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郭其新: 作品数：15 被引量：24H指数：3; 供职机构：扬州大学动物科学与技术学院更多>>; 发文基金：国家科技支撑计划江苏高校优势学科建设工程资助项目国家自然科学基金更多>>; 相关领域：农业科学轻工技术与工程医药卫生更多>>

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高分辨率基因组对家禽现代育种的挑战: 2023年; 基因组学技术以无法想象的方式使动物育种技术发生了质变,随着基因组学的发展,家禽育种受到基因组质量的影响正日益减少。几十年来,遗传和基因组技术的发展在提高家禽育种技术方面发挥了关键作用。该文回顾了基因组发展历史、家禽现代育种现状及在高分辨率基因组下家禽现代育种面临的挑战,为实现家禽精准育种提供参考。; 郭其新胡亦舟白皓常国斌; 关键词：家禽现代育种

不同品种鸡BTN1基因序列差异分析被引量：1: 2019年; 【目的】BTN1基因位于MHC家族的BF/BL核心区域,研究其SNPs和InDels对提高鸡抗病性有重要意义.【方法】以NCBI中Gallus gallus BTN1基因序列为参照,利用MEGA6.06软件对26个品种鸡的BTN1基因序列比较分析,筛选出与抗病性有关的InDels、SNPs和氨基酸变化,并对26个品种鸡的BTN1基因序列进行聚类分析.【结果】在Exon5和Exon17上各有1个SNPs位点,且为错义突变.SNPs位点主要发生在Intron10、Intron13、Intron18、Intron22和Intron23上.‘雪山草鸡’和‘安卡红鸡’等抗病性强、适应性强的品种鸡在Exon17上发生错义突变;与抗病性较强的‘安卡红鸡’相比,‘来航鸡’在Exon5上存在一个错义突变.【结论】BTN1的Exon5和Exon17上SNPs位点对抗病性具有一定的影响,为家禽的抗病育种研究提供参考依据.; 陈颖郑圣晗孔令琳朱鹏飞吴允郭其新陈国宏常国斌; 关键词：抗病性 SNPS INDELS

基于全基因组重测序对不同鸭遗传资源进行群体结构分析被引量：5: 2021年; 为探究我国部分地方鸭遗传资源的群体结构,本研究以国家级水禽基因库(福建)15个鸭遗传资源为实验材料,通过全基因组重测序,分析其群体结构。通过PCA分析、群体结构分析、系统发育树分析发现,15个鸭遗传资源的遗传分化结果相似,系统发育树结果显示麻旺鸭单独聚为一类,攸县麻鸭、山麻鸭和缙云麻鸭聚为一类;连城白鸭、莆田白鸭和莆田黑鸭聚为一类;三穗鸭和金定鸭聚为一类;绍兴鸭、吉安红毛鸭、龙胜翠鸭、中山麻鸭、巢湖鸭聚为一类,褐色菜鸭单独聚为一类。本研究对我国15个鸭遗传资源进行了遗传结构分析,为获取我国地方鸭遗传资源间的遗传信息和遗传关系提供了更准确的依据。; 王统苗郭其新白皓常国斌常国斌; 关键词：系统发育树

不同鸡种DMA基因序列比较分析: 2017年; DMA(major histocompatibility complex,classⅡ,DM alpha)基因是鸡MHCⅡ类典型基因座,与免疫反应和抗病性密切相关。试验对25个不同鸡种的DMA基因序列进行目标捕获测序,以NCBI上Gallus gallus的DMA基因序列作为参考序列,通过MEGA6软件进行序列比对分析,筛选出不同鸡种DMA基因序列上的SNPs和Indels(insertion-deletion)位点以及氨基酸的变化,并根据基因序列的差异构建系统进化树,探究不同鸡种间的同源性。结果表明,DMA基因呈现出丰富的多态性,突变和缺失位点集中于外显子上,且多个鸡种在第2外显子发生多位碱基缺失,导致其氨基酸序列发生极大改变,可能是不同鸡种产生抗性差异的主要因素;同时进化树也显示,斗鸡、藏鸡等抗性较好的鸡种间有相近的亲缘关系,同源性较高。以上结果表明,DMA基因有丰富的遗传多样性,且与不同鸡种的先天免疫与抗病特性差异相关,第2外显子中94 496~94552的Indels可以作为鸡免疫特性的候选标记。; 孔令琳郑圣晗陈颖朱鹏飞吴允郭其新陈国宏常国斌; 关键词：MHC SNPS INDELS 进化树

鸡精子发生过程中关键piRNA的探究: 引言从生殖干细胞的形成到精子发生,这一系列过程包含诸多因素。在小鼠、果蝇以及斑马鱼等模式动物精子发生过程中,piRNAs扮演了重要的角色。为探究家禽中参与精子发生及生殖干细胞增殖的piRNAs,本研究利用深度测序技术结合...; 郭其新徐璐张康宁常国斌陈国宏; 关键词：精子发生 PIRNA; 文献传递

不同鸡品种BNK基因序列比较分析: BNK(C-type lectin-like receptor2)基因为C型凝结素受体基因中的抑制性基因,与禽类先天免疫性能关系密切.本研究以NCBI中Gallus gallus BNK基因序列为参考,利用MEGA6软件...; 陈颖郑圣晗孔令琳朱鹏飞吴允郭其新陈国宏常国斌; 关键词：品种资源

鸡精子发生过程中关键piRNA的探究: 1引言从生殖干细胞的形成到精子发生,这一系列过程包含诸多因素。在小鼠、果蝇以及斑马鱼等模式动物中,piRNAs扮演了重要的角色。为探究家禽中参与精子发生及生殖干细胞增殖的piRNAs,本研究利用深度测序技术结合RNA免疫...; 郭其新徐璐张康宁常国斌陈国宏; 关键词：精子发生 PIRNA

不同鸡种BF2基因序列比较分析被引量：3: 2018年; 利用目标区域捕获测序技术对BF2(Major histocompatibility complex class I antigen BF2)基因进行序列测定,找出不同鸡种BF2基因序列上的差异。以NCBI网站上Gallus_gallus-5.0的BF2基因序列为参照标准。利用MEGA6.06软件对25个鸡种的基因序列进行比对分析,统计SNPs位点和Indel位点,并构建系统进化树进行分析。结果表明:在BF2第2、3外显子上分别存在22和31个有义突变,占BF2基因全部有义突变的78%,表明BF2基因的第2、3外显子起重要作用且拥有丰富的多态性。第5、6、7外显子属于保守区域。25个鸡种大致可被分为3大类:鹿苑鸡、如皋黄鸡、溧阳鸡和太湖鸡等聚为一类;罗斯鸡和隐性白羽肉鸡等聚为一类;雪山鸡和广西黄鸡等聚为一类。表明中国地方鸡品种间的同源性较小,BF2基因在不同鸡种上具有丰富的遗传多样性,在第2外显子上C/T突变和第3外显子上A/C突变可作为BF2基因有关抗病的候选SNPs位点。; 郑圣晗陈颖孔令琳吴允郭其新陈国宏常国斌; 关键词：进化树

基于生物发光法检测冰鲜鸡新鲜度的初步研究被引量：2: 2016年; 为了对市场上出售的冰鲜鸡进行新鲜度等级划分,研究利用生物发光法,快速检测屠宰后4、8、12、24、48、72 h的鸡胸、腿肉中ATP含量,并以此为标准将肉品新鲜度划分成不同等级。结果表明,鸡肉中ATP含量随屠宰后时间延长而不断下降,直至为零。其中,屠宰后12和24 h有小幅波动,基本符合生物体ATP降解规律。根据屠宰后不同时间鸡肉中ATP含量,将1~4 h(ATP含量大于1.00×10^(-8)mol/g)上市的鸡肉定为一级鲜品,4~24 h(ATP含量为1.00×10^(-11)~9.99×10^(-8)mol/g)内的鸡肉定义为二级鲜品,24~72 h(ATP含量为1.00×10^(-12)~9.99×10^(-11)mol/g)内的鸡肉定为三级鲜品,72 h以后(ATP含量小于1.00×10^(-12)mol/g)的鸡肉定为冻品。; 鲁伟吴允任立辰郭其新朱鹏飞张扬张康宁袁青妍许盛海徐琪赵文明常国斌陈国宏; 关键词：冰鲜鸡 ATP 新鲜度

鸡NLRCLRC5基因启动子区SNPs及其与部分免疫性状的相关分析: 2016年; 通过检测鸡NLRC5基因启动子区域单核苷酸多态位点(Single nucleotide polymor-phisms,SNPs),以期筛选与免疫性状相关的遗传标记。采用PCR-SSCP方法对广西黄鸡(F2)以及矮小品系XA和XB系的NLRC5基因启动子区SNPs进行检测,并对不同基因型个体与免疫指标进行关联分析。结果发现在A-1810G处有1个突变。在XA、XB鸡群中共检测到3种基因型,等位基因A的频率分别为0.833、0.842,G的频率分别为0.167、0.158;而F2中只检测到野生型和杂合子,未发现突变型,等位基因A的频率平均为0.9,G的频率为0.1,卡方检验结果表明XA系、XB系极显著偏离了Hardy-Weinberg平衡(P<0.05);对不同基因型个体与免疫指标进行关联分析发现:三个品种中,除血清IL-1β浓度外,突变型个体的H/L值、Ig Y、Ig M等免疫指标均显著低于杂合子和野生型(P<0.05);XA系中野生型和杂合子的H/L值、Ig M差异不显著(P>0.05);XB系中野生型和杂合子IL-1β和Ig Y差异不显著(P>0.05);F2系中野生型和杂合子IL-1β和Ig M差异不显著(P>0.05)。野生基因型(AA)的综合免疫性能要优于杂合子(AG)和突变型(GG),AA型可以作为一般抗性的优势基因型,结合分子标记辅助选择的方法进行抗病新品系的选育工作。; 姜庆林郭其新胡刚安常国斌梁勇杨冬辉陈国宏; 关键词：抗性先天性免疫多态性

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