曹洪玉
- 作品数：133 被引量：263H指数：8
- 供职机构：大连大学更多>>
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- 相关领域：理学生物学医药卫生化学工程更多>>
- 多光谱法与分子对接模型研究西维来司钠与弹性蛋白酶的相互作用
- 2022年
- 采用多种光谱法及分子对接技术对西维来司钠(ONO-5046)与弹性蛋白酶的相互作用进行研究,利用荧光光谱法判断出ONO-5046的加入对弹性蛋白酶产生荧光猝灭作用,与弹性蛋白酶相互作用的猝灭类型为静态猝灭,ONO-5046与弹性蛋白酶以结合比为1∶1的比例构成复合物。经计算,ONO-5046与弹性蛋白酶体系的ΔH<0和ΔS<0,判断出氢键与范德华力为其主要结合作用力,由ΔG<0可知该反应可以自发进行。同步荧光光谱法、紫外-可见分光光谱法和圆二色光谱法探讨了ONO-5046的加入使弹性蛋白酶中氨基酸残基周围环境的疏水性降低,二级结构发生改变,α-螺旋结构的比例减少,无规则卷曲的比例增多;分子对接模拟结果表明:在与弹性蛋白酶相互作用过程中,ONO-5046分子骨架上的多个酰基结构、2个苯环以及较长的共轭结构能提供氢键与范德华力的作用位点,同时,端碳上的3个甲基结构有利于疏水作用,ONO-5046上的氧负离子与弹性蛋白酶的精氨酸存在盐桥作用。以上结果表明,ONO-5046与弹性蛋白酶的结合存在多种作用力,能形成稳定的复合物,从而抑制了弹性蛋白酶的活性。
- 尹广婷周雪健姚红柳付金凤曹洪玉郑学仿苏丽红
- 关键词：西维来司钠弹性蛋白酶
- 一种光降解废水中抗生素的装置
- 本发明公开了一种光降解废水中抗生素的装置，属于废水处理设备技术领域。本发明包括顺次连通的第一降解池、第二降解池、MB R反应池和净化池，所述第一降解池和所述第二降解池的主体均为透明材质。所述第一降解池内设有至少一根弯曲的...
- 徐丽丽陆清晨李欣严俊杰曹洪玉
- G蛋白偶联受体109B苯甲酸类激动剂三维定量构效关系被引量：2
- 2016年
- 5-N,N-二取代5-氨基吡唑-3-羧酸、3-硝基-4-氨基苯甲酸和6-氨基烟酸类化合物是G蛋白偶联受体109B(GPR109B)潜在生物活性药物。本实验采用比较分子力场分析法(Co MFA)和比较分子相似性指数分析法(Co MSIA)分别建立46个GPR109B激动剂分子的3D-QSAR模型,确定此类G蛋白偶联受体激动剂的分子结构与生物活性之间的定量关系。Co MFA模型的训练集抽一法交叉验证系数q^2=0.472,非交叉验证系数r^2=0.92,标准偏差SE=0.212;CoMSIA模型的训练集抽一法交叉验证系数q^2=0.498,非交叉验证系数r^2=0.803,标准偏差SE=0.332。两个3D-QSAR模型预测数值与实验数据基本一致,显示模型具有较好的预测能力。本实验根据CoMFA和CoMSIA模型所提供的立体场、静电场、氢键给体场等信息进一步提出改善此类激动剂生物活性的药物设计思路。
- 于柯楠吴玲曹洪玉
- 关键词：三维定量构效关系
- 光激发四苯基卟啉钴氧化还原反应机理研究
- 2021年
- 金属卟啉在光激发条件下会呈现出重要催化特性和光学性质。四苯基卟啉亚钴(Co^(Ⅱ) TPP)性质稳定,难以通过强氧化剂氧化至四苯基卟啉钴(CoⅢTPP)。本文分别利用全波长氙灯与355nm激光脉冲诱导Co^(Ⅱ) TPP,探究其分子内的氧化还原过程。研究发现,Co^(Ⅱ) TPP的Soret带最大吸收峰随光照时长的递增出现红移,且吸收强度呈现先下降后上升的趋势,最大吸收峰位置由415nm逐渐红移至433nm,其Q带最大吸收峰位置由532nm逐渐红移至545nm。两种光源诱导Co^(Ⅱ) TPP均出现稳态吸光度的降低,分子内的活性中心钴离子由Co2+氧化到Co3+。咪唑使得Co^(Ⅱ) TPP受光诱导后更易出现稳态吸收峰红移。Co^(Ⅱ) TPP的瞬态吸收光谱有3个瞬态吸收峰,激光激发含咪唑的Co^(Ⅱ) TPP溶液仅在396nm出现单个瞬态吸收峰。数据表明光激发时,电子从卟啉的π成键分子轨道向具有配体特征的π*反键分子轨道迁移,发生金属对配体的电荷迁移,生成稳定的高价态CoⅢ。
- 曹洪玉王梦妍马子辉唐乾唐乾郑学仿
- 关键词：紫外可见光谱瞬态吸收光谱
- 一种酸性离子液体[PPh<Sub>3</Sub>][TfOH]<Sub>2</Sub>催化制备环己基苯的方法
- 本发明涉及一种酸性离子液体[PPh<Sub>3</Sub>][TfOH]<Sub>2</Sub>催化制备环己基苯的方法。该方法具体为：三苯基膦：三氟甲磺酸摩尔比为1:2的比例合成[PPh<Sub>3</Sub>][TfO...
- 王爱玲张腾王肖肖郑学仿曹洪玉唐乾
- 文献传递
- 性质实验与多媒体仿真
- 2007年
- 根据部分元素化学性质实验的特点,本着绿色化学的要求——化学试剂零投入、废弃物零排放,将多媒体的教学方式引入实验课.
- 张晔曹洪玉
- 关键词：绿色化学多媒体
- 用于光谱实验给比色皿中溶液通气的装置
- 用于光谱实验给比色皿中溶液通气的装置，包括：盒体、盖体、通气导管、水循环槽、比色皿槽腔、冷热循环一体泵进水导管、冷热循环一体泵出水导管；所述盒体顶部为开口结构，盖体盖合在盒体上，在盒体内部设有水循环槽，所述比色皿槽腔置于...
- 唐乾宫婷婷曹洪玉郑学仿金晓军史飞
- 文献传递
- “4-N in”卟啉及N-/Neo-Confused卟啉结构和吸收光谱性质的理论研究被引量：3
- 2018年
- "4-N in"卟啉异构体和N-/Neo-Confused卟啉异构体(N-Confused Porphyrin,NCP;Neo-Confused Porphyrin,NECP)是重要的新型光化学材料,因具有特殊的光电特性在各个领域都有广泛的应用。本文利用密度泛函理论(DFT)研究两类卟啉异构体及其金属Zn配合物的几何结构和分子轨道能级。利用GIAO理论所得无配位异构体的核独立化学位移值(NICS)表明这些卟啉异构体具有相近的芳香性质。采用TD-DFT计算了真空和溶剂场极化连续模型下异构体及配合物的吸收光谱,数据表明"4-N in"异构体及其配合物的吸收峰位置都分别较为接近,而与NCP和NECP有较大的差异。金属Zn的配位使NCP和NECP的Q带进一步发生红移,NCP和NECP及其各自的Zn配合物作为光敏材料具有较好的前景。
- 曹洪玉金晓军张文琼唐乾王爱玲郑学仿
- 关键词：核独立化学位移密度泛函含时密度泛函
- 激光诱导游离半胱氨酸对血红蛋白反应动力学的影响及机理
- 2018年
- 血红蛋白(hemoglobin,Hb)是具有环状共轭结构的呼吸蛋白,可以吸收特定波长的光,通过血红素辅基的结构变化,进而影响血红蛋白生物功能的表达。研究中发现,紫外区波长光照射血红蛋白能够引起其结构发生一定的变化,光照实验中加入游离半胱氨酸有助于高铁血红蛋白(methemoglobin,metHb)结构的稳定。266nm光照后高铁血红蛋白、去氧血红蛋白(deoxyhemoglobin,deoxyHb)、氧合血红蛋白(oxyhemoglobin,HbO2)和碳氧血红蛋白(carboxyhemoglobin,HbCO)均被激发至各自相应激发态,其Soret带谱峰衰减至基态的时间大致相同;加入游离半胱氨酸后,半胱氨酸与各激发态铁卟啉发生电子传递,在直接和间接地进行了电子传递后,激发态铁卟啉衰减时间发生变化,metHb、HbO2和HbCO衰减时间明显延长,但deoxyHb变化相对较小。对瞬态吸收光谱、动力学曲线和紫外-可见吸收光谱综合分析可知,4种形态血红蛋白被光激发至各自激发态后,铁卟啉均反应形成具有一空位的六配位平面结构状态。
- 曹洪玉史飞唐乾王立皓郑学仿
- 关键词：血红蛋白光诱导激光闪光光解半胱氨酸电子传递
- GPR109A同源建模及其与吡唑类激动剂对接模拟
- 2016年
- 烟酸受体G偶联蛋白受体109A(GPR109A)是心血管疾病和脂代谢紊乱等疾病治疗的重要靶点蛋白,但因属于膜蛋白,其晶体结构一直未被解析,给药物设计带来极大挑战。本文基于鼠类PUMA-G晶体结构,采用同源模建的方法构建GPR109A蛋白三维结构,运用Ramachandran Plot和Profile-3D对模型进行评估,通过加力场,加膜,loop等方法对模型进行优化,得到蛋白最优模型,并计算分析得到其12个可能的活性位点。利用SYBYL-X2软件构建GPR109A的吡唑类激动剂药物小分子,通过最陡下降法和共轭梯度法得到药物小分子的最稳定构象。用Libdock方法将激动剂对接至蛋白各活性位点,获得二者作用模型。我们分析各活性位点氨基酸分布情况,并以3-羧酸5-甲基吡唑为参考分子探讨药物与各蛋白活性位点相互作用情况。本实验对设计G偶联蛋白受体109A吡唑类激动剂有理论指导意义。
- 杨帆张艺鹏黄佳琪曹洪玉
- 关键词：同源建模活性位点分子对接
