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宋洋

作品数：31 被引量：160H指数：8
供职机构：中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所更多>>
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相关领域：医药卫生农业科学更多>>

合作作者

文献类型

  • 31篇中文期刊文章

领域

  • 30篇医药卫生
  • 1篇农业科学

主题

  • 21篇病毒
  • 10篇柯萨奇
  • 10篇柯萨奇病毒
  • 9篇手足
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  • 9篇手足口病
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  • 5篇CV
  • 4篇疫情
  • 4篇基因特征
  • 4篇基因特征分析
  • 4篇基因亚型

机构

  • 31篇中国疾病预防...
  • 8篇中国科学院
  • 6篇安徽理工大学
  • 4篇潍坊医学院
  • 3篇卫生部
  • 3篇山东第一医科...
  • 2篇湖南省疾病预...
  • 2篇河南省疾病预...
  • 2篇河北省疾病预...
  • 2篇云南省疾病预...
  • 2篇宁夏疾病预防...
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  • 1篇广东省疾病预...
  • 1篇广西壮族自治...
  • 1篇江苏省疾病预...
  • 1篇山西农业大学
  • 1篇中国医科大学
  • 1篇辽宁省疾病预...
  • 1篇宁夏医科大学
  • 1篇中国科学技术...

作者

  • 31篇宋洋
  • 23篇许文波
  • 18篇张勇
  • 10篇严冬梅
  • 10篇冀天娇
  • 8篇杨倩
  • 7篇祝双利
  • 6篇许文波
  • 5篇张勇
  • 5篇张燕
  • 4篇向妮娟
  • 4篇王东艳
  • 4篇陈操
  • 3篇王佶
  • 3篇涂文校
  • 3篇孟玲
  • 3篇王世文
  • 3篇赵翔
  • 3篇许文波
  • 3篇孙强

传媒

  • 22篇病毒学报
  • 3篇疾病监测
  • 2篇国际病毒学杂...
  • 2篇中国病毒病杂...
  • 1篇科学通报
  • 1篇中华流行病学...

年份

  • 8篇2023
  • 2篇2022
  • 10篇2021
  • 5篇2020
  • 1篇2019
  • 3篇2018
  • 1篇2017
  • 1篇2016
共 31 条 记 录，以下是 1-10
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排序方式：
2017~2018年河北省重症手足口病的主要致病病原体为柯萨奇病毒A组6型被引量：8
2020年
肠道病毒是引起重症手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)的主要病原体,近年来引起重症手足口病的病原谱正在发生变化,这为病原谱的检测带来了困难,而包括高通量测序(High-throughput sequencing,HTS)在内的新技术为明确重症手足口病的病原谱提供了帮助。为了明确河北省2017~2018年重症手足口病的病原谱,本研究采集2017~2018年河北省重症HFMD病例的50份标本(2017年29份,2018年21份)进行病毒分离,从23份标本中分离到病毒,采用一代测序方法获得其全长VP1区序列,而其余27份标本未能直接分离到病毒,其中17份采用高通量测序的方法获得了部分或者全长基因组序列。序列分析结果显示,近年来河北省重症HFMD的肠道病毒病原谱发生了较大变化,2017年重症HFMD标本中,10份检出肠道病毒A组71型(Enterovirus A71,EV-A71),1份检出柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CV-A16),10份检出柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)(其中高通量测序检出5份),还有3份检出其他肠道病毒;2018年重症HFMD标本中,1份检出CV-A16,7份CV-A6通过高通量测序检出,5份检出柯萨奇病毒A组10型(Coxsackievirus A10,CV-A10)(其中高通量测序检出3份),还有3份检出其他肠道病毒。通过高通量测序,可检出病原体的重症标本由原来的23份上升到40份,可检出CV-A6的标本由5份上升到17份,CV-A10由2份上升到5份;重症病例病原谱中CV-A6所占的比例由21.7%(5/23)上升到42.5%(17/40),CV-A10由8.7%(2/23)上升到12.5%(5/40),而EV-A71由于病毒分离比较敏感,含有EV-A71的标本病毒分离全部是阳性,高通量测序并没有多检出,在病原谱中的比例由43.5%(10/23)下降到25.0%(10/40)。RAxML构建的CV-A6和CV-A10的VP1区的系统发育树显示,CV-A6属于中国流行的优势基因亚型D3a,CV-A10属于中国流行的优势基因型C。河北重症HFMD标本检测到的两株CV-A6与其余中国CV-A6序列的3D区的核苷酸相似度为76.4%~98.9%,氨�
肖金波于秋丽张勇张勇宋洋路环环韩振志刘莹莹刘莹莹冀天娇严冬梅祝双利许文波
关键词：病原谱
2015~2018年柯萨奇病毒A组6型在黑龙江省的持续流行被引量：9
2020年
手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)是一类常见的儿童传染病,自2009年以来,柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)已经成为引起HFMD流行持续循环的重要病原之一,是其他肠道病毒(Enterovirus,EV)中的优势病原,而黑龙江省CV-A6相关研究报道尚欠缺。本研究为了解2015~2018年黑龙江省HFMD流行概况和病原学组成,并分析该地区CV-A6的基因特征,收集2015~2018年黑龙江省HFMD疫情资料进行流行病学分析,并采集HFMD病例临床标本进行EV核酸检测。对分离出的EV毒株进行CV-A6的特异性荧光定量PCR法检测,对所有CV-A6阳性毒株进行全长VP1区扩增和核苷酸序列测定,并与GenBank上下载的CV-A6分型代表株构建系统进化树,以了解CV-A6的基因特征。流行病学结果显示,2015~2018年黑龙江省HFMD疫情平稳且2017年有所下降,无死亡病例。黑龙江省每年7月~8月为HFMD流行高峰,患病人群平均年龄为(4.39±3.74)岁,男女患病比例为1.44∶1。全省13个地市均收集到标本,哈尔滨市标本数最多,占36.77%。2015~2018年在黑龙江省共分离到69株CV-A6,与CV-A6原型株的核苷酸相似性为81.8%~83.9%,氨基酸相似性为94.0%~96.3%,均属D3基因亚型的D3a进化分支。尽管肠道病毒A组71型(Enterovirus A71,EV-A71)和CV-A16为主要病原,但D3基因亚型的CV-A6也已成为引起黑龙江省HFMD流行的稳定型别之一,且有加强的趋势,因此应加强CV-A6疫情的监控和分析,为该地区HFMD防控及疫苗研制提供基础数据。
张曼陈淑红陈淑红张勇张勇宋洋许军孙巍杨明路环环许文波刘志军许文波
2017~2018年宁夏回族自治区手足口病流行特征及CV-A6基因特征分析被引量：6
2020年
手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)是一种常见的儿童急性传染病,近年来由柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)引起的HFMD病例不断增多,CV-A6已逐渐成为HFMD的主要病原体之一。为了解2017~2018年宁夏回族自治区HFMD的流行特征及其病原谱构成,并分析CV-A6的基因特征,本研究收集2017~2018年宁夏回族自治区HFMD的流行病学资料,分析其流行特征及主要致病病原体;采集HFMD临床标本,并使用RD细胞进行病毒分离;对分离出的肠道病毒(Enterovirus,EV)毒株进行全长VP1区扩增及核苷酸序列测定,使用分子定型法鉴定其血清型,选取鉴定结果为CV-A6的序列与GenBank上下载的其他地区的CV-A6代表株共同构建系统进化树。结果显示,2017年宁夏HFMD的主要致病病原体为肠道病毒A组71型(EV-A71)(56.18%)和非EV-A71非CV-A16的其他EV(37.39%),2018年的主要病原为非EV-A71非CV-A16的其他EV(70.72%)和CV-A16(27.70%)。2017和2018年,非EV-A71非CV-A16的其他EV中CV-A6所占比例分别为64.86%(24/37)和70.59%(12/17)。35株CV-A6宁夏株获得全长VP1序列,与CV-A6原型株之间的核苷酸序列相似性为81.8%~83.8%,氨基酸序列相似性为94.0%~96.3%,所有宁夏CV-A6分离株均属于D3基因亚型的D3a进化分支。2017~2018年宁夏HFMD病原谱中,非EV-A71非CV-A16的其他EV已成为主要病原体,其中CV-A6所占比例最大。因此,应加强对CV-A6的监测,医院、疾控以及托幼机构等相关人员应提高对CV-A6引起的HFMD的识别与处置能力,这对HFMD防控具有重要意义。
梁月玲张勇詹军詹军马江涛韩振志宋洋宋洋陈慧袁芳马学旻严冬梅
关键词：基因特征
2021年4月中国大陆需关注的突发公共卫生事件风险评估被引量：5
2021年
目的评估2021年4月在我国大陆地区发生或者可能由境外输入的突发公共卫生事件风险。方法根据国内外突发公共卫生事件报告及重点传染病监测等各种资料和部门通报信息,采用专家会商法,并通过视频会议形式邀请省(自治区、直辖市)疾病预防控制中心专家参与评估。结果预计2021年4月突发公共卫生事件的报告数将逐步回归至新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情大流行前5年的平均水平。在我国防控策略未改变的情况下,随着疫苗接种和气温回升,4月面临COVID-19境外输入及续发本地传播风险将较3月有所下降。我国大部分省份尤其南部和东部省份手足口病将持续上升。诺如病毒肠炎暴发疫情仍将处于较高水平。发热伴血小板减少综合征可能高于2020年以及前5年平均水平。流行性出血热仍处于春季小高峰、疫情水平可能类似往年同期。结论特别关注COVID-19,重点关注手足口病,一般关注诺如病毒肠炎、发热伴血小板减少综合征、流行性出血热。
涂文校靳淼黄晓霞刘凤凤宋洋王富珍孟玲魏依侬向妮娟
关键词：突发公共卫生事件传染病疫情风险评估
埃可病毒11型利用双受体CD55和FcRn侵染细胞的分子结构基础
2020年
埃可病毒11型属于小RNA病毒科,肠道病毒属,是B族肠道病毒中的一个重要血清型.埃可病毒11型可导致儿童和青少年脑炎和脑膜炎等疾病,在婴儿和新生儿中导致重症感染甚至致命的病例也时有报道.此外,埃可病毒11型还多次在新生儿和婴幼儿群体中引起暴发性感染,如2019年中国广东省发生的院内感染暴发事件,造成了19例新生儿的感染和5例死亡,严重威胁人类健康和公共卫生安全.CD55是20世纪90年代初发现的部分埃可病毒的吸附受体,该受体可以帮助病毒吸附在细胞表面,但并不能介导病毒完成完整的入侵过程.我们在2019年的研究中,发现了人新生儿Fc受体(neonatal Fc receptor,FcRn)是B族肠道病毒的通用脱衣壳受体,并以埃可病毒6型为例解析了病毒入侵机制.本研究利用冷冻电子显微镜技术,解析了埃可病毒11型在入侵过程中不同pH条件下各阶段的病毒颗粒结构,以及病毒与两受体的复合物,共10个原子或近原子水平高分辨率冷冻电子显微镜结构,并结合表面等离子共振(surface plasmon resonance,SPR)和脂质体模拟试验等分子水平试验,系统地阐述了埃可病毒11型利用CD55和FcRn"双受体系统"入侵细胞的分子机制.埃可病毒11型利用其VP2、VP3结构域与吸附受体CD55的3、4两个短同源重复(short consensus repeat,SCR)结构域结合,结合后病毒颗粒不发生变构.病毒与脱衣壳受体Fc Rn结合之后,开始发生变构,并可在脂质体膜的辅助作用下释放遗传物质完成脱衣壳.与埃可病毒6型不同的是,埃可病毒11型结合FcRn之后在中性条件下即可起始变构.本项研究解析了重要病原埃可病毒11型侵染细胞的分子结构基础,并进一步完善了非囊膜病毒的"双受体"入侵模型.
牛胜刘闯刘聪聪刘升宋洋宋洋张勇田文霞赵欣赵欣
关键词：肠道病毒CD55FCRN
全球新型冠状病毒变异株研究进展被引量：30
2021年
截至2021年5月11日,基于Pango命名法,依据新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的基因组变异变迁将其划分为1281种亚型或分支。而SARS-CoV-2刺突(spike,S)蛋白的变异直接影响病毒的生物学功能。2020年下半年至今,全球多个国家和地区监测发现SARS-CoV-2的S蛋白发生氨基酸突变,特别是受体结合区或单克隆抗体结合位点氨基酸突变引起病毒的传播力和致病力改变以及部分免疫逃逸等。世界卫生组织将重要变异株划分为"关切变异株(variant of concern,VOC)"和"关注变异株(variant of interest,VOI)"。其中,VOC有4个,分别是VOC202012/01、501Y.V2、P.1和B.1.617;VOI有6个,分别是CAL.20C、P.2、B.1.526、B.1.525、B.1.616和P.3。一些氨基酸突变在多个VOC和VOI病毒株中交叉出现或同时出现,E484K/Q等重要氨基酸突变引起的部分免疫逃逸导致全球现有疫苗免疫效力下降,但现有新冠疫苗对VOC和VOI变异株仍然有效。本文通过对SARS-CoV-2变异株流行概况及S蛋白重要氨基酸突变特征进行归纳分析,为新冠病毒变异株的监测、防控和二代疫苗的研制策略提供科学参考。
冯晔囡宋洋王世文王世文许文波
关键词：刺突蛋白
广西2008-2015年手足口病流行病学特征及病原学监测分析被引量：18
2017年
目的分析广西2008-2015年手足口病的流行病学特征及病原谱变化,为手足口病的防控提供理论依据。方法从疾病监测信息报告系统获取手足口病个案数据,采用描述性方法描述疾病的三间分布,荧光逆转录-聚合酶链式反应法检测病毒核酸。结果广西2008-2015年累计报告手足口病病例1 360 857例,双年份发病数、重症数及死亡数均高于前一年的单年份;发病高峰以4~7月为主,高发县(区)多集中在南宁市、柳州市和百色市,男女发病性别比为1.58∶1,以5岁以下儿童为主。8年间优势病原体依次变化,整体以其他肠道病毒和EV-A71为主,各年份不同病原构成之间的差异有统计学意义(χ~2=9 856.37,P<0.01);确诊病例病原构成按月分布呈现波浪形变化趋势,不同病例类型病原构成不同,轻症病例以其他肠道病毒为主,重症和死亡病例以EV-A71为主。结论广西手足口病严重危害儿童身心健康,优势病原体不断变化,主要病原是其他肠道病毒和EV-A71,且以其他肠道病毒为主。
何为涛蒋丽娜王东燕陈敏玫莫建军居昱王晶潘沛江宋洋谭毅
关键词：手足口病流行病学特征病原监测
云南省2016年输入性B5基因亚型EV-A71的鉴定和基因特征分析被引量：2
2018年
手足口病是一种发病率较高,易发生传播的传染病,居我国丙类报告传染病发病数首位。本研究对云南省2016年手足口病患儿的临床标本随机抽取1%进行病毒分离和核酸检测,分子分型结果显示134株为EV-A71,占比36.91%,包含C4（130株）和B5（4株）两个基因亚型。其中所有C4基因亚型EV-A71序列均属于C4a进化分支,为中国大陆目前流行的优势基因型,而4株B5基因亚型EV-A71是云南省首次报道,属于输入基因型。从进化关系上4株云南输入性B5基因亚型EV-A71与越南流行株同源关系较近,并且其中3株在进化树上簇集,不排除省内局限性传播的可能性。因此,非本土流行的输入基因型EV-A71可能已成为一个影响我国手足口病预防控制的重要挑战。
黄克强寸建萍韩振志姜黎黎宋洋周晓芳杨倩冀天娇许文波徐闻张勇
2020年12月中国大陆需关注的突发公共卫生事件风险评估被引量：1
2020年
目的评估2020年12月在中国大陆地区发生或者可能由境外输入的突发公共卫生事件风险。方法根据国内外突发公共卫生事件报告及重点传染病监测等各种资料和部门通报信息,采用专家会商法,并通过视频会议形式邀请省(自治区、直辖市)疾病预防控制中心专家参与评估。结果总体上,预计12月突发公共卫生事件的报告数将较11月有所上升。全球新型冠状病毒肺炎疫情此起彼伏、持续蔓延,我国境内发生境外输入及续发本地传播风险持续存在,但在可控范围内。结论需要对新型冠状病毒肺炎予以特别关注。
孟玲涂文校宋洋向妮娟施国庆
关键词：突发公共卫生事件传染病疫情风险评估
手足口病相关柯萨奇病毒A组8型全基因组序列特征分析被引量：1
2021年
目的研究中国2013-2018年手足口病病例分离的柯萨奇病毒A组8型(CV-A8)全基因组序列特征及对全基因组各编码区进行遗传进化分析。方法对我国不同地区手足口病患者分离的11株CV-A8的全基因组序列,采用Sequencher 5.0、MEGA 7.0等软件对获取的全基因组序列进行比对和遗传进化分析。结果序列比对显示11株CV-A8基因组长度在7393-7400 bp之间,与原型株比较,在编码区无碱基插入或缺失,在非编码区存在个别碱基的插入或缺失。11株CV-A8毒株VP1区核苷酸和氨基酸同源性分别为78.3%-98.6%和92.6%-99.7%;与CV-A8原型株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为78.3%-98.2%和92.6%-99.7%。对CV-A8的VP1区序列进行了系统发育分析,可将CV-A8分为5个基因型:A、B、C、D和E,本研究11株CV-A8分属于C(1株)、D(2株)、E(8株)3个基因型。11株CV-A8毒株全基因组序列核苷酸和氨基酸同源性分别为81.3%%-98.8%和95.9%-99.5%,P2区进化树图显示,本研究的8株E基因型CV-A8和CV-A4、CV-A14和CV-A16原型株进化距离最近,P3区进化树图显示,本研究8株E基因型CV-A8和CV-A5、CV-A16、CV-A14和CV-A4进化距离最近。结论本研究中11株CV-A8其衣壳区呈现基因多样性,非衣壳区呈现重组多样性,提示CV-A8正在经历变异动态变化;CV-A8有可能成为手足口病的重要病原体,因此需要进一步加强监测CV-A8。
王东艳宋洋韩振志肖金波路环环严冬梅冀天娇杨倩祝双利许文波张勇
关键词：手足口病分子进化
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