丛艺
- 作品数:4 被引量:14H指数:3
- 供职机构:中国海洋大学更多>>
- 发文基金:青岛市科技发展计划项目国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:生物学化学工程更多>>
- 文昌鱼嘌呤代谢酶基因:结构与演化被引量:5
- 2009年
- 嘌呤代谢是动物含氮废物排出体外的重要途径之一。嘌呤代谢终产物在不同动物各不相同。这是由于进化过程中,参与代谢1种或多种酶基因或者酶活性的丢失所致。本文从JGI网站佛罗里达文昌鱼基因组数据库中搜索文昌鱼参与嘌呤代谢主要5种酶(黄嘌呤脱氢酶、尿酸酶、尿囊素酶、尿囊酸酶、尿素酶)的基因,并且将它们与其他12种具有代表性且基因组序列已知的动物包括人、小鼠、狗、鸡、爪蟾、河豚、斑马鱼、海鞘、海胆、果蝇、线虫、海葵的基因结构进行比较。结果发现文昌鱼参与嘌呤代谢的酶基因有的和脊椎动物基因相似(黄嘌呤脱氢酶和尿酸酶),有的和脊椎动物与无脊椎动物的基因都不相似(尿囊酸酶),还有的和无脊椎动物海胆与海葵基因外显子个数与内含子相位都相似但外显子之间缺乏对应关系(尿素酶)。所有这些都支持文昌鱼代表脊椎动物始祖代表类型,同时兼具特化特征的观点。尿素酶基因存在于水生无脊椎动物中,而在陆生的果蝇和线虫中均未发现尿素酶基因,因而我们推测随着动物由水生向陆生进化,参与尿素分解的尿素酶基因可能在陆生动物中完全丢失。
- 张宇丛艺张士璀
- 关键词:文昌鱼嘌呤代谢基因结构进化
- 文昌鱼Apolipoprotein D基因结构和调控元件的进化分析及体外表达和功能研究
- 文昌鱼是现存的与脊椎动物原始祖先最接近的头索动物,一直被认为是研究脊椎动物起源和进化的模式动物。文昌鱼的基因序列和表达模式已经被广泛用于不同物种之间的比较基因组学研究和发育同源性分析。
载脂蛋白D(ApoD)属...
- 丛艺
- 关键词:文昌鱼D基因调控元件体外表达
- 文献传递
- 硫氧还蛋白及其相关蛋白的研究进展被引量:6
- 2008年
- 丛艺蒋圣娟张士璀
- 关键词:氧化还原状态相关蛋白二硫键还原型谷胱甘肽氧化还原环境
- 载脂蛋白ApoD:系统发生、基因结构与表达调控被引量:4
- 2008年
- 载脂蛋白D(ApoD)属于脂蛋白家族,目前对ApoD的研究集中在基因表达、组织分布和具体功能上,而对其包括调控区在内的基因组结构分析相对较少,而该部分内容对进一步了解和阐明ApoD蛋白功能有重要意义。本文从生物信息学角度对分属于原生动物、无脊椎动物、头索动物和脊椎动物类群的10种动物ApoD的基因结构及调控区的调控元件的分析及比较,发现:(1)ApoD基因结构从原生动物草履虫到原口动物再到后口动物海胆的进化过程中不保守,但在分析的几种脊椎动物中相当保守;(2)文昌鱼ApoD基因扮演从无脊椎动物到脊椎动物承上启下的角色,代表脊椎动物ApoD基因原型;(3)调控区大多数调控元件为不同动物共有,说明ApoD功能及其表达调控在进化中的保守性;(4)ApoD基因个别调控元件是随着物种进化而出现并开始发挥相关作用,如SF-1;还有个别的调控元件在进化过程中还没有发现其规律,这可能说明A-poD的某些功能因物种不同存在一定差异。
- 蒋圣娟丛艺张士璀张宇
- 关键词:载脂蛋白脂蛋白基因结构调控元件文昌鱼