吕佳
- 作品数:3 被引量:50H指数:3
- 供职机构:中国检验检疫科学研究院更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- MALDI-TOF-MS鉴定2008年辽宁省食源性疾病监测系统检出的沙门菌的初步研究被引量:15
- 2011年
- 目的应用MALDI-TOF-MS技术对2008年辽宁省食源性疾病监测检出的24株沙门菌和2株沙门菌标准菌株进行鉴定,并对其中4种血清型的16株沙门菌进行种水平的鉴定。通过MALDI-TOF-MS的相关性分析,研究MALDI-TOF-MS与血清分型结果的相关性及MALDI-TOF-MS对实验的沙门菌的分型能力。方法考察并确定既适合菌株生长又适宜MALDI-TOF-MS分析的沙门菌培养基后,应用MALDI-TOF-MS的相关软件对沙门菌进行数据采集和图谱比对,所得鉴定结果与血清分型结果进行比较。对属于4个种的4株沙门菌的蛋白峰信息进行比较分析。通过生化鉴定及MALDI-TOF-MS的聚类分析及主成分分析讨论4株肠炎沙门菌同源关系。结果 MALDI-TOF-MS技术分别在属和种的水平上准确鉴定了沙门菌株,并且在种的鉴定水平上与血清分型结果具有极大相关性。MALDI-TOF-MS区分了属于4个种的4株沙门菌的蛋白峰之间的微小差异。而且,对相同血清型的4株肠炎沙门菌的聚类分析及主成分分析显示出其同源程度的差异。结论 MALDI-TOF-MS技术在属水平上鉴定沙门菌具有很高的准确性,在种水平上的鉴定也有着很好的应用前景。MALDI-TOF-MS技术可能为沙门菌分型溯源提供一种新的手段。
- 吕佳卢行安刘淑艳蒋丹宋惠君侯君胡英
- 关键词:沙门菌MALDI-TOF-MS血清型
- MALDI-TOF-MS技术鉴定食源性致病菌的影响因素被引量:27
- 2011年
- 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)技术鉴定食源性致病菌在我国尚处于发展阶段。MALDI-TOF-MS鉴定食源性致病菌形成的质谱图反映菌株的生物学信息,也是获得鉴定结果的关键。本文综述了影响MALDI-TOF-MS鉴定的主要因素:基质的选择、食源性致病菌的培养条件、样品的处理方式、数据库资源的更新与补充,以达到减小这些因素的干扰,最大程度地发挥MALDI-TOF-MS技术优势的目的。作为一种便捷的食源性致病菌鉴定技术,MALDI-TOF-MS必将在该领域发挥巨大作用。
- 吕佳卢行安刘淑艳柳媛闫磊初雷
- 关键词:基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱食源性致病菌影响因素
- 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱对阪崎肠杆菌的鉴定被引量:12
- 2013年
- 目的利用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)法对阪崎肠杆菌进行鉴定,建立一种高效检测阪崎肠杆菌的方法,并为该技术的推广使用及阪崎肠杆菌的进一步研究提供科学依据。方法用MALDI-TOF-MS法检测38株野生阪崎肠杆菌、2株标准菌株和1株阴沟肠杆菌,结果与常规生化鉴定结果对比;同时对在不同培养基上培养的阪崎肠杆菌进行质谱分析比较,对比不同培养基对质谱结果是否有影响;对38株野生菌株质谱图进行聚类分析。结果 38株菌株鉴定结果均为阪崎肠杆菌,与生化鉴定结果一致,且质谱鉴定分值大多在2.0以上。通过MALDI-TOF-MS鉴定方法可以很明显地将阴沟肠杆菌与阪崎肠杆菌两种菌分开。4种培养基对MALDI-TOF-MS鉴定结果的影响不是很明显,TSA比较适合作为阪崎肠杆菌MALDI-TOF-MS鉴定的培养基。通过质谱图谱和离子峰值比较得出,所有菌株在5745 m/z附近均出现高的离子峰,在2871、4740、8288、6260和9488 m/z附近出现离子峰的实验菌株达95%以上;在差异水平在0.5时,MALDI-TOF-MS的聚类分析结果可将所有实验菌株分成5个类型,结合菌株对应的来源和种类分析表明本研究所用菌株与来源和种类之间并无明显关系。结论MALDI-TOF-MS方法具有准确且精确鉴定阪崎肠杆菌的能力;离子峰5745m/z具有作为阪崎肠杆菌的标记性离子峰的可能;差异水平为0.5进行MALDI-TOF-MS聚类分析,未发现5个类型与来源等具有一定关系,需要进一步研究。
- 赵红阳吕佳卢雁陈明生刘淑艳蒋丹李宪臻卢行安
- 关键词:阪崎肠杆菌基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱聚类分析