周佳怡
- 作品数：6 被引量：37H指数：4
- 供职机构：暨南大学生命科学技术学院水生生物研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金教育部留学回国人员科研启动基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 中国近海鯻科鱼类系统发育初探被引量：7
- 2010年
- 分析了中国鯻科鱼类4属6种17尾鱼的线粒体16S rRNA基因3′端部分序列特征。结果表明,在鯻科鱼类507 bp的碱基序列中有变异位点57个,简约信息位点55个,A+T含量(50.3%)高于G+C含量(49.8%),转换/颠换比为2.7。在邻接树和最大似然树上,鯻科鱼类聚类为2个分支,其中鯻属细鳞鯻独立为一支,其余属种组成另一分支,不支持Vari(1978)关于鯻科15个属中匀鯻属为最早分化类群的结论;鯻属的细鳞鯻和鯻鱼并未聚类在一起,表明二者亲缘关系较远,或为不同属,与Lee等报道相一致。由于鯻科鱼类属种较多,本文所分析的样品有限,且鯻科系统分类长期存在争议,因而需要采用多个线粒体和核基因联合分析更多属种,才能确定可否另立新属,并进一步明确鯻科鱼类的系统发育关系。
- 周佳怡章群唐优良余帆洋赵爽
- 关键词：线粒体16SRRNA系统发育
- 黄渤海松江鲈鱼线粒体控制区结构与序列多态性分析被引量：16
- 2010年
- 测定了辽宁丹东、盘锦与河北秦皇岛35尾松江鲈鱼线粒体控制区序列977bp。共检出单倍型30个,多态位点35个,简约信息位点27个,绝大多数变异集中在192-342bp、594-783bp区段,同时识别出了线粒体控制区5’端终止序列区、中央保守区和3’端保守序列区的关键序列。3个群体总的单倍型多样性为0.990,核苷酸多样性为0.00718,丹东群体核苷酸多样性最高(0.00959)。群体间、群体内平均遗传距离低(分别为0.0067和0.0063);在NJ树上不同地理来源的个体混杂分布;Fst分析显示丹东与秦皇岛群体间遗传分化相对较大(0.14222,p<0.05),其余不明显(0.02865-0.05616,p>0.1),表明3个群体有可能隶属同一个种群。核苷酸不配对分布图表明松江鲈鱼可能未经历过大规模的种群扩张。
- 刘海林章群唐优良余帆洋周佳怡
- 关键词：松江鲈鱼
- 中国沿海石斑鱼亚科的DNA条形码研究
- 石斑鱼类（groupers）隶属于鲈形目（Perciformes）鮨科（Serranidae）石斑鱼亚科（Epinephelinae）,是世界上最重要的海洋经济鱼类之一,种类繁多,广泛分布于热带及亚热带大陆沿岸及岛礁海域...
- 周佳怡
- 关键词：石斑鱼亚科DNA条形码COI基因
- 文献传递
- 基于12S rRNA部分序列分析的中国8种笛鲷科鱼类系统发育初探被引量：6
- 2011年
- 测定了中国近海8种笛鲷鱼类线粒体12S rRNA基因部分序列,结合GenBank中下载的2种笛鲷鱼类序列,以鲈形目(Perciformes)中的单列齿鲷(Monotaxis grandoculis)、黄带裸颊鲷(Lethrinus obsoletus)、尖嘴蓝子鱼(Siganus unimaculatus)、褐蓝子鱼(Siganus fuscescens)和金眼鲷目(Peryciformes)中的点鳍棘鳍鱼(Sargocentron rubrum)、大鳞锯鳞鱼(Myripristis berndti)、红金眼鲷(Beryx splendens)以及鲤形目(Cypriniformes)中的印度斑马鱼(Danio rerio)为外类群,构建最大似然树和贝叶斯推断树,发现在895bp的同源序列中,共有170个变异位点,其中简约信息位点126个,转换/颠换值为2.39;最大似然树和贝叶斯推断树显示梅鲷鱼类(Caesioninae)镶嵌在笛鲷科(Lutjanidae)鱼类中,支持将梅鲷科并入笛鲷科的观点,但是梅鲷属在笛鲷科中的系统位置需要进一步研究;马拉巴笛鲷(Lutjanus malabaricus)与千年笛鲷(Lutjanus sebae)聚为一支,支持根据形态学特征的分类处理;但形态相似的约氏笛鲷(Lutjanus johni)和紫红笛鲷(Lutjanus argentimaculatus)的遗传差异较大,表明形态特征的相似与亲缘关系的远近并无直接联系。
- 唐优良章群余帆洋周佳怡司丛利黄小彧马奔
- 关键词：MTDNA系统发育
- 珠江水系特有卷口鱼遗传变异的线粒体Cytb基因序列分析被引量：6
- 2010年
- 测定了广西合山、柳州、桂平和广东郁南等4个地理群体43尾卷口鱼线粒体Cytb基因1041bp,结果检测到8个单倍型,7个多态位点。4个地理群体的单倍型多样性为0.248～0.700,核苷酸多样性为0.00022～0.00070,表明所分析的卷口鱼群体单倍型多样性和核苷酸多样性低。在分子系统树上,不同地理来源的卷口鱼混杂分布在一起,没有形成明显的谱系结构和地理聚群;4个群体两两间的Fst值为-0.028～0.116,但均不显著(P>0.08);AMOVA分析表明1.70%(P=0.21)的分子差异来自群体间,而98.3%的分子差异位于群体内部;表明4个地理群体间没有显著遗传分化。单倍型网络图呈星状结构,中性检测Tajima’sD和Fu’sFS均为显著负值,核苷酸不对称分布分析呈单峰模式,表明珠江卷口鱼可能曾经历过种群的快速扩张,推测在晚更新世(1.5～3.9万年前)出现种群扩张。
- 范凤娟章群赵爽李名立周佳怡余帆洋唐优良
- 关键词：细胞色素B基因珠江水系
- 中华鳖线粒体遗传变异的细胞色素b序列分析被引量：1
- 2011年
- 测定并分析了长江水系14尾中华鳖(Pelodiscus sinensis)的线粒体细胞色素b基因1 140 bp序列,结合GenBank中下载的3个序列,发现了243个变异位点,61个简约信息位点;A+T含量(60.6%)明显高于G+C含量(39.4%);17个中华鳖序列中共存在10个单倍型,单倍型多样性(Hd)为0.882,核苷酸多态性(Pi)为0.01002。在分子系统树上,17个样本共形成3个谱系,其中长江中下游出现遗传距离为0.023的2个谱系,谱系A由7个单倍型(共14尾)组成,谱系C由2个单倍型(共2尾)组成。韩国1尾单独为谱系B,与A、C谱系之间的遗传距离分别为0.030、0.031。推测3个谱系间分化时间约为5百万年,建议分别加以保护。长江中下游不同地理来源的个体混杂分布,没有形成明显的地理聚群,不同群体间的遗传变异大于群体内的遗传变异。中性检测Tajima’s D和Fu’s Fs均为显著负值,核苷酸不对称分布分析呈多峰型,表明中华鳖未经历过种群扩张。
- 余帆洋章群唐优良周佳怡
- 关键词：中华鳖细胞色素B
