李玲
- 作品数：3 被引量：12H指数：2
- 供职机构：中国海洋大学海洋生命学院更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划山东省农业良种工程项目国家现代农业产业技术体系建设项目更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 栉孔扇贝EST-SNP标记开发及多态性分析被引量：10
- 2013年
- EST(表达序列标签)数据库发掘是单核苷酸多态性标记(SNP)开发的重要途径。本研究利用栉孔扇贝转录组测序数据进行SNP筛选,在含有4条EST以上的18 780条contig(拼接序列)中,共获得21 813个候选SNP位点。利用高分辨率熔解曲线结合非标记探针技术,对其中90个位点在4个野生群体中进行了位点多态性检测。得到33个(36.7%)具有二等位基因位点,并对其中26个位点进行了功能注释。进一步的标记验证显示,33个多态位点在青岛野生群体的48个个体中均成功分型,其观测杂合度Ho和期望杂合度He的分布范围分别为0.062 5～0.744 7和0.099 8～0.504 6,其中5个位点偏离Hardy-Weinberg平衡,各位点间没有检测到连锁不平衡。研究为栉孔扇贝群体遗传学和遗传育种分析提供了候选标记。
- 李纪勤包振民李玲胡晓丽
- 关键词：栉孔扇贝单核苷酸多态性表达序列标签
- 栉孔扇贝转录组来源单核苷酸多态性位点的多态性分析
- 2012年
- 应用高分辨率熔解曲线技术对栉孔扇贝转录组来源的单核苷酸多态性位点进行验证分型和多态性分析。根据栉孔扇贝转录组单核苷酸多态性位点序列信息,对其中150个位点设计引物和探针,在4个栉孔扇贝野生群体中进行验证分型。其中,103对引物扩增出目的产物,76个位点成功分型,58个多态位点中51个是二等位多态性单核苷酸多态性(34.0%)。进一步在荣成野生群体中对51个二态单核苷酸多态性位点进行多态性验证和群体遗传学分析,其中49个位点呈现多态性,且均为二态,最小等位基因频率为0.0610～0.5000,观测杂合度和期望杂合度分别为0.0833～0.8889和0.0833～0.5833。经Boferroni校正,有2个位点(C1630S115_AG和C19848S286_CA)在该群体中偏离Hardy-Weinberg平衡。各位点之间未检测到连锁不平衡。这些多态单核苷酸多态性位点可用于栉孔扇贝连锁图谱构建、分子标记辅助育种以及数量性状的基因定位等遗传学研究。
- 李玲包振民李纪勤王师张玲玲陆维胡晓丽
- 关键词：单核苷酸多态性高分辨率熔解曲线栉孔扇贝
- 人工诱导栉孔扇贝雌核发育胚胎的SNP标记分析被引量：2
- 2014年
- 利用紫外线照射灭活的同源精子，激活栉孔扇贝（Chlamys farreri）卵子分裂，获得雌核发育胚胎，流式细胞仪检测胚胎细胞平均单倍体率为82．5％。对获得的胚胎进行全基因组扩增，获得足量的基因分型模板，利用高分辨率溶解曲线（HRM）技术对其进行96个单核苷酸多态性（SNP）位点分型。结果显示，诱导雌核发育胚胎的位点检出率为96．27％，其中99．06％的位点分型结果与相应雌性亲本相符；单个胚胎中只表现一种等位形式的位点占91．67％～96．88％，平均为94．81％，较雌性亲本的纯合位点比例（64．25％）明显提高。本研究利用灭活同源精子诱导获得栉孔扇贝雌核发育胚胎，并利用单个胚胎的全基因组扩增产物进行基因位点分析，为扇贝人工诱导雌核发育个体的早期多基因位点检测和评价提供参考。
- 陈亮赵柏淞李玲商文聪胡晓丽包振民
- 关键词：栉孔扇贝雌核发育全基因组扩增单核苷酸多态性
