牛玉清
- 作品数：2 被引量：7H指数：1
- 供职机构：塔里木大学生命科学学院新疆生产建设兵团塔里木盆地生物资源保护利用重点实验室更多>>
- 发文基金：博士科研启动基金塔里木大学校长基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 绵羊MSTN基因结构和功能的生物信息学分析被引量：7
- 2011年
- 为了研究绵羊肌肉生长抑制素(MSTN)基因结构和功能,试验采用生物信息学方法对其编码蛋白的结构、理化性质、信号肽、跨膜结构、亚细胞定位、功能分类、二级结构、高级结构和功能结构域进行生物信息学分析并推测与其他物种的生物进化关系。结果表明:绵羊MSTN蛋白是一个疏水性不稳定蛋白,作为信号肽的可能性很大;含有9个α-螺旋、11个β-折叠、25个β-转角、1个跨膜结构区域,其功能域可能位于278～375位氨基酸处;绵羊MSTN基因在人、牛、黑猩猩、大鼠、狗、鸡等物种中与牛的亲缘关系最近。
- 牛玉清李树伟
- 关键词：绵羊生物信息学
- 新疆南部地方品种绵羊MSTN基因功能区的克隆及其蛋白二级结构和抗原表位的预测被引量：1
- 2011年
- 为了确定新疆南部地方品种绵羊肌生成抑制素（MSTN）成熟蛋白的功能区及二级结构和B细胞抗原表位,根据GenBank中绵羊肌生成抑制素基因序列及其所编码蛋白质的序列,应用GenBank的Blast功能检索其蛋白的功能区,并设计引物克隆新疆南部地方品种绵羊MSTN功能区基因,进行序列测定。然后运用DNAStar软件和www.expasy.org在线服务器等生物信息学方法分析其蛋白的二级结构,并通过Jameson-Wolf法、Kyte-Doolittle法、Emini法、Karplus-Schulz法、Hopp＆Woods法、Welling法分别预测其抗原指数、亲水性、表面可及性、柔韧性和抗原性等参数,并综合分析、预测该蛋白的B细胞抗原表位。结果表明：克隆出的MSTN功能区基因经测序和比对后与GenBank上Blast的结果相符。绵羊MSTN蛋白的B细胞抗原表位的优势区域最有可能的是肽链的301~305,321~323,331~333,343~344,346,354~356,358位肽段和氨基酸处。
- 牛玉清任述强李树伟金波尹阔赵春霞史惠君
- 关键词：肌生成抑制素蛋白二级结构B细胞抗原表位
