贺晓燕
- 作品数：8 被引量：14H指数：3
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- 一种高通量同时测序多样本CDR3受体库的方法
- 本发明公开了一种高通量同时测序多样本CDR3受体库的方法，根据V基因家族的同源性，只设计一套TCR或BCR链可变区V基因家族上游引物，然后通过设计与样本等数量的适合和上游引物配对的TCR或BCR链的C或J基因特征性下游引...
- 姚新生贺晓燕
- 文献传递
- 1月龄Balb/c小鼠胸腺、脾脏、肝脏、小肠和血液TRBV-TRBJ1-1 CDR3谱型分析被引量：1
- 2012年
- 目的初步分析1月龄Balb/c小鼠胸腺、脾脏、肝脏、小肠和血液中TRBV-TRBJ1-1 CDR3谱型特征。方法提取1月龄Balb/c小鼠胸腺、脾脏、肝脏、小肠和血液样本的总RNA,逆转录成cDNA,以22条TRBV基因家族为上游引物,共同的TRBJ1-1基因为下游引物(荧光标记),PCR扩增包含完整CDR3区片断,毛细管电泳激光DNA扫描技术分析CDR3谱型的长度和多态性。结果胸腺样本毛细管电泳激光扫描图呈现标准的中间高两端低的多态性分布;各家族CDR3区最长和最短比较,多数为相差8～15个氨基酸的谱型分布。脾脏、肝脏、小肠、血液样本扫描图显示多数家族呈多态性分布,但均出现数量不等的单峰、寡峰、偏峰、低峰;多数家族表现为相差3～13个氨基酸的谱型分布,部分家族在预测大小位置无对应峰型。结论 1月龄Balb/c小鼠胸腺中基本包含TCR基因随机重排的多种克隆性T细胞;脾脏、肝脏、小肠、血液表现为单、寡、多克隆形式的T细胞分布,部分家族T细胞缺失,本实验结果可为进一步研究Balb/c小鼠的T细胞发育、分布、应答及CDR3谱型与疾病关系提供方法和基础。
- 贺晓燕王鹏马锐姚新生
- 关键词：T淋巴细胞受体互补决定区3基因扫描
- 一种高通量同时测序多样本CDR3受体库的方法
- 本发明公开了一种高通量同时测序多样本CDR3受体库的方法，根据V基因家族的同源性，只设计一套TCR或BCR链可变区V基因家族上游引物，然后通过设计与样本等数量的适合和上游引物配对的TCR或BCR链的C或J基因特征性下游引...
- 姚新生贺晓燕
- 基于荧光定量PCRDNA熔解曲线技术分析浸润性导管乳腺癌患者外周血和肿瘤组织TCR beta链CDR3谱系（英文）被引量：4
- 2016年
- 目的采用TCR beta链CDR3谱系荧光定量PCR的DNA熔解曲线技术,探讨浸润性导管乳腺癌患者外周血T细胞和肿瘤组织T细胞之间TRBV基因表达情况。方法从遵义医学院附属医院甲乳外科采集乳腺癌志愿患者的乳腺肿瘤组织和外周血样本,选取病理诊断为浸润性导管癌的志愿患者23例,免疫组织化学检测ER、PR、PS2、C-erb B-2、nm23、P53和Ki-67的表达。分离每位志愿患者外周血单个核细胞(PBMCs),提取PBMCs和肿瘤部位组织总RNA,逆转录为c DNA,荧光定量PCR技术扩增各c DNA样本的TCR beta链CDR3区,DNA熔解曲线法对比分析各样本TRBV基因家族的表达情况。结果 23例浸润性导管乳腺癌志愿患者,外周血样本中TRBV6、TRBV8、TRBV12、TRBV14和TRBV24表达超过50%,肿瘤组织样本中TRBV6、TRBV12、TRBV14和TRBV24表达超过50%。选取的23例样本中的20例,其外周血和肿瘤组织均过表达相同的TRBV基因家族,但总TRBV基因家族的表达与ER、PR、PS2、C-erb B-2、nm2、P53和Ki-67的阳性或阴性没有明显的相关性。结论浸润性导管乳腺癌患者的外周血和肿瘤组织之间TRBV基因表达出现一致性,但表现出复杂多样性,与乳腺肿瘤相关抗原无明显相关,其机制可能与乳腺癌个体化的全身和局部免疫应答相关,对乳腺癌外周血和肿瘤组织部位特异T细胞TRBV基因表达探讨可为乳腺癌的免疫机制和个体化治疗提供理论基础。
- 贺晓燕孙素红杨伟明唐文台马锐张天姚新生
- 关键词：TCR
- Roche 454高通量测序初步分析不同月龄BALB/c小鼠胸腺和脾脏T细胞TRBV-TRBJ1-1 CDR3受体库的组成和特征
- 研究背景:T/B淋巴细胞的TCR/BCR CDR3受体库的解析一直是免疫学的中心内容之一,在T/B细胞的发育、进化、分化、增殖成熟、亚群等研究以及T/B细胞与感染、肿瘤、自身免疫病、干细胞和器官移植等理论和实践研究中广泛...
- 王鹏贺晓燕周丽马龙石斌马锐姚新生
- 关键词：互补决定区3ROCHE
- CE&HTS技术初步分析母子间外周血T细胞TRBVF&P基因家族CDR3组成和特征
- 目的：
(1)采用毛细管电泳(CapillaryElectrophoresis,CE)基因扫描技术初步分析母与子志愿者外周血T细胞26TRBV基因(TCRbetachainvariablegene,TRRV)家族C...
- 贺晓燕
- 关键词：互补决定区
- 文献传递
- T细胞TCR CDR3受体库的高通量测序分析概况被引量：7
- 2011年
- T细胞是机体免疫功能的执行者,T细胞受体(TCR)是T细胞表面识别抗原的分子,也是T细胞产生免疫应答的第一个关键分子。TCR由胚系基因于胸腺中进行V(D)JC基因重排而形成,发育成熟的T细胞迁移至外周组成多样性的T细胞库,其中最能代表T细胞应答特征的分子为TCR高变区CDR3,在外周形成一个多样性的T细胞CDR3受体库(rep-ertoire),对TCR CDR3受体库研究,将为T细胞生理和病理特征的全面解析提供基础。
- 王鹏贺晓燕王小妹姚新生
- 关键词：T细胞受体高通量测序
- 早期乳腺癌患者化疗前后外周血T细胞TCRβ CDR3组库动态变化特征被引量：3
- 2018年
- 该文采用高通量测序(high-throughput sequencing,HTS)技术分析早期乳腺癌患者化疗前后外周血T细胞TCRβCDR3(T-cell receptor beta chain complementarity determining region 3)组库的组成及动态变化特征,初步探讨化疗对T细胞的可能影响及化疗前后患者T细胞的应答功能状态。以病理活检确诊为T1N0M0期乳腺癌患者为研究对象,选取进行6期TAC[多西他赛(docetaxel,T)、吡柔比星(pirarubicin,A)、环磷酰胺(cyclophosphamide,C)]化疗方案。化疗的3例志愿患者(P1、P2、P3)分别于化疗前、第3期化疗后、第6期化疗后采集外周血分选出单个核细胞(peripheral blood mononuclear cells,PBMCs),提取其总DNA;利用多重PCR建立TCRβCDR3组库进行HTS;采用Immuno SEQ和IMGT-High-V-quest系统对TCRβCDR3序列进行组成和特征分析。结果表明:(1)P1、P2、P3在第3期化疗后的CDR3组库多样性[用反辛普森指数(1/DS)表示]相比化疗前均升高;第6期化疗后,P1和P3相比第3期化疗后CDR3组库多样性降低,但P2相比第3期化疗后CDR3组库多样性升高;(2)P1和P3在第3期化疗后CDR3组库高频克隆(大于1%)较化疗前出现降低,而第6期化疗后CDR3组库高频克隆相比第3期化疗后明显升高;P2第3期化疗后和化疗前相比CDR3组库高频克隆无变化,但第6期化疗后明显降低;(3)P1和P2化疗前后出现部分TRBV基因取用丢失与重新取用,P3的TRBV基因取用未发生明显改变;P2和P3化疗后部分TRBV与TRBJ优势配对消失。早期乳腺癌患者TAC化疗的前、中、后期,其外周血T细胞TCRβCDR3组库表现出个体化的多样性和特征性改变,可能与TAC对个体T细胞的抑制或杀伤相关。监测CDR3组库的组成及动态变化可为化疗对T细胞的影响及化疗前后"个体化"的T细胞免疫状态评估提供基础。
- 杨丽文孙素红张天段芳芳贺晓燕马锐马龙石彬姚新生
- 关键词：高通量测序技术乳腺癌化疗
