV 1分离株的基因分型有 7个 ,分别属于HIV 1M亚群的A～G亚型。分离株间的基因离散率为 1.2 %～ 5 .8%。同时发现了env基因双V3区变异的HIV 1自然突变株 (GenbankAF2 2 0 2 4 5 )。分析 5 2株PND相关八肽基因序列 ,其中以第 2、3、7位氨基酸及其编码核苷酸的变化最为显著 ,分别为 11.5 %、9.6 %、9.6 % ,且 3组共享序列相关的八肽亲水性有明显差异。④结论　 1997～ 2 0 0 0年华东地区HIV 1流行呈现多个型别共同、混合流行的特征 ,膜蛋白PND的八肽基因序列呈现多样性变化 ,新的HIV 1膜蛋白双V3区变异株的发现可能与病毒重组。; 王斌钱冬萌傅继华鲁晓晴闫志勇方荣吴虹; 关键词：HIV-1 ENV DNA 氨基酸序列

1997-2002年山东省HIV-1流行株env基因序列测定和亚型分析被引量：1: 2005年; ①目的对1997～2002年间山东地区HIV-1各亚型分离株进行基因分型,了解各亚型的分布及其与传播途径的相互关系.②方法采集1997～2002年间山东省38例HIV-1感染者的抗凝全血标本,用巢式PCR技术扩增外周血单个核细胞中HIV-1前病毒env基因C2～V3区,并对C2～V3区的核苷酸序列进行测定和分析.③结果山东省38例HIV-1分离株中存在亚型和重组毒株4种(A、B、C、A/E).其中A亚型5株,B亚型22株(其中包括泰国B亚型11株),C亚型10株,A/E重组毒株1株.各亚型内的离散率有差异,A、B、C亚型内基因离散率分别为1.5%、8.6%和1.9%.在性乱人群和静脉吸毒人群中以A亚型和C亚型为主;在职业献血和不安全血制品使用者中以B亚型为主.④结论 1997～2002年间山东省HIV-1流行特点为A、B、C亚型共存,伴有重组毒株;传播途径复杂,基因变异较大,B亚型仍然为主要流行株.; 宋旭霞钱冬萌傅继华方荣吴虹王斌; 关键词：HIV-1 基因 ENV

云南瑞丽县IDUs人群HIV-1感染者毒株env基因C2-V3区序列的测定被引量：4: 2000年; 1目的　了解云南瑞丽县 1994年以后静脉药瘾 (IDU s)人群 HIV- 1感染者分离株的分子流行病学特征。 2方法　运用套式聚合酶链反应扩增 HIV- 1env基因 C2 - V3区 ,将扩增片段纯化后与 p EGM5 zf(+)载体连接 ,再克隆入大肠杆菌 ,提取重组质粒 ,使用 DNA自动测序仪进行序列测定。 3结果　与此地区 1989年分子流行病学资料比较 ,V3区变异不显著 ,未发现新的亚型与毒株。 4结论　 5株 HIV- 1毒株进化关系非常密切 ,这一地区IDUs人群中 HIV- 1的流行毒株仍以美欧 HIV- 1SF2株为主。; 方荣王斌路永波宋旭霞邵济钧; 关键词：HIV-1 艾滋病 ENV基因 IDUS

HIV1膜蛋白PND编码基因自然变异株的发现: 2001年; 目的　对 1例来自华东地区HIV1分离株 (WWBH7)的前病毒env基因C2 V3区进行序列分析。方法　以HIV1感染者外周血单个核细胞基因组为模板进行套式PCR扩增HIV1env基因C2 V3区片段 ,将此扩增产物插入T Vector,酶切鉴定重组质粒 ,使用ABI737自动DNA序列测定仪测定序列并用DNASIS软件进行分析。结果　DNA序列资料显示该毒株属于HIV1B亚型衍生株。但与HIV1B亚型的标准株如SF2株相比 ,该HIV1毒株的env基因V3区下游有 192bp的重复插入突变 ,使得该毒株的膜蛋白PND编码基因呈现双V3区的变异 ,该段DNA序列已登录于GenBank(AF2 2 0 2 45 )。结论　该分离株是; 王斌傅继华吴虹刘传新钱冬萌方荣; 关键词：自然突变 DNA序列

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方荣