许菲
- 作品数：3 被引量：8H指数：2
- 供职机构：上海交通大学农业与生物学院更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 枸杞胆碱合成关键酶基因PEAMT的克隆及生物信息学分析被引量：3
- 2013年
- 利用RT-PCR和RACE结合的方法,获得了枸杞磷酸乙醇胺N-甲基转移酶PEAMT基因cDNA全序列(命名为LbPEAMT)。LbPEAMTcDNA全长1 863bp,开放读码框1 497bp,编码一个由498个氨基酸构成的多肽,理论分子量为56.53kDa,等电点pI为5.50。通过多种序列比对,该基因编码的氨基酸序列与番茄PEAMT氨基酸的相似性为93%。二级结构预测LbPEAMT蛋白由44.98%的α-螺旋、17.67%的延伸链、6.63%的β-转角和30.72%的不规则卷曲组成。LbPEAMT是一个亲水蛋白。含有2个S-腺苷甲硫氨酸依赖催化活性结构域,分别位于N端65-164aa和C端290-392aa。每个活性区都包含有4个部分基序,分别为I、post I、post II和post III。LbPEAMT的这2个活性区在蛋白、磷脂和小分子甲基转移酶中都是相对保守的。
- 王名雪陆平许菲潘琪芳唐克轩赵静雅
- 关键词：枸杞基因克隆生物信息学分析
- 长春花黄素单加氧酶基因的克隆与组织表达分析被引量：2
- 2014年
- 利用RACE方法克隆到长春花中编码黄素单加氧酶的基因(YUCCA),YUCCA(YUC)是植物生长素吲哚乙酸(IAA)合成通路上的关键酶。长春花YUC(CrYUC,GeneBank登陆号KF827426)cDNA序列全长1 863bp,包括编码405个氨基酸的1 218bp开放阅读框、5’非编码区、3’非编码区和poly A尾巴;其相应的DNA中有3个内含子。生物信息学分析结果显示:预测CrYUC的分子量为45.3kDa,等电点为9.01;有16个磷酸化活性位点;与其他物种的YUC有较高相似度。初步表达分析发现:YUC在长春花的叶片、花、根及茎中均有表达,且茎及叶片中表达量高于花及根中表达量。
- 许菲张颖潘琪芳唐克轩赵静雅
- 关键词：基因克隆组织表达分析
- 长春花丙二烯氧化物合酶基因的克隆与表达被引量：3
- 2012年
- 利用RT-PCR和RACE相结合的方法,从长春花中克隆了丙二烯氧化物合酶(AOS)基因。结果显示:长春花AOS基因(CrAOS)cDNA全长为2 118bp,包括5′和3′非翻译区,polyA尾和一个长1 638bp的开放阅读框,其基因组中不含内含子;CrAOS基因编码的蛋白含545个氨基酸。多重比对表明CrAOS蛋白与其他的AOS蛋白具有较高的相似性,CrAOS蛋白序列中含有AOS家族应有的保守氨基酸残基。Southern杂交表明:CrAOS基因在长春花中为低拷贝。qRT-PCR结果显示:CrAOS在各个组织均有表达但表达量存在差异,在老叶中最高,在幼花中表达最低。对长春花幼苗进行不同处理,结果表明:伤害、低温、甲基茉莉酸、乙烯利处理等可使CrAOS基因表达量显著提高,水杨酸处理对基因表达影响不大。
- 王名雪陆平许菲潘琪芳唐克轩赵静雅
- 关键词：克隆
