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CYP2C9酶与Warfarin结合模型的立体选择性理论研究被引量：6: 2014年; 对CYP2C9酶与S-Warfarin复合物的晶体结构进行分子对接、分子动力学模拟、通道分析及结合自由能计算,发现原晶体结构中的结合模式为'亚稳态',提出了CYP2C9与S-Warfarin结合的可催化模式;比较了CYP2C9与S-和R-Warfarin结合的异同,确定了在结合过程中起重要作用的锚定氨基酸残基,尤其是位于活性位点区域的苯丙氨酸簇.在结合过程中这些残基通过芳香环的移动对稳定底物的结合模式起到至关重要的作用,阐明了该酶呈现相关底物选择性的原因.对于CYP2C9与底物对接模式及立体选择性的研究有助于在分子层面上理解特异性底物与酶的结合特点,为潜在的药物设计提供了合理可信的理论依据.; 吴云剑崔颖璐郑清川张红星; 关键词：分子对接分子动力学模拟细胞色素P450

分子动力学模拟在几类重要蛋白研究中的应用: 计算机科学技术的进步，为多个学科发展提供了无限可能。在生物、化学、物理等多个领域中，分子动力学模拟技术随着计算机计算能力的飞速发展，展现出愈发强大的能力。借助分子动力学模拟技术，我们一方面能够在分子层面观察到蛋白结构变化...; 吴云剑; 关键词：磷霉素细胞色素分子动力学模拟分子对接主成份分析; 文献传递

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吴云剑