郭栗
- 作品数：7 被引量：4H指数：1
- 供职机构：中国海洋大学海洋生命学院更多>>
- 发文基金：中央高校基本科研业务费专项资金国家自然科学基金国家海洋公益性行业科研专项更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 鼠尾藻微卫星标记开发及青岛群体遗传多样性分析被引量：1
- 2015年
- 分离了鼠尾藻14个微卫星标记并用这些标记分析了鼠尾藻青岛群体遗传多样性和遗传结构。开发的14个标记在青岛群体中共检测到45个等位基因,各标记位点等位基因数在2和6之间,平均3.2个,平均有效等位基因2.1个,群体香农信息指数、观测杂合度、基因多样性指数、多态信息含量分别为0.799、0.449、0.466和0.406。青岛鼠尾藻种群体遗传多态性中等偏高。青岛4个鼠尾藻采集点的56个鼠尾藻个体在聚类图上无明显聚群和谱系。开发的标记将促进鼠尾藻遗传资源评价、保护和开发利用。
- 汤志宏刘振羽王军张宁毛玉峰郭栗杨官品
- 关键词：鼠尾藻微卫星标记
- 依据减数分裂相关基因数量判别赫氏球石藻(Emiliania huxleyi)繁殖方式研究
- 2016年
- 繁殖方式是生物重要生物学特征之一。了解生物繁殖方式对遗传和育种研究具有重要意义。赫氏球石藻(Emiliania huxleyi)呈世界性分布,在生态系统中扮演重要角色,但其繁殖方式未知。本研究用分子系统学方法确定有基因组序列且行有性生殖的真核生物的减数分裂相关基因数量,建立了"减数分裂相关基因≥19个,其中减数分裂特异基因≥5个"的有性生殖判别标准;发现赫氏球石藻具有25个减数分裂相关基因,包括6个减数分裂特异基因。依据建立的标准判定赫氏球石藻行有性生殖。研究结果将有助于赫氏球石藻生活史和遗传学研究。
- 胡永梅郭栗杨官品
- 关键词：减数分裂繁殖方式
- 依据减数分裂特异基因判定三角褐指藻生殖方式的研究被引量：1
- 2013年
- 生殖方式既是重要的生物学特征,也关乎遗传改良策略的选择。在三角褐指藻(Phaeodactylun tricornutum)中,真核生物中广泛存在的有性生殖过程从未被观察到。除直接观察有性生殖过程和依据遗传后果判定,还可根据减数分裂特异基因存在与否判定是否存在有性生殖。在三角褐指藻基因组序列中搜索减数分裂特异基因,用ClustalX进行序列比,用Mrbaye3.2软件构建分子系统学树,进行分子系统学分析,发现三角褐指藻缺失7个减数分裂特异基因中的3个,分别是Hop1,Mnd1和Dmc1。不能观察到有性生殖时,绝大多数(或全部)减数分裂特异基因存在可佐证有性生殖存在,而这些基因缺失则意味着减数分裂丧失和专营无性生殖。因三角褐指藻缺失部分减数分裂特异基因,故推论其专营无性生殖。无性生殖可维持遗传稳定,研究结果有助于通过选择优良藻株培育三角褐指藻的优良品种。
- 郭栗杨官品
- 关键词：三角褐指藻有性生殖无性生殖
- 海带钒依赖溴过氧化物酶基因甄别和表达分析被引量：1
- 2019年
- 钒依赖溴过氧化物酶(Vanadium-dependent bromoperoxidase,vBPO)在富集碘的褐藻中广泛存在,催化碘化物生成,消除过量过氧化氢,保护藻体。因此,vBPO基因是褐藻天然免疫和防御应答的指示基因之一。中国广泛栽培海带(Saccharina japonica),但现行的“浮绳网藻体倒置避夏栽培”模式可能使海带孢子体持续性地处于强紫外线、强光照、高温度及频繁的光照和温度波动等环境因素的胁迫状态。这可能是导致海带病害越来越频繁的生理学原因。本研究用转录组测序方法分析了海带孢子体4个生长发育时期(薄嫩期、厚成期、成熟期和衰老期)vBPO基因的表达模式,获得了59条至少在一个生长发育时期表达的vBPO基因转录本组装物,其中的4条含有完整vBPO基因开放阅读框。用这4条序列含有的开放阅读框逆翻译成氨基酸序列并与从NCBI数据库下载的16个物种的28条vBPO氨基酸序列构建分子系统学树,发现它们的氨基酸序列与掌状海带(Laminaria digitata)的vBPO亲缘关系最近,并与所有褐藻vBPO聚为一枝。这说明这些转录本就是海带vBPO基因表达产物。研究还发现,59条海带vBPO基因转录本在4个发育时期的平均丰度是相应时期全部基因转录本的平均丰度的9~19倍,平均13倍,这说明海带天然免疫和防御应答机制之一的碘富集机制持续性处于高活性状态。研究还发现海带vBPO基因表达模式与碘含量变化呈正相关(r=0.974)。
- 丁海燕李晓捷郭栗杨官品
- 关键词：海带天然免疫分子系统学分析
- CRISPR/Cas9基因编辑系统及其在微藻中的应用
- 2023年
- 微藻是单细胞光合原生生物的统称。微藻富含高价值的产物,如蛋白质、DHA、虾青素等,广泛用于食品、保健品、化妆品和饲料生产。基因编辑技术是微藻遗传学研究和遗传改良的新工具。目前,广泛使用的基因编辑技术有锌指蛋白-核酸酶系统(zinc-finger nucleases system,ZFN)、转录激活样效应蛋白-核酸酶系统(transcription activator-like effector nucleases system,TALEN)和成簇规则间隔短回文重复(CRISPR)-CRISPR合作蛋白系统[clustered regularly interspaced short palindromic repeats(CRISPR)/CRISPR-associated(Cas)system],简称CRISPR/Cas系统。ZFN和TALEN融合了DNA特定序列识别蛋白和核酸内切酶,需要根据拟识别DNA序列修改识别蛋白氨基酸序列,过程繁琐,效率低,而CRISPR/Cas系统操作简便,只需设计拟识别DNA序列小引导RNA即可,编辑效率高,可同步编辑多个基因。目前,已有编辑干扰、编辑激活、编辑敲除、编辑插入等衍生系统,还有引导编辑、碱基编辑等,也可以编辑RNA分子。CRISPR/Cas在微藻中应用广泛。本文综述了CRISPR/Cas9基因编辑技术在微藻中的应用现状。
- 刘丽娴郭栗杨官品
- 关键词：微藻
- 多物种混合转录组测序(msRNA-seq)及其在海洋生态学研究中的应用被引量：1
- 2019年
- 转录组测序是细胞生理学过程和机制的解析手段之一。目前,主要应用在对特定物种或细胞类型在不同生长、发育阶段(时间序列)或不同组织、器官、生长环境(空间序列)中基因转录本丰度的定量和比较上。但是,这并不适用于多物种共存的自然生态系统和多细胞协同作用的生物体中。应运而生的混合多物种转录组分析技术则是可以同时针对两个或两个以上物种或细胞类型的转录组进行分析,以此来解析物种或细胞间的相互作用。其最大特点是靠后期拆分数据而不是通过前期的物理方法来拆分物种或细胞类型。目前,该技术在动物医学领域中使用较多,但在生态系统尤其是海洋生态系统的研究中应用较少。本文介绍了多物种混合转录组测序的概念、方法、研究历程和在海洋生态学研究中的应用及前景,以期为该领域研究者打开新思路,提供新方法。
- 杨官品孙诗阳潘克厚郭栗
- 关键词：海洋生态学
- 海洋微拟球藻对共培养三角褐指藻的分子生理学响应机制
- 2022年
- 本研究运用多物种混合转录组测序(msRNA-seq)法分析了对数生长期海洋微拟球藻响应相同细胞数指数末期三角褐指藻共培养的生理机制。两种藻的细胞总数在8 d内基本不变。三角褐指藻转录组结果中存在与生长有关的基因的表达,且难以与响应共培养的生理过程区分。因此,我们只分析微拟球藻响应共培养的转录组变化及其揭示的生理学机制。分析发现在共培养的初始24 h内共有8235个基因表达,其中,809个为显著差异表达基因,351个下调表达,458个上调表达。这些差异基因被富集到7条KEGG通路中。其中,在DNA复制和同源重组通路上所富集的基因呈下调表达,而在氨基和核苷酸糖代谢通路、Focal adhesion、PI3K-Akt、cAMP、ErbB信号通路上所富集的基因呈上调表达。结果表明海洋微拟球藻响应三角褐指藻共培养时发生了一系列生理学变化。这是应用多物种混合转录组测序分析微藻间互作的初步尝试,建立的方法也适用微藻和其它微生物的互作机制研究。
- 孙诗阳张忠义刘航郭栗杨官品
- 关键词：微藻共培养
