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孙世强
作品数:
1
被引量:3
H指数:1
供职机构:
南方医科大学基础医学院基因工程研究所
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发文基金:
广东省科技计划工业攻关项目
国家自然科学基金
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相关领域:
医药卫生
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合作作者
刘坤
南方医科大学基础医学院基因工程...
唐锴鹰
南方医科大学基础医学院基因工程...
马文丽
南方医科大学基础医学院基因工程...
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南方医科大学基础医学院基因工程...
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南方医科大学基础医学院基因工程...
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孙世强
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2012
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肝细胞癌基因表达谱分析
被引量:3
2012年
目的:通过分析肝细胞癌(HCC)基因表达谱改变来探讨HCC发病机制。方法:从GEO数据库中下载HCC基因表达数据GSE14215和GSE29217,采用Genespring 11.0软件分析差异表达基因,运用统合分析(meta-analysis)方法确定共同差异表达基因,利用DAVID、KEGG、String和FABLE等生物信息学软件确定相关的生物学过程、分子功能、相互作用通路等。结果:HCC组织与正常肝组织相比,共同下调、上调的差异表达基因分别是281和227个,其中作为转录因子36个;与文献报道的HCC相关基因一致的有181个。差异表达基因主要与细胞周期调控、代谢调节、药物代谢酶系、DNA的损伤复制、p53和过氧化物酶体增殖物激活受体信号通路(PPAR)等信号通路有关。结论:HCC基因表达谱数据分析表明,细胞周期紊乱主要发生在S、M期;转录因子FOXM1/HNF3高表达与HCC的细胞周期紊乱密切相关。
张宝
唐锴鹰
孙世强
刘坤
冯春琼
吴清华
陈虎
郑文岭
马文丽
关键词:
肝细胞
基因表达谱
计算生物学
细胞周期
转录因子
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