赵馨
- 作品数：11 被引量：99H指数：3
- 供职机构：军事医学科学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金北京市自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
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- 汇合处理样品提高蛋白质组双向电泳的重复性
- 双向电泳的重复性是蛋白质组技术平台的关键指标之一。本文考察汇合处理对蛋白质样品双向电泳重复性的影响,重复性指标包括蛋白斑点匹配率以及蛋白斑点数、实验等电点、表观分子量和蛋白量的相对标准差(变异系数)等。三只体重和年龄接近...
- 丁勤学谢荣光郭尧君赵馨何大澄刘少君
- 文献传递
- 结合珠蛋白和铁蛋白在急性肺栓塞中的表达变化被引量：3
- 2006年
- 目的研究急性肺栓塞时结合珠蛋白和铁蛋白的表达变化。方法采用RT-PCR方法检测急性肺栓塞大鼠模型肺组织中结合珠蛋白和铁蛋白mRNA水平的变化;采用Westernblot技术检测急性肺栓塞大鼠血清中结合珠蛋白和铁蛋白蛋白水平的变化;采用免疫散射比浊法测定58位肺栓塞/深静脉血栓(PE/DVT)患者和40例对照(对照组)血清中的结合珠蛋白和铁蛋白的蛋白水平。结果急性肺栓塞后大鼠肺组织中结合珠蛋白和铁蛋白mRNA水平逐渐升高,血清中结合珠蛋白和铁蛋白的蛋白水平也逐渐升高。PE/DVT病人血清中结合珠蛋白的蛋白浓度为2063·48±425·38mg/L,对照组为824·37±235·24mg/L(P<0·01);PE/DVT患者血清中铁蛋白的蛋白浓度为554·43±136·18μg/L,对照组为79·42±31·57μg/L(P<0·01)。结论急性肺栓塞后肺组织细胞增加了结合珠蛋白和铁蛋白的合成,导致这两种蛋白的血清水平明显升高,表明结合珠蛋白和铁蛋白对PE/DVT病人具有一定的诊断价值。
- 李圣青任新玲刘阿茹简文戚好文阙海萍张晓君赵馨潘刚杨树广刘少君
- 关键词：肺栓塞铁蛋白印迹法逆转录聚合酶链反应
- 大鼠栓塞肺组织的比较蛋白质组学研究被引量：1
- 2007年
- 目的研究大鼠血栓栓塞肺组织和正常肺组织的蛋白差异表达。方法采用血栓颈静脉注入法制备大鼠急性肺栓塞模型,采用双向电泳技术(2-DE)找出差异蛋白,用MALDI-TOF技术和生物信息学技术鉴定差异蛋白,并对部分差异表达蛋白采用Western blot技术作进一步验证。结果肺组织蛋白的2-DE胶银染可分离出2800多个点,考染可达到2400个点以上。经图像分析得到的46个差异表达蛋白中有32个蛋白得到鉴定。对部分差异蛋白采用Western blot方法在蛋白水平的验证结果与2-DE结果基本相符。结论采用比较蛋白质组学的方法可以发现大量栓塞肺组织的差异表达蛋白,这些差异表达蛋白将为研究肺栓塞发病的分子机制和病理生理学研究提供重要的线索和依据。
- 李圣青戚好文赵峰阙海萍张晓君赵馨潘刚杨树广刘少君
- 关键词：肺栓塞蛋白质组学双向电泳计算生物学
- 大鼠栓塞肺组织中代谢相关酶类的表达变化被引量：1
- 2006年
- 目的研究大鼠急性肺栓塞模型肺组织中部分代谢相关酶类的表达变化。方法建立大鼠急性肺栓塞模型,分别在急性肺栓塞后1、8、244、8 h提取肺组织的总RNA和总蛋白,以正常组为对照,采取半定量RT-PCR的方法研究3-磷酸甘油醛脱氢酶(GAPDH)、儿苯酚胺氧位甲基转移酶(COMT)、衰老标记蛋白-30(SMP-30)、3-α-羟类固醇脱氢酶(SDH)和延胡索酰乙酰乙酸水解酶(FAH)在mRNA水平的表达变化;采用Western-blot方法进一步验证GAP-DH和COMT在蛋白水平的表达变化。结果大鼠急性肺栓塞后在不同的时间点,GAPDH、COMT、SMP-30、SDH和FAH的mRNA水平均逐渐减低,GAPDH和COMT在蛋白水平的表达也出现逐渐减低现象。结论大鼠急性肺栓塞后肺组织内大多数上述代谢相关蛋白均出现表达减低的现象。研究这些酶类的生物学功能和表达变化,将为我们阐明急性肺栓塞病理生理变化的分子机制奠定基础。
- 李圣青刘阿茹遆新宇阙海萍杨树广张晓君赵馨潘刚刘少君
- 关键词：急性肺栓塞GAPDHCOMTSDH
- 海马注射淀粉样蛋白β大鼠与正常大鼠脑蛋白质组双向电泳图谱比较被引量：2
- 2004年
- 目的比较海马注射淀粉样蛋白β(Aβ)大鼠与正常大鼠脑蛋白质组双向电泳(2-DE)图谱差异,从蛋白质水平初步探索阿尔茨海默病(AD)发病机制。方法以固相pH梯度等电聚焦为第1向,SDS-PAGE垂直电泳为第2向进行2-DE。以图像分析软件ImageMaster 2D-Elite分析电泳图谱。结果海马注射Aβ大鼠与正常大鼠脑组织2-DE图谱分别检出496和491个蛋白点。对2张电泳图进行匹配后,发现有11个蛋白点仅在海马注射Aβ大鼠脑蛋白2-DE图谱中表达,而有6个蛋白点只在正常对照大鼠检测到。部分蛋白在2组大鼠脑组织中含量发生了明显变化。结论初步建立了AD动物模型比较蛋白质组学的技术方法;差异点的发现为深入理解AD发病机制及研发新药提供了有益的线索。
- 杨国锋王鲁宁赵馨聂永慧
- 关键词：双向电泳图谱阿尔茨海默病
- 老年和成年APP转基因小鼠脑蛋白质组2-DE图谱比较被引量：1
- 2003年
- 目的:比较老年和成年APP转基因小鼠脑蛋白质组双向电泳(2-DE)图谱差异,从蛋白质水平初步探索老年痴呆发病机制。方法:以固相pH梯度等电聚焦(IPG)为第一向,SDS-PAGE垂直电泳为第二向进行2-DE。图象分析软件Imagemaster 2D Elite分析电泳图谱。结果:老年和成年转基因小鼠脑组织2-DE图谱分别检出964和947个蛋白点。对两张电泳图进行匹配后,发现有17个蛋白点仅在老年转基因小鼠脑蛋白2-DE图谱检测到表达,而有5个蛋白点只在成年转基因小鼠检测到。部分蛋白在2组小鼠脑组织中含量发生了明显变化。结论:初步建立了AD动物模型差异表达蛋白质组学的技术方法;差异点的发现为研究AD机理及治疗AD提供了有益的线索。
- 杨国锋王鲁宁赵馨
- 关键词：APP转基因阿尔茨海默病
- 肽质量指纹图谱中实验因素引起的氨基酸修饰以及相应肽段的质量变化被引量：2
- 2006年
- 目的:肽质量指纹图谱是蛋白质组研究中最重要的蛋白鉴定手段之一,而氨基酸残基的化学修饰会导致图谱中肽质量的改变。本文对实验性因素可能引起的这种质量改变进行了较为系统的观察和小结。方法:本文分析了多个标准蛋白基于SDS-PAGE分离的肽质量指纹图谱的实验结果,综合报道由各种实验因素引起的氨基酸残基体外化学修饰以及相应的肽质量变化。结果:这些化学修饰至少包括:①半胱氨酸残基丙烯酰胺加合物生成或乙酰基烷基化修饰,相应的肽段质量数分别增加71.04和57.02;②甲硫氨酸残基的氧化修饰,相应肽段质量数增加15.99(单甲硫氨酸氧化)或其倍数(多甲硫氨酸氧化);③酸性氨基酸残基的成盐反应,相应肽段质量数增加21.98(加钠盐)或37.95(加钾盐);④酸性氨基酸残基的酯化反应,相应肽段质量数增加14.03(甲醇固定)或28.03(乙醇固定);⑤碱性氨基酸(赖氨酸)残基与甲醛发生西佛碱反应,相应肽段质量数增加27.99。以上各种氨基酸的体外修饰,以甲硫氨酸的氧化修饰最为常见;酸性氨基酸的酯化反应通常发生在蛋白固定步骤;碱性氨基酸(赖氨酸)的西佛碱反应是由于蛋白质银染时增色剂甲醛的引入。特别注意的是,某些肽段可以同时发生多种化学修饰,使得肽质量指纹图谱的解析复杂化。结论:以上实验因素引起的氨基酸修饰以及相应的肽质量变化在蛋白质数据库检索和蛋白质鉴定时必须加以考虑。
- 丁勤学熊少祥刘进赵馨阙海萍刘少君
- 关键词：肽质量指纹图谱化学修饰体外
- 肺组织灌注前后双向电泳的比较被引量：12
- 2006年
- 目的寻找更加有效的双向电泳方法以展示肺组织蛋白。方法取6只Wistar大鼠随机分为对照组和灌注组,用丙酮/三氯醋酸法提取肺组织蛋白并进行双向电泳分离,将2-D胶银染后用ImageScanner扫描仪扫描,采用ImageMaster 2-D Elite 3.10软件进行图象分析。结果对照组2-D胶的蛋白点计数为1 095±5,灌注组蛋白点计数为1 569±10。在分子质量30-70 ku范围内,灌注组的蛋白点计数显著高于对照组(P<0.01),在其他分子质量范围内二者蛋白点计数无显著性差异。在pH值5-8、9-10范围内,灌注组的蛋白点计数显著高于对照组(P<0.01),在其他pH值范围内二者蛋白点计数无显著性差异。结论生理盐水灌注法可显著减少肺组织中的血液蛋白成分,使得肺组织蛋白可以更好的在2-D胶上展示。
- 李圣青赵峰戚好文张晓君赵馨潘刚吴哲王宇阙海萍刘少君
- 关键词：双向电泳肺组织灌注
- 玄参治疗大鼠内毒素血症的血清蛋白质组变化的初步研究被引量：22
- 2004年
- 目的 :研究玄参治疗大鼠内毒素血症的血清蛋白质组变化。方法 :用双向电泳 (2DE)分析正常组、内毒素 (lipopolysaccharide ,LPS ;静脉注射 )组、玄参 (灌胃给药 )组、LPS(静脉注射 ) +玄参 (灌胃给药 )组之间的血清蛋白质组表达差异。结果 :①LPS致内毒素血症大鼠的血清在 2DE胶上 16个蛋白点 (xPr)出现非常明显的含量变化 ,与正常组比较 ,LPS组的xPr16 ,xPr19的点容量值均极显著降低 ,xPr1,xPr2 ,xPr3,xPr4 ,xPr5 ,xPr6 ,xPr7,xPr8,xPr9,xPr11,xPr12 ,xPr14 ,xPr18,xPr2 3的点容量值均极显著增高。②LPS +玄参组与LPS组比较 ,LPS引起增高的xPr1,xPr6 ,xPr7,xPr8,xPr9,xPr11,xPr12 ,xPr14 ,xPr18,xPr2 3的点容量值均显著降低。玄参在xPr1,xPr8,xPr11,xPr12 ,xPr18均表现对LPS显著的交互作用。LPS +玄参组与正常组比较 ,其中xPr8,xPr9,xPr11,xPr12 ,xPr14 ,xPr2 3蛋白点已被明显调节到正常状态 ,但是xPr18的点容量值显著低于正常组 ,xPr1,xPr6 ,xPr7的点容量值仍显著高于正常组。③玄参与LPS两因素对xPr5 ,xPr10 ,xPr19,xPr2 0 ,xPr2 1,xPr2 2均有明显的交互作用。④在玄参组 ,xPr13,xPr2 0 ,xPr2 1,xPr2 2的点容量值均比正常组显著增高 ,xPr10 ,xPr15的点容量值均比正常组显著降低 ,这
- 谢文光邵宁生马晓昌丁勤学赵馨刘农乐魏钰书王会信陈可冀
- 关键词：LPS玄参内毒素血症血清蛋白质灌胃给药
- 大鼠急性肺栓塞模型中CA3和NHE_1表达的变化
- 2006年
- 目的研究大鼠急性肺栓塞模型肺组织中与酸碱平衡相关的碳酸酐酶3(CA3)和Na+/H+交换器(NHE1)的表达变化。方法建立大鼠急性肺栓塞模型,分别在急性肺栓塞后1、8、24和48 h开胸取出肺组织,然后提取肺组织的总RNA和总蛋白,以正常组为对照,采取半定量RT-PCR的方法研究CA3和NHE1在mRNA水平表达的变化;采用western-b lot方法进一步验证CA3和NHE1在蛋白水平表达的变化;同时采用免疫组织化学的方法检测大鼠肺组织中NHE1在肺栓塞前后表达的变化。结果在大鼠急性肺栓塞后的不同时间点,CA3的mRNA水平和蛋白水平均逐渐降低,而NHE1在mRNA水平和蛋白水平的表达都出现逐渐升高现象。免疫组化研究表明NHE1主要分布在支气管黏膜上皮和细支气管黏膜上皮的胞浆内,急性肺栓塞后NHE1在上皮细胞内的表达明显升高。结论大鼠急性肺栓塞后肺组织内CA3的表达降低,NHE1的表达升高,这一现象可能与机体的酸碱平衡调节相关。
- 李圣青遆新宇刘阿茹阙海萍杨树广张晓君赵馨潘刚刘少君
- 关键词：蛋白印迹
