樊帆
- 作品数：12 被引量：19H指数：3
- 供职机构：云南省疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
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- 云南省健康儿童中1株肠道病毒新毒株EV—C99的分离及其基因特征分析被引量：2
- 2018年
- 目的对云南省2016年健康儿童中1株肠道病毒（enterovirus，EV）新毒株EV-C99进行分离并对其基因特征进行分析。方法按世界卫生组织（World Health Organization，WHO）推荐的方法对该名儿童的大便标本进行病毒分离，提取该病毒RNA并对其VP1区基因进行RT-PCR和基因测序，用Sequencher 5.0软件对序列进行编辑和拼接。所得序列在GenBank进行＂BLAST＂搜索，得到初步结果，再用MEGA5.2软件计算与原型株的核苷酸和氨基酸同源性，按目前肠道病毒测序定型标准确定病毒最终型别并进行基因特征分析。结果该病毒能被494/496和495/497引物扩增，经Sequencher 5.0软件拼接和编辑后得到约1 200 bp的序列，该序列在GenBank进行＂BLAST＂搜索，初步结果为新型肠道病毒EV-C99。与EV-C99病毒的原型株BAN00-10461（基因库编号：EF015008）对比分析后得到该病毒VP1区完整序列为909 bp，与原型株的核苷酸（nucleotide，nt）同源性（identity）为77.05%，氨基酸（amino acid，aa）同源性为90.04%，按肠道病毒测序定型标准，确定该病毒为EV-C99，是人类肠道病毒C组中的一种新型病毒。结论2016年云南省健康儿童肠道病毒带毒调查中分离到一株肠道病毒新毒株EV-C99，是国内第3次报道该病毒。基因进化分析表明，云南分离株与新疆分离株、山东分离株都为B基因型，但3个省的分离株位于不同的进化分支，该病毒具有基因多样性特点。
- 张杰胡筱莛樊帆丁峥嵘田炳均
- 关键词：健康儿童基因特征
- 2016年云南省脊髓灰质炎疫情输入传播风险评估被引量：5
- 2017年
- 目的评估云南省各州(市)2016年脊髓灰质炎(脊灰)疫情输入传播的风险,为制定应对策略并采取针对性措施阻止脊灰疫情输入传播提供参考。方法在中国2014年脊灰野病毒输入传播风险评估工具的基础上,用改良的两级指标体系评估云南省2016年脊灰输入传播的风险。通过收集相关资料,对各指标进行相应评分,累加得到各州(市)综合评分,并以此研判各州(市)脊灰疫情输入传播的风险水平。结果本次评估从人群免疫情况、急性弛缓性麻痹病例监测信息报告管理系统运转质量和境外输入风险三方面对各州(市)进行评估,西双版纳傣族自治州、临沧市、红河哈尼族彝族自治州、文山壮族苗族自治州、昭通市综合评分最高为高风险;玉溪市等6个州(市)为中风险;大理白族自治州等5个州(市)为低风险。结论利用调整后的评估工具将云南省16个州(市)分为脊灰疫情输入传播高、中、低3类风险地区,为不同风险水平地区和不同薄弱环节采取针对性措施和巩固无脊灰成果提供了参考依据。
- 樊帆丁峥嵘李琼芬赵智娴孔毅汤晶晶张杰
- 关键词：脊髓灰质炎风险评估
- 云南省2011-2014年急性弛缓性麻痹病例非脊髓灰质炎肠道病毒分子流行病学特征被引量：4
- 2017年
- 目的了解非脊髓灰质炎(脊灰)肠道病毒(Non-polio enterovirus,NPEV)的型别分布及分子进化特征。方法对2011-2014年从云南省急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)病例中分离到的148株NPEV进行VP1完整编码区核苷酸的扩增与序列测定。所获得的云南地方株基因序列与各基因型原型株进行核苷酸与氨基酸同源性比较,并与Gen Bank中选取的代表株构建系统进化树。结果在148株NPEV分离株中,肠道病毒(Enterovirus,EV)A组(EV-A)、EV-B、EV-C分别占31.1%(46株,8个血清型)、64.9%(96株,27个血清型)、4.1%(6株,3个血清型);基因进化树显示,各种血清型病毒株与对应原型株及代表株聚集;除埃可病毒10型(E-10)和EV-C96型外,云南地方株与原型株位于不同分支。在4年的流行过程中,同一个型别的分离株之间的遗传变异程度最高的是EV-C96、E-18和E-5,分别达到21.5%、21.3%和20.4%。结论云南省存在EV多个型别的循环,需持续性监测和探索EV分子流行病学和进化规律。
- 汤晶晶张杰李凯樊帆李琼芬丁峥嵘
- 关键词：急性弛缓性麻痹非脊髓灰质炎肠道病毒分子流行病学
- 应用圆形分布法探讨云南省急性弛缓性麻痹病例的季节性
- 2019年
- 目的探讨云南省2000-2017年急性弛缓性麻痹(AFP)病例不同年份的季节分布特征,为加强云南省AFP病例的监测和相关疾病的防控及最终消灭脊髓灰质炎提供科学依据。方法收集云南省2000-2017年每年每月报告的AFP病例数,应用圆形分布法进行季节性分析,用Watson-Williams检验分别比较各年春夏季和秋冬季高峰日是否相同。结果云南省2000-2017年AFP病例发生麻痹时间呈双峰分布,集中趋势为r(春夏季)=0.65,r(秋冬季)=0.67。春夏季高峰日有提前趋势,由6月向5月推移,经Rayleigh’s检验显示Z值大于Z0.01(P<0.05),每年均存在高峰日和高峰期,比较各年的高峰日,各年间平均角差异有统计学意义(F=6.53,P<0.01);秋冬季高峰日集中在11月,经Rayleigh’s检验显示Z值大于Z0.01(P<0.05),每年均存在高峰日和高峰期,比较各年的高峰日,各年间平均角差异有统计学意义(F=3.38,P<0.01)。结论云南省AFP病例的发生具有很强的季节性,病例出现高峰前是实施各项干预措施的最好时机,应根据时间特征的变化适时调整监测和预防策略。
- 何思然樊帆汤晶晶丁峥嵘
- 关键词：圆形分布法急性弛缓性麻痹
- 云南省2011-2017年急性弛缓性麻痹病例残留麻痹流行病学和脊髓灰质炎病毒分离株基因特征被引量：1
- 2019年
- 目的分析云南省2011-2017年急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis, AFP)病例残留麻痹的流行病学特征和脊髓灰质炎病毒(Poliovirus,PV)分离株的基因特征。方法通过AFP病例监测信息报告管理系统收集2011-2017年残留麻痹AFP病例数据进行描述性分析;选择5例病例的Ⅲ型PV分离株进行全基因组序列测定,进行变异和重组分析。结果云南省2011-2017年共报告AFP病例1 722例,其中残留麻痹病例269例(15.64%)。Logistic回归分析显示,四肢麻痹、麻痹程度严重、PV疫苗株分离阳性是AFP病例发生残留麻痹的危险因素。在5例Ⅲ型PV分离株中,4株在nt472的回复突变与Ⅲ型PV野病毒序列完全一致;4株在其生活周期内均发生了1次以上重组。结论云南省2011-2017年AFP病例的残留麻痹率不高,且Ⅲ型PV分离株的回复突变和重组较为常见。应加强对严重AFP病例的及时治疗与管理,以及病例流行病学特征与分子病毒学特征的关联分析。
- 何思然汤晶晶樊帆李凯丁峥嵘
- 关键词：急性弛缓性麻痹流行病学脊髓灰质炎病毒基因特征
- 云南省2000-2017年急性弛缓性麻痹病例残留麻痹流行病学特征被引量：4
- 2019年
- 目的分析云南省2000-2017年急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)病例残留麻痹的流行病学特征。方法收集2000-2017年云南省AFP病例监测系统报告的<15岁儿童残留麻痹AFP病例,进行描述流行病学分析;采用Logistic回归分析残留麻痹的影响因素。结果云南省2000-2017年报告<15岁儿童AFP病例4 302例,其中残留麻痹876例(20.36%)。圆形分布分析显示,AFP病例发生残留麻痹的时间无明显季节性。Logistic回归分析显示,女性(OR=1.23,95%CI:1.05-1.44)、麻痹时肌肉疼痛(OR=1.48,95%CI:1.25-1.74)、初始麻痹程度严重(OR=2.41,95%C I:2.05-2.84)、深部腱反射减弱或消失(OR=2.38,95%C I:2.02-2.81)、粪便标本脊灰病毒疫苗株阳性(OR=3.18,95%C I:2.22-4.55)、四肢麻痹(OR=1.67,95%C I:1.38-2.02)为AFP病例残留麻痹的危险因素。结论云南省2000-2017年<15岁儿童AFP病例残留麻痹发生率较高。需加强AFP病例早期科学治疗和残留麻痹病例早起康复训练。
- 何思然汤晶晶樊帆李凯龚琼宇丁峥嵘
- 关键词：急性弛缓性麻痹
- 云南省2011～2015年口服脊髓灰质炎减毒活疫苗补充免疫活动分析
- 2016年
- 目的对云南省2011～2015年口服脊髓灰质炎（脊灰）减毒活疫苗（Oral Poliomyelitis Attenuated Live Vaccine,OPV）补充免疫活动（Supplementary Immunization Activities,SIA）进行分析,为维持和巩固无脊灰免疫策略的调整提供参考。方法收集云南省2011～2015年OPV SIA报表和督导评估资料,进行描述性分析。结果在脊灰野病毒（Wild Poliovirus,WPV）输入与传播风险评估的基础上,云南省2011～2015年共在全省范围内开展了6轮OPV SIA,共接种18 539 740剂OPV,每1轮OPV SIA国内儿童和外籍入境儿童报告接种率均〉95%。共发现＂0剂次＂免疫儿童226 027人,占报告应种总数的1.20%;入境外籍儿童和国内儿童＂0＂剂次比例分别为11.80%、1.03%（χ2=78 180.97,P=0.00）,其中1～6岁入境外籍儿童和国内儿童＂0＂剂次的比例分别为92.66%、17.29%（χ2=32 363.69,P=0.00）。6轮OPV SIA共对189个县次开展了接种率快速评估,平均评估接种率为98.05%,有16个县次评估接种率〈95%。结论云南省SIA运转模式成熟,最大限度填补了国内儿童和入境外籍儿童的免疫空白,有效防止了脊灰野病毒与脊灰疫苗衍生病毒（Vaccine Deprived Poliovirus,VDPV）的输入和VDPV循环的发生。
- 孔毅赵智娴樊帆唐婷婷田子颖丁峥嵘
- 关键词：脊髓灰质炎口服脊髓灰质炎减毒活疫苗
- 云南省急性弛缓性麻痹病例中柯萨奇病毒B5感染情况及病毒基因特征分析
- 2021年
- 为了解云南省急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)病例中柯萨奇病毒B组5型(Coxsackievirus B5,CV-B5)感染情况及病毒基因特征,采用回顾性研究的方法,收集AFP监测系数据资料,描述CV-B5感染AFP病例的流行病学特征及临床表现;对CV-B5分离株进行完整VP1区逆转录-聚合酶链反应扩增和核苷酸序列测定,测序结果进行同源性分析和系统发生学研究。结果显示,15例CV-B5阳性的AFP病例散在分布于7个云南省内州市、贵州省及缅甸;男女比例为1∶2,5岁以下儿童占73.3%,53.3%(8/15)的病例麻痹时伴发热,以双侧下肢麻痹(66.7%,10/15)为主,临床诊断多为肌炎(33.3%,5/15),1例病例残留麻痹。CV-B5云南株之间以及与原型株之间的核苷酸同源性分别为75.0%~100.0%和77.2%~82.0%。云南本地存在两个基因型的CV-B5共循环,大多数云南株(16株)与中国大陆CV-B5分离株均属于D基因型(D3亚型),另外两株云南株属于国外优势流行的C基因型,与其他云南株之间存在较大的核苷酸差异(20.4%~25.0%)。本研究描述了CV-B5云南地方株的分子流行病学特征,首次发现我国存在C基因型。研究显示分离自不同疾病来源及健康人群的CV-B5在亲缘关系树上无特异性区分。
- 汤晶晶樊帆樊帆李凯李江嵘柏桂珍李凯
- 关键词：急性弛缓性麻痹
- 云南省1～29岁人群HBV血清标志物检出模式分析被引量：3
- 2016年
- 目的了解云南省1-29岁人群HBV感染状况及血清标志物检测组合模式。方法按照多阶段随机抽样方法，参照2006年全国人群乙型肝炎血清流行病学调查结果，计算抽样人数，在云南省6个疾病监测点抽取1～29岁人群进行问卷调查及血样采集，采用酶联免疫吸附试验检测HBV血清标志物5项，即HB-sAg、抗-HBs、抗-HBc、HBeAg和抗-HBe。结果 本研究共抽取869人进行调查，检出HBV感染57人，感染率为6．56％；共检出8种常见的组合模式，其中以抗-HBs单一阳性最多（496人，57．08％），其次为全阴性模式（316人，36-36％）。1-4岁和5～14岁儿童以单纯抗-HBs阳性为主，分别占73．88％（263／356）和56．54％（147／260）；15～29岁人群以全阴性检测结果多见，占49．80％（126／253）。有免疫史人群中，以抗-HBs单一阳性为主。无乙型肝炎免疫史及免疫史不详人群所检出的HBV血清标志物组合模式构成比比较接近，以全阴模式为主，自然感染所致的组合模式多见。结论云南省HBV血清标志物检出模式由自然感染为主向人工免疫为主的模式转变，但仍存在较大的免疫空白，针对青少年的免疫接种工作仍有待加强。
- 康文玉李琼芬赵智娴田子颖李凯丁峥嵘胡筱莛樊帆
- 关键词：肝炎病毒乙型血清标志物
- 2007-2018年云南省急性弛缓性麻痹病例肠道病毒A71型基因特征
- 2020年
- 目的分析云南省急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)病例肠道病毒A71型(Enterovirus A71,EVA71)的基因特征。方法收集云南省2007-2018年AFP病例EV-A71阳性分离株,对分离株进行VP1编码区逆转录-聚合酶链反应扩增和核苷酸序列测定,分析核苷酸同源性和基因亲缘关系。结果从2007-2018年云南省AFP病例中分离获得46株EV-A71,与A、B、C基因型代表株和云南省既往其他来源的分离株之间的核苷酸同源性分别为80.6%-83.0%、81.4%-85.4%、85.4%-99.1%、81.7%-99.8%;同年份分离株之间的核苷酸差异在2018年3株的0.63%至2014年9株的3.75%之间,不同年份分离株之间的核苷酸平均差异在1.77%-7.81%之间;基因亲缘进化分析显示,分离株与C4a基因亚型代表株处于同一分支。结论云南省2007-2018年AFP病例的EV-A71分离株均为C4a基因亚型,与本省其他来源EV-A71分离株的基因亲缘关系相近。
- 汤晶晶李江嵘李凯张杰樊帆丁峥嵘
- 关键词：急性弛缓性麻痹基因特征
