齐程
- 作品数:1 被引量:6H指数:1
- 供职机构:西北农林科技大学农学院更多>>
- 发文基金:西北农林科技大学唐仲英育种基金陕西省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学更多>>
- 多倍体植物中单核苷酸多态性(SNPs)的开发被引量:6
- 2011年
- 单核苷酸多态性(SNP)是指在基因组水平上由单核苷酸的变异所引起的一种DNA序列多态性.在人、拟南芥、水稻等二倍体生物中,已经开发出大量的SNP标记并被用于群体结构分析、关联作图等研究,而在棉花、油菜、小麦等多倍体植物中,SNP的开发与应用却进展迟缓.为促进多倍体植物中SNP的开发,本文对多倍体植物中SNP标记开发所遇到的难题进行了阐述,并对多倍体中SNP标记开发方法进行了梳理,包括位点特异性引物的PCR片段直接测序,利用多倍体的近缘二倍体区分SNPs和部分同源序列间的差异(homoeologous sequence variants,HSVs),利用2代测序技术大规模发掘SNPs,基于公共数据库的序列通过生物信息学分析获取候选SNPs,通过遗传(分离)模式的研究验证SNPs等.利用上述方法可实现多倍体植物中SNP标记的大规模开发.
- 贺道华邢宏宜赵俊兴赵艳宁齐程王艳婷
- 关键词:多倍体单核苷酸多态性