殷倩倩
- 作品数：5 被引量：6H指数：1
- 供职机构：中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家科技重大专项艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 不同治疗效果的艾滋病患者抗病毒治疗前HIV-1 gp120准种特征差异被引量：1
- 2017年
- 目的探讨HIV-1 gpl20准种在不同治疗效果的艾滋病患者抗病毒治疗前的特征差异。方法回顾性收集治疗方案为AZT＋NVP＋3TC的艾滋病患者在抗病毒治疗前的血浆样本，包括病毒抑制（vs）组12例，治疗失败（TF）组12例。采用单基因组扩增技术获得gp120准种序列，分析比较遗传多样性、氨基酸长度、潜在糖基化位点及特征性氨基酸的特点。结果本研究共获得gpl20序列365条序列，其中vs组168条（6-20条），TF组197条（7-28条）。TF组的gpl20准种复杂度高于vs组，差异有统计学意义（P=O．003）；TF组的gpl20准种ds及dN中位数均高于vs组（P=0．017；P=0．002）。TF组HIV-1准种gpl20氨基酸长度长于VS组（P=0．001）。TF与vs组的gpl20准种相比共有9个氨基酸位点存在明显差异，多数分布在V1/V2区（6／9，66．6％）。结论不同治疗效果的艾滋病患者治疗前的HIV-1gpl20准种基因特征存在差异，TF组患者来源的HIV-1准种遗传多样性更高。
- 欧阳雅博孔德生王彦王琛李臻鹏焦洋殷倩倩陈德喜马丽英
- 关键词：GP120准种
- 基于深度测序比较HIV-1血浆RNA与前病毒DNA的准种变异
- 目的：通过深度检测血浆HIV-1 病毒RNA 和全血前病毒DNA 的pol 基因序列，分析两者之间耐药准种的变异差异。方法：本研究回顾性的纳入我国河南、安徽地区长期接受抗病毒治疗的既往献血的43 例HIV-1 感染者为研...
- 殷倩倩马丽英
- 关键词：艾滋病病毒
- HIV-1 CRF_BC重组亚型耐药相关新突变位点的复制动力学研究
- 2015年
- 目的研究HIV-1CRF_BC重组亚型逆转录酶（RT）区耐药相关新突变位点1132L、T139K／R对非核苷类逆转录酶抑制剂（NNRTIs）药物敏感性和病毒复制动力的影响。方法通过点突变的方法将HIV-1B亚型感染性克隆PNL4—3RT区的第132位和第139位氨基酸分别突变为亮氨酸（L）和苏氨酸（T）／精氨酸（R），与本课题组已经构建的HIV．．CRF07-BC亚型RT区1132L和T139K／R突变感染性克隆，共同转染293T细胞系进行病毒包装并检验病毒感染性。检测突变病毒对于NNRTIs的药物f依曲韦林（TMC-125）、地拉夫定（DLV）、奈韦拉平（NVP）、依非韦伦（EFV）]敏感性，及其复制动力学特征。结果通过点突变的方法成功构建感染性克隆PNL4-3-RT—1132L、PNL4—3-RT．T139K和PNL4—3-RT—T139R。1132L和T139K／R在B亚型和CRF07-BC亚型中均能降低HIV．1对于NNRTIs的药物敏感性，体现为半数有效浓度（EC50）的升高。在CRF07-BC亚型中，1132L分别使EC50升高2．55、19．35、28．05和6．13倍；T139K分别使EC50升高4．67、3．66、7．35、3．30倍；T139R分别使EC50升高1．82、4．69、25．12和1．89倍；在B亚型中，1132L分别使EC50升高3．91、4．61、6．38和3．56倍；T139K分别使EC50升高3．13、1．78、2．26和2．10倍；T139R分别使EC50升高5．79、3．99、5．78和2．75倍。PNL4．3．RT-132L／139K／139R与野毒株PNL4—3的复制速度相近，且P24均在第11天达到峰值。但与对照株BC—wT相比，BC—RT—1132L／T139R推迟了P24到达峰值的时间，BC—RT-T139R的P24值在第14天达到峰值，BC—RT-I132L在第21天达到峰值，且峰值略低。结论HIV-1CRF_BCRT区新的耐药相关位点1132L和T139K／R在B亚型及CRF07-BC亚型感染性克隆上均可降低病毒对NNRTIs的药物敏感性，1132L在CRF_07BC亚型的感染性克隆上能够降低病毒的复制能力。
- 焦洋黄洋李书明李臻鹏王彦殷倩倩马丽英
- 关键词：HIV-1药物敏感性
- 评价全血DNA二代测序共有序列在人类免疫缺陷病毒优势准种研究中的准确性被引量：1
- 2021年
- 目的评价二代测序共有序列对人类免疫缺陷病毒(HIV)优势准种分析的代表性和准确性。方法共收集29个HIV感染病例的32份全血样本,其中3个病例在随访期间发生耐药,分别采集治疗前和耐药后的两份样本。提取样本DNA,分别用二代测序和一代测序方法测定HIV pol区扩增产物序列。利用软件Sequencher(4.10.1)和Bowtie 2(v2.2.5)处理一代和二代测序数据,并利用自建分析脚本确定二代测序共有序列,利用Mega软件进行聚类分析,比较二代测序共有序列与一代测序序列的差异。结果聚类分析结果表明,90.6%(29/32)来自于同一样本的序列被聚类在同一分支上,平均可信度为95.5%;与一代测序序列结果相比,二代测序平均每个碱基准确率为99.6%,完全不一致位点中碱基转换占81.6%(155/190),数量最多的为鸟嘌呤(G):腺嘌呤(A),共74个(占39.0%、74/190)。结论二代测序共有序列与一代测序序列具有较高的一致性,二代测序共有序列可用于HIV优势准种分析,具有较好的代表性和准确性。
- 张媛媛殷倩倩杜鹏程丁奕博韩俊燕林倩茹马丽英
- 关键词：人类免疫缺陷病毒
- HIV-1感染者血浆病毒RNA与全血前病毒DNA的比较被引量：4
- 2016年
- 目的分析艾滋病病毒1型(HIV-1)DNA在长期抗病毒治疗过程中的动态变化及与血浆RNA的比较。方法纳入2004-2014年接受拉米夫定为主的一线治疗方案的44例HIV-1感染者,通过建立Taqman实时荧光定量法对全血HIV-1DNA进行定量检测,并与血浆RNA病毒载量进行比较。结果治疗前HIV-1DNA与血浆RNA病毒载量呈显著的正相关关系(P=0.003),但是与CD4+T淋巴细胞数之间的相关关系没有统计学差异(P=0.505)。通过分析治疗失败的15人HIV-1DNA的动态变化,发现8人在治疗过程中HIV-1DNA水平的动态变化与血浆RNA病毒载量呈现显著的相关关系(P值均<0.05),其他7人尽管没有统计学差异,但是HIV-1DNA水平与血浆RNA病毒载量呈现相同的变化趋势。结论 HIV-1DNA与血浆RNA病毒载量呈现相关关系,因此,全血HIV-1DNA的检测可作为HIV-1感染者长期疾病进展的辅助监测指标。
- 殷倩倩徐维四焦洋王彦孔德生廖玲洁马丽英
- 关键词：艾滋病病毒1型实时定量聚合酶链反应
