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基于逐步回归所得变量集的遗传反向传播神经网络的QSAR研究被引量：3: 2010年; 本文针对存在巨大数量变量体系,如采用遗传变量筛选的反向传播人工神经网络方法(GA-BPANN)进行构效建模,由于BPANN计算收敛速度慢且易陷入局部极小而使得计算需要耗费大量训练拟合时间的特点,提出了在扩展逐步线性回归(FSR)筛选得到变量集的基础上,利用GA-BPANN分析其中的非线性关系的方法。首先对收集到的120个青蒿素类化合物,采用DFT/B3PW91/6-31G量子化学方法优化其结构,然后计算得到57个非零分子全息电距矢量(MHEDV)结构参数。5种不同隐层神经元数目的GA-BPANN拟合分析结果均优于直接逐步线性回归(FSR)分析结果,其中n-4-1的BPNN网络的最优模型结果为:R^2=0.900,S=0.493,F=787.936,R_(ex)~2=0.840,S_(ex)=0.730,F_(ex)=147.341。该分析结果表明:基于扩展FSR筛选的变量集的GA-BPANN方法确实是1种优秀且经济可行的预测先导化合物活性好方法。; 陈国华陆瑶陈虹; 关键词：青蒿素遗传算法反传神经网络

支持矢量机和线性判别分析对细胞穿透肽的识别: 2010年; 选取25条CPP和16条非CPP作为训练集样本,以61条CPP和21条非CPP为预测集样本.利用氨基酸的z-Scale对肽链进行编码,分别使用原始72个自交叉协方差变量和它们的主成分矢量进行线性判别(LDA)和支持矢量机(SVM)分类研究.当采用LDA方法时,对于训练集的预测以及它们的留一法交互检验,均获得比较优越的结果,但对预测集的预测总的识别率的最优结果仅为57.3%.分别利用主成分和原始变量集作为SVM的输入建立的非线性识别模型,对训练集的总识别率分别为85.4%和100%,留一法交互检验的总识别率分别为80.5%和75.6%,对预测集的最优总识别正确率为74.4%.识别结果表明SVM能够比较好的提取原始变量间的细微模式变化,对CPP总的识别结果优于LDA.; 陈国华夏之宁陆瑶; 关键词：细胞穿透肽支持矢量机 QSAR

一种新型手性分子电性矩边矢量(Vmedc)的设计及其应用被引量：5: 2008年; 根据分子中不同类型原子间电相互作用的不同,文中提出了一种手性分子电矩边矢量(Vmedc),进一步拓展分子电矩边性矢量(Vmed)使用范围.为检测该手性描述矢量的结构表达特性和模型预测能力,分别对32个培哚普利拉类血管紧张素转化酶(ACE)抑制剂的对映结构体和7对苯基哌啶类σ-受体抑制剂进行考察.32个ACE抑制剂多元逐步回归系数R=0.913(R2=0.834,SD=0.768,F=33.875),留一法交互检验为Rcv=0.877(Rcv2=0.769,SDcv=0.906,Fcv=22.473),具有较强预测能力;继而用BP神经网络,对60组随机样本(23:9)进行留分法分析取得较好结果,训练集平均为:RTraining=0.931(RTraining2=0.967),预测集为:Rcv=0.918(Rcv2=0.842);而对14个σ-受体抑制剂多元回归(R=0.955,Rcv2=0.849)获得与文献一致结果.再用Fisher线性判别方法和BP神经网络对ACE抑制剂进行判别分析,其活性分类88.89%正确(仅9号错误),非活性分类100.0%正确,总分类正确率为96.87%.两个数据集测试证明该方法与其它文献方法相当,这为定量构效关系(QSAR)研究提供一种新选择,扩充了Vmed描述矢量应用范围。; 陈国华夏之宁陆瑶廖立敏舒茂孙家英李志良; 关键词：ACE抑制剂手性反传神经网络 FISHER判别分析

在反胶束中酶促合成短肽的研究进展被引量：1: 2007年; 短肽广泛存在于生物体内,目前已成为世界范围内研究的热点之一。大量研究表明,人工合成短肽具有高效、专一性、易分离等优点。本文对在反胶束中酶促合成短肽的进展进行了综述,并对其应用进行了展望。; 陈国华陆瑶; 关键词：短肽反胶束酶促合成

皮质激素类手性药物的三维原子场全息作用矢量(3D-HoVAIF)研究被引量：1: 2009年; 针对仅包含原子间拓扑连接信息而不包含原子间空间位置信息的2D拓扑描述子无法直接编码手性化合物的缺陷,本文采用本实验室基于受配体原子间弱相互作用而提出的三维原子场全息作用矢量(3D-HoVAIF)编码11对皮质激素类手性化合物。其多元线性逐步回归发现,由手性原子的手性变化而导致的分子空间结构变化,能够很好地被3D-HoVAIF描述子所描述,留一法交互检验得到最佳回归模型为:R^2=0.882,q^2=0.707。这充分说明3D-HoVAIF具备了比较好的对手性化合物的编码能力,为手性化合物的定量构效关系研究提供了一种新的研究方法选择。; 陆瑶陈国华李志良; 关键词：皮质激素 QSAR 手性

肌肽抗氧化机理及其生物活性研究现状被引量：11: 2007年; 肌肽是主要存在动物肌肉中的二肽,作为一种新型高效低毒的天然抗氧化剂日益受到关注。文章对天然肌肽抗氧化机理及其生物活性的研究进展进行了综述,并对其应用进行了展望。; 陆瑶陈国华; 关键词：抗氧化机理生物活性

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陆瑶