王晓敏
- 作品数：2 被引量：4H指数：1
- 供职机构：国防科学技术大学机电工程与自动化学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术生物学更多>>
- 基于后缀列的基因序列最大串联重复查找技术(英文)被引量：4
- 2006年
- 重复序列分析在全基因组研究中起着重要作用,其首要任务就是在DNA序列中识别并定位所有的重复结构。本文提出了一种新的算法,此算法基于一种简单的数据结构后缀数,用于查找给定的DNA序列中所有的最大串联重复。并且在该算法的基础上编写了一个有效实用的软件RepLocate,同时给出了它应用到已知的DNA序列的实例。
- 王晓敏王正志
- 关键词：基因组序列
- 结合基因表达数据和ChIP-chip数据的酵母转录调控模块的识别
- 2011年
- 活细胞依赖其众多的转录调控模块来实现复杂的生物功能,识别转录调控模块对深入理解细胞的功能及其转录机制有着重要的意义。本文结合酵母基因表达数据和ChIP-chip数据,提出了一种转录调控模块识别算法。该算法通过采用不同的P值阈值分别得到了核心集和粗糙集,然后对核心集和粗糙集进行判别,最后对基因进行扩展之后得到基因转录调控模块。将该算法运用到两个酵母基因表达数据中,得到了一些具有显著生物学意义的基因转录调控模块。与其它算法相比,该算法不仅可以识别含有较多基因的转录调控模块,而且可以识别一些其它算法不能识别的基因转录调控模块。识别得到的基因转录调控模块有着不同的生物学功能,并且有助于进一步理解酵母的转录调控机制。
- 王晓敏王正志王广云黎刚果
- 关键词：基因表达数据酵母
