刘菲
- 作品数：12 被引量：22H指数：3
- 供职机构：陕西师范大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：陕西省科学技术研究发展计划项目中国博士后科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学文化科学医药卫生更多>>
- 昆虫酚氧化酶研究进展被引量：1
- 2015年
- 酚氧化酶(phenoloxidase,PO)属于3型含铜蛋白(type-3-copper-containing proteins),该蛋白家族在自然界中广泛存在,并行使着多种多样的生理学重要功能。酚氧化酶是黑色素合成中最重要的酶之一,外源病原物的杀死、血液凝集、抗菌肽表达、伤口愈合和粪便黑化都与酚氧化酶有着密切的关系。酚氧化酶在昆虫体内以酚氧化酶原(prophenoloxidase,PPO)的形式存在。本文主要从酚氧化酶的来源、检测、结构、激活及其功能等方面进行综述,以期为进一步探究酚氧化酶在农业病虫害防治方面的可能应用提供新思路。
- 刘菲
- 关键词：酚氧化酶
- microRNA在系统性红斑狼疮发病中的作用研究进展被引量：1
- 2015年
- 系统性红斑狼疮(SLE)是自身免疫疾病,其发病机制尚未完全阐明。microRNA(以下简称miRNA)是一类保守的非编码小分子RNA,在转录后水平调控基因表达。越来越多的研究表明,miRNA在SLE的发病机制中起重要作用。目前已发现29个与SLE发病有关的miRNA。本文对近年来miRNA参与SLE发病的研究进行了综述。
- 刘菲
- 关键词：系统性红斑狼疮微小RNA甲基化干扰素I型调节T细胞
- 贺氏东栖螽线粒体基因组序列分析(直翅目:螽斯科)被引量：2
- 2017年
- 本研究通过高通量测序方法获得贺氏东栖螽完整的线粒体基因组序列。贺氏东栖螽线粒体基因组序列全长16 146 bp,由13个蛋白质编码基因、22个t RNA基因、2个r RNA基因和1个D-loop区组成,其基因次序和方向与祖先序列相同。为了验证贺氏东栖螽线粒体基因组,并研究螽斯科的系统发育关系,本研究选用包括贺氏东栖螽在内的18个螽斯科物种及2个蝗亚目外群物种的13个蛋白质编码基因和2个rRNA基因序列构建了贝叶斯系统发生树。贺氏东栖螽线粒体基因组序列为直翅目螽斯科的系统发生研究提供了重要的分子基础。
- 刘菲
- 关键词：线粒体基因组直翅目螽斯科
- 四川华绿螽线粒体基因组序列分析被引量：4
- 2016年
- 本研究采用第二代测序技术对四川华绿螽的基因组进行测序,并组装得到了完整的线粒体基因组序列。结果显示:四川华绿螽线粒体基因组序列全长18 051 bp,包含37个基因和1个控制区。与大部分已测序的螽亚目昆虫类似,四川华绿螽线粒体基因组具有通常的基因方向、t RNA结构、相对较低的A+T偏好性。但其基因排列与祖先序列明显不同,具有新的基因排序12S r RNA-t RNA^(Ile)-t RNA^(Met)-nad2-CR-t RNA^(Gln)-t RNA^(Trp)。控制区较长,为3 074 bp,由两部分组成,一部分是与nad2相邻的高A+T偏向性区域(A+T-biased region,ATR),另一部分是与t RNA^(Gln)相邻的串联重复(tandem repeat,TR)区。另外,在t RNA^(Ser(UCN))和nad1之间也有一段长度为123 bp的串联重复序列。基于已测序的线粒体基因组序列,我们对直翅目昆虫线粒体基因组的结构和排序进行了比较分析。本研究为直翅目系统发生关系重建积累了有价值的数据资料。
- 刘菲
- 关键词：线粒体基因组直翅目基因结构基因重排
- 华阴腹露蝗转录组分析被引量：3
- 2016年
- 华阴腹露蝗(Fruhstorferiola huayinensis)隶属于直翅目斑腿蝗科,是一种仅分布在我国的蝗虫。为获得华阴腹露蝗的基因数据,对其进行了转录组测序和分析。总计获得37 840条unigenes,对组装得到的unigenes进行NR、NT、GO、COG、KEGG、Swissprot和Interpro七大功能数据库注释,最终22 477条unigenes获得成功注释,占unigenes总数的59.40%。在华阴腹露蝗转录组中共鉴定出337条编码代谢解毒酶的unigenes,19条编码杀虫剂作用靶标蛋白的unigenes。另外,还检测到4 847个简单重复序列(simple sequence repeats,SSRs)。该转录组测序分析将为进一步研究杀虫剂的抗药性机制和华阴腹露蝗基因功能奠定分子基础。
- 刘菲邱忠营黄原
- 关键词：转录组高通量测序简单重复序列
- 异刺草螽线粒体基因组序列分析被引量：2
- 2017年
- 本研究采用高通量测序技术对异刺草螽的基因组进行测序,并组装得到了完整的线粒体基因组序列。结果显示:异刺草螽线粒体基因组序列全长16 038 bp,包含13个蛋白质编码基因、22个t RNA基因、2个r RNA基因和1个控制区。异刺草螽线粒体基因组的总碱基组成如下:A为37.3%、C为15.4%、G为10.3%、T为36.9%,A+T含量较高,为74.2%。异刺草螽线粒体基因的排列与祖先序列相同,该线粒体基因组序列为直翅目螽斯科的系统发生和进化研究提供了重要的分子基础。
- 刘菲刘菲毛少利石福明石福明
- 关键词：线粒体基因组直翅目螽斯科
- 节肢动物中酚氧化酶家族的组成与进化
- 2016年
- 节肢动物分布广泛,物种数量繁多,有较高衍生价值,因此近年来对节肢动物的研究越来越深入。已有研究者对节肢动物线粒体和核糖体的基因序列进行研究,而近年发现,与DNA序列相比,蛋白质序列的进化式样更为简单,用于探讨系统发育的效果更好。酚氧化酶(phenoloxidase)作为先天免疫的重要成员,有作为研究节肢动物进化的分子标记的可能。本研究对节肢动物酚氧化酶家族的组成进行分析,并构建基于该家族蛋白序列的系统进化树,试图阐明酚氧化酶家族在节肢动物中的进化关系,并为节肢动物的进化研究提供更多理论依据。
- 汪青青刘菲王丹妮
- 关键词：节肢动物酚氧化酶进化
- 疣蝗转录组分析被引量：6
- 2016年
- 疣蝗分布广泛,是一种常见的害虫,主要危害农作物,但分子信息缺乏。我们采用高通量Illumina测序技术和从头组装的方法获得了疣蝗转录组unigenes,并鉴定了天然免疫相关信号通路基因。本研究共获得疣蝗转录组unigenes 86 756个,平均长度为670 bp,N50为1 033 bp。使用六大数据库Nr、Nt、Swiss-Prot、GO、COG和KEGG注释疣蝗转录组unigenes,分别对应有29 627,13 866,23 398,13 474,11 968和21 027个unigenes获得注释。本研究共鉴定319个天然免疫信号通路相关的unigenes,其中,参与Toll通路的unigenes 49个,参与免疫缺失(IMD)通路的unigenes 13个,参与JAK-STAT信号通路的unigenes 117个,参与MAPK-fly通路相关的unigenes 58个,参与黑化(Melanization)通路的unigenes 82个。另外,我们还预测到了9 287个微卫星(SSRs)。本研究为疣蝗基因功能分析、免疫通路相关基因和分子标记的进一步研究提供了分子理论基础。
- 邱忠营刘菲张克瑶黄原
- 关键词：疣蝗转录组天然免疫SSRS
- 云斑车蝗转录组的测序及特征分析
- 2021年
- 云斑车蝗(Gastrimargus marmoratus)隶属于直翅目(Orthoptera)斑翅蝗科(Oedipodidae)飞蝗亚科(Locustinae),是一种地域分布较广的蝗虫。本研究运用第二代测序技术对云斑车蝗进行转录组测序,并对其杀虫剂抗性相关基因和免疫相关基因进行了分析。经测序获得了34436个unigene,并完成功能注释19087个,占全部unigene的55.43%。在云斑车蝗转录组中共筛选出杀虫剂抗性相关基因268个,其中解毒酶unigene205个,杀虫剂靶标蛋白unigene 63个;筛选出134个免疫相关基因,其中编码模式识别受体的unigene共41个,可能参与Toll信号通路的unigene共27个,可能参与IMD信号通路的unigene共22个,编码抗菌肽的unigene共27个,参与黑化反应的unigene共17个。本研究为云斑车蝗杀虫剂抗性相关基因和免疫相关基因的功能研究奠定了分子基础,为进一步筛选害虫生物防治的靶标基因提供了一定的数据支持。
- 刘菲刘菲杨苗苗黄原
- 关键词：转录组免疫
- 日本条螽线粒体基因组序列的测定与分析被引量：3
- 2017年
- 日本条螽完整的线粒体基因组序列长16 281 bp,包括13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因、2个r RNA基因和1个D-loop区,其基因次序和方向与祖先序列相同。该线粒体基因组排列紧凑,但在ND2和tRNA^(Trp)之间有一段长为650 bp的基因间隔区。为研究螽斯科的系统发育关系,本研究选取日本条螽及其它17个螽斯科物种线粒体基因组的蛋白质编码基因和r RNA基因序列构建贝叶斯系统发生树。
- 刘菲
- 关键词：线粒体基因组直翅目
