公共文化服务平台

共 5 条记录，以下是 1-5

全选清除导出

排序方式：

铁皮石斛多聚泛素基因Polyubiquitin1(DoUb1)的克隆及表达分析被引量：5: 2017年; 采用RACE(rapid amplification of cDNA ends)技术获得铁皮石斛(Dendrobium officinale Kimura et Migo)Polyubiquitin1(DoUb1),该基因全长1985 bp,开放阅读框为1371 bp,编码457个氨基酸残基的亲水性蛋白,分子质量为51 179.7 ku,理论等电点p I为7.76;亚细胞定位分析表明该基因产物主要在细胞质或线粒体基质中发挥作用。DoUb1与水稻、玉米及谷子等单子叶植物的多聚泛素基因亲缘关系较近。实时荧光定量PCR(RT-qPCR)分析结果显示,DoUb1在铁皮石斛幼苗根和叶中表达量较高,茎中表达量较低;在干旱胁迫和温度胁迫过程中的表达量都低于正常状况,在干旱胁迫的早期,表达量降低,6 h时达到最低,之后随胁迫时间的延长而缓慢升高;在温度胁迫情况下,DoUb1具有与干旱胁迫相近的响应特性,但低温胁迫相比高温胁迫下,DoUb1表达量更低,表明该基因对低温胁迫更敏感,结果为后期研究铁皮石斛生长发育提供一定基础。; 裴薇梁易范静安红强王万军; 关键词：RACE 铁皮石斛 POLYUBIQUITIN RT-QPCR

铁皮石斛FCA基因的表达及生物信息学分析: 2020年; FCA(FLOWERING CONTROL LOCAL A)基因是自主开花途径中促进植物开花的保守基因。通过电子克隆和末端快速扩增技术(Rapid amplification of cDNA ends,RACE)从铁皮石斛中克隆得到FCA基因全长cDNA序列,命名为DoFCA。生物信息学分析显示DoFCA基因开放阅读框为2301 bp,包含19个外显子,18个内含子,编码766个氨基酸残基的蛋白,在N-端(131~210、220~298)有两个RRM结构域,C-端(605~634)存在一个WW结构域。启动子分析发现,该基因启动子区存在与分生组织特异激活、胚乳表达、花药特异基因的表达调控密切相关的调控元件。蛋白序列同源性分析表明,保守区域主要集中在两个RRM结构域和WW结构域部分,表明该蛋白在不同物种中功能保守。系统发育分析显示DoFCA蛋白与石斛类FCA蛋白的进化关系最近,并且发现FCA蛋白在单子叶和双子叶植物进化过程中出现了分化。对DoFCA-WW/FY-PPLPP复合物的分析发现WW结构域中的14Tyr、16Tyr、23Ser及25Trp 4个位点与FY-PPLPP相互作用最紧密,并且23Ser和FY-PPLPP基序的第2个Pro残基形成氢键。逆转录实时荧光定量PCR(RT-qPCR)分析结果显示,DoFCA在铁皮石斛花组织中的表达有优势,在根中表达最少,茎、叶组织中表达量其次。在低温处理12 h时后,其表达量迅速下降,随后表达量又逐渐升高,最后维持在较高水平。表明该基因与铁皮石斛花的发生和形成可能具有重要作用;在低温诱导开花过程中也发挥作用。; 李良建胡睿裴薇王万军; 关键词：RACE 铁皮石斛实时定量PCR

铁皮石斛尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因的克隆与分析被引量：7: 2017年; 目的:研究尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(UGPase)在铁皮石斛不同组织中的表达情况,探讨其与石斛多糖累积的关系。方法:根据铁皮石斛原球茎转录组数据中的DoUGPase1序列设计引物,并利用RACE技术克隆该基因;用生信分析软件预测其蛋白结构,并进行系统发育分析;利用实时荧光定量PCR(q RT-PCR)技术研究该基因在铁皮石斛不同年份,不同组织中的表达。结果:通过RACE技术得到1个3054 bp基因,命名为DoUGPase1,其ORF长1530 bp,编码510个氨基酸残基,与油棕(Elaeis guineensis)和波斯枣(Phoenix dactylifera)有一定的同源性,且DoUGPase1在3年生的植株中相对表达量整体较高(P<0.05)。结论:我们预测在铁皮石斛的生长发育过程中DoUGPase1基因与多糖累积的活跃程度成正比例。; 吕楠安红强裴薇王万军; 关键词：Q RT-PCR 蛋白结构

铁皮石斛DoWRKY6转录因子基因的克隆与分析被引量：5: 2017年; 目的:植物生长发育由多种转录因子调控,探索WRKY转录因子调控铁皮石斛组织生长发育机理。方法:根据铁皮石斛原球茎转录组数据中的WRKY6序列设计引物,并利用RACE技术克隆该基因;用生信分析软件预测其蛋白结构,并进行系统发育分析;利用实时荧光定量PCR(q RT-PCR)技术研究该基因在铁皮石斛幼苗根、茎、叶等组织中的表达。结果:通过RACE技术得到1个1,238bp的Ⅱ类WRKY转录因子基因,命名为DoWRKY6,其ORF长1,017 bp,编码339个氨基酸残基,与梅[PrmuWRKY27(XM_008236601.1)]及大豆[GlmaWRKY27(XM_003555347.3)]有较近的亲缘关系,且DoWRKY6在茎中的相对表达量最大。结论:我们预测在铁皮石斛的生长发育过程中DoWRKY6基因对根、叶、茎的调控作用依次增强,表明DoWRKY6与已发表的铁皮石斛WRKY基因在组织的差异性表达上有较大差别,这对丰富WRKY家族对铁皮石斛的生长发育调控机制提供更多依据。; 张子凤吕楠安红强裴薇王万军; 关键词：WRKY转录因子 QRT-PCR 蛋白结构

铁皮石斛泛素结合酶基因DoUBC24的克隆及表达分析被引量：7: 2016年; 目的:克隆铁皮石斛泛素结合酶基因DoUBC24,预测其蛋白结构特征和进化关系,分析其时空差异表达情况,并推测其在植物生长发育中的功能。方法:提取铁皮石斛全苗总RNA,采用cDNA末端快速扩增(RACE)和巢式PCR技术克隆Do UBC24基因;用生物信息手段分析基因序列结构特征,并预测其编码蛋白及其理化性质和亚细胞定位;用MEGA6.0构建系统发育树,分析物种进化关系;用qRT-PCR检测DoUBC24在原球茎不同发育时期及不同组织中的相对表达量。结果:克隆得到基因全长为3811 bp,包含2880 bp的CDS,编码959个氨基酸残基,编码产物含有一个保守的UBCc结构域;分子进化分析显示,DoUBC24同海枣、油棕、小果野芭蕉、玉米、短花药野生稻、二穗短柄草和大麦等单子叶植物的亲缘关系较近;qRT-PCR分析显示,DoUBC24在铁皮石斛叶原基维管系统形成、原球茎退化时期表达显著下降,而在椭球形原球茎、根端分生组织和类原球茎中表达量较高,在组织中的表达量水平依次为花>茎>种子>根>叶。结论:铁皮石斛泛素结合酶DoUBC24基因在铁皮石斛原球茎不同发育时期及不同组织中均有显著的差异表达,可能对原球茎发育及植物组织的形态建成具有重要调控作用。; 安红强范静梁易裴薇王万军; 关键词：铁皮石斛泛素结合酶 CDNA末端快速扩增 QRT-PCR

全选清除导出

共1页<1>

裴薇

合作作者

文献类型

领域

主题

机构

作者

传媒

年份

用户反馈

裴薇

合作作者

文献类型

领域

主题

机构

作者

传媒

年份

用户登录

用户反馈