安红强
- 作品数：6 被引量：27H指数：5
- 供职机构：西南交通大学生命科学与工程学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中央高校基本科研业务费专项资金国家级大学生创新创业训练计划更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 铁皮石斛胚胎发生相关基因DoEMB8的克隆及表达分析被引量：5
- 2017年
- 采用RACE和巢式PCR技术克隆出铁皮石斛胚胎发生相关基因DoEMB8(Embryogenesis-associated protein EMB8)序列。序列分析表明该基因全长2077 bp,包含一个1824 bp的CDS,编码608个氨基酸残基。分子进化分析显示,DoEMB8与海枣(Phoenix dactylifera)、油棕(Elaeis guineensis)、小果野芭蕉(Musa acuminata subsp.malaccensis)等单子叶植物的亲缘关系较近。跨膜区分析显示DoEMB8蛋白含有两个跨膜螺旋结构,亚细胞定位显示该基因可能存在于线粒体。RT-q PCR分析表明,DoEMB8在原球茎不同发育时期表达量较为恒定,在PLB(Protocorm like body)中的表达量较原球茎不同时期要高,在组织表达分析中,种子中的表达量最高,较根中的表达量上升了3.16倍,表明该基因在胚胎发育时期有着持续稳定且较高的表达,可能对植物胚胎发育起着重要作用。
- 安红强王万军
- 关键词：铁皮石斛RACERT-QPCR
- 铁皮石斛多聚泛素基因Polyubiquitin1(DoUb1)的克隆及表达分析被引量：5
- 2017年
- 采用RACE(rapid amplification of cDNA ends)技术获得铁皮石斛(Dendrobium officinale Kimura et Migo)Polyubiquitin1(DoUb1),该基因全长1985 bp,开放阅读框为1371 bp,编码457个氨基酸残基的亲水性蛋白,分子质量为51 179.7 ku,理论等电点p I为7.76;亚细胞定位分析表明该基因产物主要在细胞质或线粒体基质中发挥作用。DoUb1与水稻、玉米及谷子等单子叶植物的多聚泛素基因亲缘关系较近。实时荧光定量PCR(RT-qPCR)分析结果显示,DoUb1在铁皮石斛幼苗根和叶中表达量较高,茎中表达量较低;在干旱胁迫和温度胁迫过程中的表达量都低于正常状况,在干旱胁迫的早期,表达量降低,6 h时达到最低,之后随胁迫时间的延长而缓慢升高;在温度胁迫情况下,DoUb1具有与干旱胁迫相近的响应特性,但低温胁迫相比高温胁迫下,DoUb1表达量更低,表明该基因对低温胁迫更敏感,结果为后期研究铁皮石斛生长发育提供一定基础。
- 裴薇梁易范静安红强王万军
- 关键词：RACE铁皮石斛POLYUBIQUITINRT-QPCR
- 铁皮石斛尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因的克隆与分析被引量：7
- 2017年
- 目的:研究尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(UGPase)在铁皮石斛不同组织中的表达情况,探讨其与石斛多糖累积的关系。方法:根据铁皮石斛原球茎转录组数据中的DoUGPase1序列设计引物,并利用RACE技术克隆该基因;用生信分析软件预测其蛋白结构,并进行系统发育分析;利用实时荧光定量PCR(q RT-PCR)技术研究该基因在铁皮石斛不同年份,不同组织中的表达。结果:通过RACE技术得到1个3054 bp基因,命名为DoUGPase1,其ORF长1530 bp,编码510个氨基酸残基,与油棕(Elaeis guineensis)和波斯枣(Phoenix dactylifera)有一定的同源性,且DoUGPase1在3年生的植株中相对表达量整体较高(P<0.05)。结论:我们预测在铁皮石斛的生长发育过程中DoUGPase1基因与多糖累积的活跃程度成正比例。
- 吕楠安红强裴薇王万军
- 关键词：QRT-PCR蛋白结构
- 铁皮石斛泛素结合酶基因DoUBC24的克隆及表达分析被引量：7
- 2016年
- 目的:克隆铁皮石斛泛素结合酶基因DoUBC24,预测其蛋白结构特征和进化关系,分析其时空差异表达情况,并推测其在植物生长发育中的功能。方法:提取铁皮石斛全苗总RNA,采用cDNA末端快速扩增(RACE)和巢式PCR技术克隆Do UBC24基因;用生物信息手段分析基因序列结构特征,并预测其编码蛋白及其理化性质和亚细胞定位;用MEGA6.0构建系统发育树,分析物种进化关系;用qRT-PCR检测DoUBC24在原球茎不同发育时期及不同组织中的相对表达量。结果:克隆得到基因全长为3811 bp,包含2880 bp的CDS,编码959个氨基酸残基,编码产物含有一个保守的UBCc结构域;分子进化分析显示,DoUBC24同海枣、油棕、小果野芭蕉、玉米、短花药野生稻、二穗短柄草和大麦等单子叶植物的亲缘关系较近;qRT-PCR分析显示,DoUBC24在铁皮石斛叶原基维管系统形成、原球茎退化时期表达显著下降,而在椭球形原球茎、根端分生组织和类原球茎中表达量较高,在组织中的表达量水平依次为花>茎>种子>根>叶。结论:铁皮石斛泛素结合酶DoUBC24基因在铁皮石斛原球茎不同发育时期及不同组织中均有显著的差异表达,可能对原球茎发育及植物组织的形态建成具有重要调控作用。
- 安红强范静梁易裴薇王万军
- 关键词：铁皮石斛泛素结合酶CDNA末端快速扩增QRT-PCR
- 决明查尔酮合成酶全长基因序列的克隆与分析被引量：7
- 2013年
- 从决明(Cassia tora)的新鲜子叶中提取基因组DNA作为模板,利用一对特异引物进行PCR扩增,然后克隆测序得到决明查尔酮合成酶(CHS)的基因全长。测序结果表明,决明CHS基因全长为1 766 bp,含有2个外显子和1个内含子。将其提交GenBank,登录号为(JX676773)。决明CHS基因的内含子位于188-765 bp之间,长度为578 bp,内含子的剪切符合GU-AG规律,含有多个酶切位点和顺式调控元件,可能与决明CHS基因的表达调控有关。CHS基因内含子具有多态性,可能是由不同植物存在多样性的生活史与生活环境导致的。决明CHS基因外显子2较为保守,编码几乎所有CHS的功能位点。构建外显子2编码氨基酸序列的NJ系统发育进化树,能够正确反映不同植物的亲缘关系,可用于不同植物的遗传分化和分子进化研究。
- 钟德馨方袁梦梦郭壮浩安红强董银松丁若凡王万军廖海周嘉裕
- 关键词：决明查尔酮合成酶内含子基因克隆
- 铁皮石斛DoWRKY6转录因子基因的克隆与分析被引量：5
- 2017年
- 目的:植物生长发育由多种转录因子调控,探索WRKY转录因子调控铁皮石斛组织生长发育机理。方法:根据铁皮石斛原球茎转录组数据中的WRKY6序列设计引物,并利用RACE技术克隆该基因;用生信分析软件预测其蛋白结构,并进行系统发育分析;利用实时荧光定量PCR(q RT-PCR)技术研究该基因在铁皮石斛幼苗根、茎、叶等组织中的表达。结果:通过RACE技术得到1个1,238bp的Ⅱ类WRKY转录因子基因,命名为DoWRKY6,其ORF长1,017 bp,编码339个氨基酸残基,与梅[PrmuWRKY27(XM_008236601.1)]及大豆[GlmaWRKY27(XM_003555347.3)]有较近的亲缘关系,且DoWRKY6在茎中的相对表达量最大。结论:我们预测在铁皮石斛的生长发育过程中DoWRKY6基因对根、叶、茎的调控作用依次增强,表明DoWRKY6与已发表的铁皮石斛WRKY基因在组织的差异性表达上有较大差别,这对丰富WRKY家族对铁皮石斛的生长发育调控机制提供更多依据。
- 张子凤吕楠安红强裴薇王万军
- 关键词：WRKY转录因子QRT-PCR蛋白结构
