王凡
- 作品数：6 被引量：10H指数：2
- 供职机构：首都医科大学燕京医学院更多>>
- 发文基金：北京市自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 人HO-1基因启动子区生物信息学分析被引量：1
- 2021年
- 目的分析人血红素加氧酶-1(hHO-1)基因启动子区序列特点,转录因子结合位点种类及CpG岛位置。方法利用美国国立生物技术信息中心(NCBI)数据库获取hHO-1基因序列和启动子序列,SoftBerry分析hHO-1基因核心启动子位置,PROMO和Gene Regulation分析转录因子结合位点种类,MethPrimer 2.0和CpGFinder预测CpG岛位置。结果hHO-1基因位于22q12.3,全长13112 bp。转录起始点上游约1995 bp范围内为启动子区域,hHO-1启动子区含79种转录因子结合位点和1个CpG岛。结论hHO-1基因启动子能预测出多种转录因子结合位点,可为更深入地研究hHO-1基因的调控机制及其在抗逆方面的潜在作用提供理论基础。
- 王凡徐世明古同男王宏娟
- 关键词：血红素加氧酶-1启动子转录因子结合位点CPG岛
- 肠道微生物与相关疾病的研究进展被引量：7
- 2018年
- 人体肠道内存在着数以亿计的肠道微生物,统称为肠道微生物组,是人体物质代谢的重要环节。最近一些研究表明,肠道微生物组与人体健康有着密切的关系。肠道微生物稳态的改变可能与包括内分泌系统疾病、心血管疾病、消化系统疾病、肿瘤和中枢神经系统疾病在内的多种疾病相关联。例如,在婴儿哺乳期溶解性肠杆菌A可抑制1型糖尿病的发生;肠道微生物组比例失调会中断辅助性T淋巴细胞(Th)1、Th17的免疫反应,导致免疫耐受缺失,也会增加患结肠肿瘤的风险等。随着对肠道微生物组与疾病关系的深入研究,将会为疾病防治提供新的思路。
- 王凡王宏娟古同男任丽丽梅秋芳徐世明
- 关键词：肠道内分泌系统疾病心血管疾病
- 斑马鱼MIB1启动子及互作基因的功能富集分析
- 2023年
- 目的分析斑马鱼E3泛素蛋白连接酶1(MIB1)基因启动子区转录因子结合位点(TFBS),MIB1互作基因和互作蛋白的种类及其在信号通路中的作用,探讨MIB1基因的调控方式及潜在功能。方法利用国家基因组科学数据中心(NGDC)预测非编码RNA(ncRNA),利用Alggen与AnimalTFDB在线网站预测MIB1基因TFBS种类,使用GeneMANIA与STRING分析MIB1的互作基因与互作蛋白;通过DAVID网站获取相关数据,进行基因本体(GO)可视化分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)代谢通路分析。结果MIB1基因启动子区及5′非翻译区可转录出ncRNA;通过预测得到121种TFBS,并发现P53转录因子既可以结合到MIB1基因的启动子区又可与MIB1蛋白相互作用;在线预测出6种MIB1的共表达基因,筛选出20种互作基因;通过GO可视化分析发现,MIB1及其互作基因在生物过程方面具有调控细胞、组织、器官生长分化及调节NOTCH信号通路等功能,且主要在细胞质核周区、细胞膜和突触后密集区等部位被富集,具有结合NOTCH蛋白、PDZ结构域蛋白等分子功能;KEGG代谢通路分析发现,MIB1及其互作基因涉及4条代谢途径。结论MIB1包含多种TFBS,并通过与特定转录因子的相互作用,影响细胞癌变、免疫调节等多种生物学过程。MIB1还可能通过其互作基因和互作蛋白的介导,在细胞生长调控、造血干细胞分化、胚胎发育及神经元信息的传递等方面发挥重要作用。
- 王凡徐世明鄢雯古同男王宏娟
- 关键词：生物信息学启动子转录因子结合位点
- 血红素加氧酶-1在感染性疾病中的作用及研究进展被引量：2
- 2019年
- 血红素加氧酶-1(HO-1)是机体内广泛存在的抗氧化防御酶。在正常生理状态下,HO-1的表达水平较低。在缺血、缺氧、炎症等多种应激状态下,HO-1可被诱导大量表达,进而在多种疾病中发挥细胞保护作用。但对于HO-1与感染性疾病的相关研究报道较少。现对HO-1在感染性疾病(细菌、真菌、寄生虫、病毒)中的作用进行综述。
- 王凡王宏娟徐世明
- 关键词：血红素加氧酶-1感染性疾病细菌真菌寄生虫病毒
- 生物化学在医学影像技术专业的教学实践研究
- 2021年
- 与传统的医学专业相比,医学影像技术专业的生物化学课程具有学时少、与专业课联系不明显、学生不够重视等特点。面对这些特点和问题,在教学过程中通过认真分析,积极实践,获得了一些经验,并总结出五个方面的应对措施。这些措施在实际运用过程中发挥了一定的积极作用,并有助于为在非传统医学专业更好地开展生物化学等医学基础课教学工作提供参考。
- 王宏娟王凡古同男徐世明
- 关键词：生物化学医学影像技术专业教学改革
- 增强子RNA的研究进展
- 2017年
- 增强子是位于基因上游的DNA序列,能够增强下游基因的转录,但增强子自身也可转录出RNA却鲜为人知。最近通过一些关于全基因组的研究发现,增强子可以普遍地转录产生RNA,称之为enhancer RNAs(eRNAs)。eRNAs可以激活增强子活性,也能与其它蛋白质因子结合促进增强子启动子环的形成,从而激活下游基因的表达,它还可能以独立的形式发挥某些生物学功能。目前对eRNAs的研究并不是很深入,所以对eRNAs的深入研究将对其功能探索、eRNAs的开发应用,甚至是疾病的防治有重要的意义。本文旨在对eRNAs的结构、功能及作用机制作相关介绍。
- 王凡王宏娟古同男李中秋徐世明
- 关键词：RNAS增强子基因表达
