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熊金波: 作品数：56 被引量：130H指数：7; 供职机构：宁波大学更多>>; 发文基金：国家高技术研究发展计划浙江省自然科学基金浙江省重中之重学科开放基金更多>>; 相关领域：农业科学环境科学与工程轻工技术与工程生物学更多>>

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肠道菌群对凡纳滨对虾健康的指示作用被引量：40: 2016年; 高密度、集约化的凡纳滨对虾养殖常伴随病害的发生,但还不能确定能否利用对虾的肠道细菌差异来指示其健康状况.因此,我们分别采集了健康和发病养殖塘水样和对虾样品,利用Illumina Mi Seq测序技术测定细菌16S rRNA基因,研究细菌的群落结构和多样性.结果表明:细菌群落结构变异主要受水体中亚硝酸盐、叶绿素a和磷酸盐的影响.发病对虾肠道细菌群落多样性显著低于健康对虾.在健康和发病对虾肠道细菌中,运用响应比分析,我们筛选到了28个丰度差异显著的分类操作单元(OTUs),其中来源于放线菌纲、黄杆菌纲和芽孢杆菌纲的OTUs丰度在发病对虾肠道中显著降低,而隶属于梭状芽孢杆菌纲的OTUs丰度在发病对虾肠道显著增加.此外,我们挑选出61个指示物种,主要属于拟杆菌门、变形菌门、厚壁菌门、浮霉菌门和放线菌门.值得注意的是,它们能够区分样品的来源(水样或虾肠道)和健康状态.本研究为对虾病害预测和益生菌开发提供了理论依据.; 吴金凤熊金波王欣裘钱玲琳郑嘉来张德民; 关键词：对虾养殖肠道微生物病害预测指示物种

元组学技术开启水产微生物制剂新时代?: 微生物菌剂在水产养殖中的应用已有数十年的历史。时至今日，尽管品种众多，但产品效果不稳定，多数情况是真假难辨，因而，没有高质量的品牌产品脱颖而出，生产企业难以上规模。益生菌剂效果难以认定的一个重要原因是对微生物制剂的作用过...; 张德民熊金波; 关键词：微生物群落微生物制剂水产养殖病害控制

健康与患病凡纳滨对虾肠道菌群结构及功能差异研究被引量：39: 2018年; 为探究病害发生后健康与患病凡纳滨对虾肠道菌群结构和功能的差异,并筛选肠道指示菌群来评估宿主健康状况,评价凡纳滨对虾肠道菌落的功能冗余性。实验采集健康和患病凡纳滨对虾样品,通过Illumina高通量测序技术测定肠道菌群组成,并利用PICRUSt进行功能预测,以此比较健康与患病凡纳滨对虾肠道微生物的群落结构和功能差异,并预测功能与群落组成的相关性。结果显示,病害的发生伴随着肠道菌群结构的显著变化,而多样性无显著差异。与健康凡纳滨对虾肠道细菌组成相比,患病凡纳滨对虾肠道中放线菌门(Actinobacteria)、浮霉菌门(Planctomycetes)和疣微菌门(Verrucomicrobia)相对丰度降低,而γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes)增加。同时,筛选出16个指示细菌科,能够很好地指示宿主健康状况。与健康组相比,患病凡纳滨对虾中参与弧菌侵染的过程显著增加,而溶酶体和过氧化物酶等免疫功能代谢过程显著减弱。此外,肠道微生物群落结构与功能组成呈显著正相关,表明凡纳滨对虾肠道菌群组成具有较低的功能冗余性。研究表明,健康与患病凡纳滨对虾肠道菌群结构存在显著差异,并且由细菌介导的功能随之发生改变,能够用指示微生物评估宿主健康状况。; 郁维娜戴文芳陶震陶震; 关键词：凡纳滨对虾肠道菌群

三门湾近海有机污染对浮游细菌群落的影响被引量：12: 2017年; 近海污染问题日趋严重,因此亟需评价污染对海洋环境造成的潜在影响.微生物作为对环境变化的首要响应者,可能作为评价污染水平的指示生物.为此,本文采集三门湾和邻近鱼山保护区共21个站点的表层海水,利用Illumina技术测定细菌16S rRNA基因,对比研究有机污染对浮游细菌群落的影响.三门湾的有机污染(A)为4.57±2.41,显著(P<0.001)高于鱼山保护区0.43±0.74.三门湾和鱼山保护区的浮游细菌多样性和群落结构差异显著,其中三门湾水域的放线菌门(Actinobacteria)、α-变形菌纲(α-Proteobacteria)、β-变形菌纲(β-Proteobacteria)、SAR406的相对丰度显著高于鱼山保护区,而拟杆菌门(Bacteroidetes)、蓝细菌门(Cyanobacteria)、浮霉菌门(Planctomycetes)的相对丰度低于鱼山保护区.多元回归树分析(multivariate regression tree,MRT)发现浮游细菌多样性主要受pH、有机污染和叶绿素a(Chl-a)的影响,分别控制了27.7%、15.6%和6.7%的多样性变异.冗余分析(redundancy analysis)结果表明驱动细菌群落变异环境因子为有机污染、pH和盐度(salinity),共解释了14.8%的群落变异.同时,空间距离与细菌群落组成显著相关,解释了4.42%的变异,表明浮游细菌的空间分布不是随机的.此外,本研究筛选到与有机污染状况显著相关的23个细菌科,各科相对丰度的变化与其已知的生态功能特征相吻合,因此可以作为潜在的有机污染指示种群.本实验结果表明近海有机污染显著地改变了浮游细菌群落结构,特别是潜在病原菌丰度的增加;此外,筛选到敏感指示种群用于评估有机污染程度.; 戴文芳郭永豪郁维娜熊金波

益生菌地衣芽孢杆菌治疗鸡腹泻机理初探被引量：4: 2015年; 目的:探讨益生菌地衣芽孢杆菌饲喂鸡腹泻的治疗效果以及分子机理。方法:从养鸡场土壤中选择性分离芽孢杆菌,通过优化条件提高产生芽孢的比例;利用芽孢和大米混合后饲喂腹泻鸡,通过克隆测序分析腹泻鸡肠道微生物群落在饲喂前后的差异。结果:我们分离到一株地衣芽孢杆菌,通过优化条件使产芽孢的比例提高到60%。利用芽孢饲喂一周后能够有效地治疗鸡腹泻。分析鸡肠道微生物群落发现:鸡腹泻后其肠道细菌群落的多样性和均匀度降低。造成腹泻鸡肠道主要菌群为动胶杆菌(Zoogloea sp.);经芽孢饲喂后,主要菌群转变为拟杆菌(Bacteroides sp.),与健康鸡的肠道微生物主要菌群相似。结论:我们筛选到一株可能治疗鸡腹泻的芽孢杆菌,通过优化培养条件能够提高其产芽孢比例;腹泻鸡经芽孢饲喂后,其肠道中致病菌被益生菌所代替,形成正常的肠微生物菌群而恢复健康。; 诸文超刘勇熊金波吴金凤张德民; 关键词：益生菌肠道微生物克隆文库

筛选敏感的细菌种群指示对虾的健康状况: 对虾养殖由传统的低密度混养到目前高密度的集约化养殖,导致病害频繁,而目前又没有特效的治疗方法.因此,在对虾养殖过程中仍是'以防为主,防重于治'的原则.目前认为疾病的发生是养殖环境—微生物群落—养殖动物相互作用的结果,其中...; 熊金波张德民; 关键词：肠道微生物指示生物

用于检测哈维弧菌群的基因芯片及其使用方法: 本发明公开了用于检测哈维弧菌群的基因芯片及其使用方法，特点是芯片载体上固载有用于检测溶藻弧菌、坎氏弧菌、哈维氏弧菌、需钠弧菌、副溶血弧菌和轮虫弧菌的核苷酸探针，各个弧菌的探针均使用<i>toxR</i&...; 张德民郑嘉来唐姝闫永伟熊金波张化俊; 文献传递

海洋微生物群落信息挖掘与海洋生态环境评价: 应用高通量测序研究了浙北近岸海域微生物群落分布特征及其对近岸主要污染物的响应，一些主要结果如下：1)基于断面和区域研究，发现浙北近岸海域的微生物群落的地理分布受到空间构建的环境梯度的高度影响；2)季节和网箱养殖均能显著影...; 张德民朱建林王凯熊金波叶仙森; 关键词：细菌群落结构近岸海域

一种黄花油点草组织培养与快速繁殖的方法: 本发明公开了一种黄花油点草组织培养与快速繁殖的方法，依次包括以下步骤1）外植体的消毒：剪取黄花油点草茎段，清洗后消毒，接种到添加植物生长调节剂的MS培养基中；2）腋芽的诱导；3)丛生芽的诱导；4）不定芽的增殖和壮苗；5）...; 熊金波周伟黄文娟张进杰; 文献传递

土塘与循环养殖系统细菌群落结构比较研究: 细菌群落对环境的响应对评价养殖生态系统健康具有重要意义.本研究利用454焦磷酸测序技术,分析凡纳滨对虾土塘养殖模式水样和循环养殖系统水样及其生物膜中的细菌群落结构.结果表明:循环养殖系统中水样多样性高于土塘,而生物膜多样...; 裘钱玲琳徐如卫王一农熊金波王凯朱建林张德民; 关键词：凡纳滨对虾循环养殖系统细菌群落

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