贺倩
- 作品数:2 被引量:9H指数:1
- 供职机构:兰州生物制品研究所有限责任公司更多>>
- 相关领域:生物学医药卫生更多>>
- 疫苗制备中外源病毒检测方法被引量:9
- 2014年
- 疫苗安全性是公众及药品监管机构非常关注的问题。由于疫苗生产原材料如组织、细胞基质、血清、胰蛋白酶等来源于动物,因此疫苗产品存在外源病毒污染的风险。外源病毒对人有潜在危害,实施系统性的检测和采取严格的预防措施可以有效降低外源性因子污染的风险。几十年来,某些经典的检测法已经成为广谱筛查外源病毒污染的标准方法,但其存在一定的局限性。随着大规模基因并行测序、微阵列等分子生物学检测新方法的建立,疫苗外源因子检测方法日趋多样化,增加了检测疫苗外源因子污染种类和概率。
- 贺倩魏至栋鱼轲
- 关键词:疫苗外源病毒污染
- 轮状病毒非结构蛋白NSP1与干扰素调节因子结合结构域的分析
- 2016年
- 目的同源模建轮状病毒NSP1 C末端效应区及干扰素调节因子IRF3、IRF5、IRF7结合结构域(IAD)的三维结构,应用分子对接的方法,预测NSP1与IRF的候选结合氨基酸残基。方法以Prot Scale进行疏水性分析,APBS进行表观静电势的分析,采用MODELLER程序进行三维结构的预测,对NSP1 C末端效应区和IRF3、IRF5、IRF7的IAD应用PLATINUM程序进行分子对接,寻找它们的结合位点。结果 NSP1与IRF3、IRF5、IRF7的作用表现为2个不同类型,其中NSP1与IRF3的作用位点集中在效应区LEU 3~ARG 67一个较大范围内;作用方式呈现多样性(疏水作用、芳香共轭作用以及氢键作用);NSP1与IRF5、IRF7的作用位点集中在效应区SER74~GLU87一个较小的范围内,作用方式也表现为单一的氢键作用。结论应用计算机模拟技术预测了NSP1和IRF3、IRF5、IRF7的作用方式及结合位点,为进一步研究NSP1对IRF的作用提供一些新的思路。
- 邢家强李佳林贺倩李宏斌于梅林杰窦强魏至栋
- 关键词:同源模建分子对接