王亮
- 作品数：10 被引量：17H指数：3
- 供职机构：南宁市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：广西卫生厅科研项目南宁市科学研究与技术开发计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生交通运输工程机械工程更多>>
- A(H3N2)亚型流感病毒血凝素基因特性及蛋白结构分析,以南宁市2009～2012年为研究案例被引量：2
- 2015年
- 利用生物信息学软件和数据库研究南宁市2009~2012年度A(H3N2)亚型流感病HA基因的遗传变异规律及蛋白结构变化。通过RT-PCR扩增H3N2病毒HA基因并测序,同源比对统计毒株氨基酸位点的差异、构建系统进化树分析进化规律和同源建模分析蛋白结构的变化。系统进化树表明53株HA基因序列被分为4个类群,呈多侧支流行;所有毒株的二硫键和受体结合位点(RBS)高度保守;部分毒株HA在第45位点增加一个糖基化位点,在第144位点丢失一个糖基化位点;HA抗原决定簇氨基酸累计有30个位点发生变异,涉及5个抗原决定簇;HA晶体结构分析抗原决定簇突变位点主要发生在无规则卷曲处,大多数替换的氨基酸种类和性质相同或相似。南宁市A(H3N2)亚型流感病毒株变异活跃,2012年A(H3N2)亚型流感病毒与当年WHO推荐的疫苗株具有较远的进化距离,多数毒株具备了形成新变种的条件,是否形成新的流行株,有待深入研究。
- 秦剑秋裴建新林新勤王亮黄莉刘海燕
- 关键词：血凝素蛋白结构同源建模
- 南宁市102例HIV/HCV共感染者HCV基因型特征分析
- 2017年
- 目的了解南宁市静脉注射吸毒人群(IDUs)中HIV/HCV共感染者HCV基因亚型流行情况。方法收集2012—2014年间南宁市静脉注射吸毒人员HIV/HCV共感染者血浆样本总共108份,设计特异性引物,通过巢式PCR对HCV NS5B区域长339 bp的片段进行扩增并测序,构建系统进化树对HCV进行基因分型。结果 108份血浆样本中巢式PCR成功扩增基因片段102份,系统进化分析显示检出4种HCV基因型含6种基因亚型,各基因亚型所占样本比例为6a 34.31%(35/102)、3b 33.33%(34/102)、1a 20.59%(21/102)、1b 6.87%(7/102)、3a 3.92%(4/102)和2a 0.98%(1/102)。在不同人口学特征时102份样本HCV基因型组成差异无统计学意义(P>0.05)。结论南宁市IDUs人群HIV/HCV共感染者中至少存在6种HCV基因亚型流行,6a、3b和1a为主要流行亚型。
- 王亮刘海燕栾苑黄秋芳潘海西
- 关键词：丙型肝炎病毒艾滋病病毒共感染基因分型
- 2013-2014年南宁市A(H3N2)亚型流感病毒病原学特征分析被引量：3
- 2017年
- 目的分析南宁市2013-2014年A(H3N2)亚型流感病毒的病原学特征及流行趋势。方法通过RT-PCR扩增毒株A(H3N2)病毒血凝素(HA)基因和神经氨酸酶(NA)并进行同源比对,采用Mega5.1(N-J法)构建系统进化树,统计氨基酸位点的差异,同源建模后分析蛋白结构的变化。结果构建系统进化树,20株毒株HA基因与NA基因均分为4个类群,呈多侧支流行;部分毒株的HA蛋白A抗原决定簇144位点及B抗原决定簇156和158位点发生突变,二硫键和糖基化位点高度保守,未发生变化;NA蛋白抗原基本稳定,只有A/Nanning/43/2014(H3N2)毒株抗原决定簇312位点发生突变,二硫键、酶活性位点、糖基化位点及耐药性位点均未发生变化;HA和NA蛋白晶体结构分析显示氨基酸突变位点主要发生在β折叠部位和无规则卷曲处。结论南宁市A(H3N2)亚型流感病毒株变异活跃,在HA基因和NA基因进化树上疫苗株明显滞后于南宁市流行株,抗原决定簇位点出现氨基酸的替换,但关于疫苗的预防效果尚需进一步验证。
- 秦剑秋王亮刘海燕黄莉
- 关键词：血凝素神经氨酸酶蛋白结构同源建模
- 南宁市静脉注射吸毒人群HIV-1基因亚型及耐药性分析被引量：2
- 2019年
- 目的了解南宁市静脉注射吸毒人群(IDUs)中HIV-1流行基因亚型及其耐药性,为辖区艾滋病防治策略制定提供科学依据。方法收集2017年南宁市静脉注射吸毒人员HIV感染者血浆样本总共68份,提取病毒核糖核酸(RNA),通过巢式PCR对HIV pol基因片段进行扩增测序,构建系统进化树进行基因分型,并将序列提交至美国斯坦福大学HIV耐药数据库分析,利用pol基因测序结果分析HIV-1亚型和耐药性情况。结果 68份血浆样本中巢式PCR成功扩增基因片段62份,系统进化分析显示检出3种HIV-1重组基因亚型,CRF_01-AE亚型占72.6%(45/62)、CRF_07-BC亚型占12.9%(8/62)、CRF_08-BC亚型占14.5%(9/62),CRF01_AE型为主要流行亚型。χ~2检验分析显示在性别、年龄、民族、婚姻4个人口学特征中62份样本HIV-1亚型组成差异无统计学意义(P>0.05)。62份样本中3例CRF_08-BC亚型发现T69S耐药突变,1例CRF_01-AE亚型发现L210W突变,1例CRF_07-BC亚型发现A71V突变。结论南宁市IDUs人群HIV-1感染者中至少存在3种HIV-1基因亚型流行,CRF_01-AE重组型为优势流行株,研究中出现的耐药突变位点为低度耐药突变位点,应密切监视其流行趋势。
- 王亮覃巍巍
- 关键词：人免疫缺陷病毒1型基因分型
- 我国无偿献血人群HIV感染状况及确认策略被引量：4
- 2020年
- 为降低经血传播HIV的风险,给安全用血提供有效措施,本文就我国无偿献血人群HIV感染状况、目前的HIV检测方法,以及确认策略和存在问题作一一综述。
- 黄秋芳潘海西秦剑秋王亮栾苑
- 关键词：人类免疫缺陷病毒无偿献血人群
- 人腺病毒7型流行病学及检测方法研究进展
- 2022年
- 人腺病毒(human adenovirus,HAd V)属于腺病毒科哺乳动物腺病毒属,最先于1953年由Rowe等在儿童手术切除的扁桃体组织细胞培养液中发现,1956年国际病毒命名委员会将其正式命名为人腺病毒,可分为分为A~G 7个亚群,103个型别。人腺病毒7型(HAdV-7)易感染婴幼儿、免疫力低下人群以及军人,容易在学校、医院、军营等人员聚集性场所引起聚集性暴发疫情。
- 王亮秦剑秋尹刘江阳世雄
- 关键词：流行病学特征
- 一种新型流水线式移动核酸检测车
- 本实用新型公开了一种新型流水线式移动核酸检测车，包括车体、驾驶室、检测室、入口、缓冲间、工作台、生物安全柜、全自动核酸提取及荧光PCR系统、高压灭菌器、冰箱和储物柜，车体的内部分割成驾驶室和检测室；车体的中部设置有进入检...
- 秦剑秋尹刘江阳世雄杨丞王亮周吉
- 南宁市流感病毒HA基因和NA基因的遗传学监测
- 刘海燕秦剑秋范云燕王亮林新勤黄莉覃巍巍石健
- 该课题为南宁市科技局2008年8月下达的南宁市科学研究与技术开发计划项目：人口健康、计划生育、新生儿健康关键技术研究开发（合同编号：200802127C）课题，课题名称为：南宁市流感病毒HA基因和NA基因的遗传学监测。课...
- 关键词：
- 关键词：流感病毒生物信息数据库
- 南宁分离株A(H3N2)流感病毒神经氨酸酶遗传变异及蛋白结构分析被引量：5
- 2015年
- 目的应用生物信息学方法分析南宁市2007-2012年A(H3N2)亚型流感病毒分离株神经氨酸酶NA的遗传变异规律、二硫键、酶活性中心位点、抗原决定簇位点、糖基化位点及蛋白结构变化情况。方法通过RT-PCR扩增H3N2病毒NA基因并测序,运用生物软件对所测序列进行拼接和同源比对;通过构建系统进化树分析进化规律,通过同源建模分析蛋白结构的变化。结果系统进化树将40株NA基因序列分为4个类群,呈多侧支流行;毒株的二硫键高度保守,酶活性中心位点224和位点276出现氨基酸的替换,部分毒株NA抗原决定簇328、332、336、434氨基酸位点发生替换;所有毒株200、329和402糖基化位点全部丢失,部分毒株在367位点增加一个糖基化位点,在234位点丢失一个糖基化位点;HA晶体结构分析氨基酸突变位点主要发生在β折叠部位和无规则卷曲部位。结论南宁分离株A(H3N2)亚型流感病毒变异活跃,抗原决定簇位点、酶活性中心位点、糖基化位点均出现氨基酸的替换。因此应继续加强对南宁市的流感监测,及时了解当地流感的流行趋势和病毒的抗原变异情况,为全国的流感预防、控制、预测及流感疫苗株的开发提供理论依据。
- 秦剑秋裴建新林新勤王亮黄莉刘海燕
- 关键词：神经氨酸酶蛋白结构同源建模
