张思思
- 作品数：3 被引量：19H指数：3
- 供职机构：中国科学院北京基因组研究所更多>>
- 发文基金：中国科学院战略性先导科技专项国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- GSA-Human:人类遗传资源数据管理的公共系统被引量：6
- 2021年
- GSA-Human是人类遗传资源数据汇交、存储、管理与共享的数据库系统,可提供人类遗传资源数据的上传、下载、浏览、检索等公共服务,并有效支撑了国家重点研发计划科技项目数据的汇交与管理工作。系统具有符合《中华人民共和国人类遗传资源管理条例》数据安全管理策略,提供公开访问和受控访问相结合的数据使用模式。公开访问数据允许用户自由下载与获取;受控访问数据采用申请-审核的模式,即需要通过数据管理委员会(Data Access Committee,DAC)的授权方可获得下载和使用权限。系统自上线以来,截至2021年7月,汇集数据总量已超5.27 PB。
- 张思思张思思陈婷婷陈旭唐碧霞陈婷婷董丽莉朱军伟孙艳玲唐碧霞翟爽孙玉彬陈焕新杜政霖肖景发章张鲍一明王彦青陈焕新
- 关键词：数据汇交数据共享
- 面向国际的生命组学大数据管理体系建设被引量：4
- 2016年
- 组学数据是生命科学研究中的一类极其重要的大数据,特别是二代测序技术的发展推动了组学大数据的爆炸式增长。通过借鉴国际数据中心建设的成功经验,分析国内组学产出数据及数据库建设、数据管理现状及应用需求,构建了面向国际的生命组学大数据管理体系,涵盖组学原始序列归档库、基因组序列数据库、基因表达数据库、基因组变异数据库、DNA甲基化数据库系统等,初步形成中国组学数据资源的存储、共享与应用体系。
- 赵文明张思思唐碧霞陈婷婷郝丽丽桑健李茹姣肖景发章张
- 关键词：大数据数据共享生物信息学基因组
- GSA:组学原始数据归档库被引量：10
- 2018年
- 生命科学的发展已进入组学大数据时代,然而我国至今尚未形成公共数据库存储体系。为弥补国内空白,组学原始数据归档库(Genome Sequence Archive, GSA, http://bigd.big.ac.cn/gsa)系统遵循国际核苷酸序列数据联盟(International Nucleotide Sequence Database Collaboration,INSDC)相关数据库建设标准,广泛收集各类生命组学原始数据。自2015年底上线运行以来,已获得了包括Cell、Nature、PNAS、GPB等30余个国内外期刊的认可,收录的数据量呈显著增长趋势,提供的数据服务受到国内外广大科研人员的认可。GSA有效缓解了当前我国生命组学数据汇交、存储与共享困难的问题,为我国国家生物信息中心的建设奠定了坚实基础。本文对目前GSA数据汇交、审核、发布与管理等机制进行了深入阐述,以方便用户了解GSA的各项功能,提供更高效的数据服务。
- 张思思陈婷婷朱军伟周晴陈旭王彦青赵文明
- 关键词：数据汇交数据共享
