许剑涛
- 作品数：4 被引量：10H指数：2
- 供职机构：南京林业大学林学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家林业公益性行业科研专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 松材线虫和拟松材线虫hsp70基因结构特征及其分子进化
- 转录组多态性,尤其是近缘种间保守基因的cDNA多态性是探讨物种多样性的重要方面,也是探讨物种分子进化的关键。本文选取物种间高度保守的HSP70为对象,探讨其在松材线虫及其近缘种拟松材线虫基因组中的结构差异,并试图揭示两种...
- 黄麟许剑涛张传辉叶建仁吴小芹李超
- 关键词：松材线虫拟松材线虫分子进化
- 文献传递
- 松材线虫和拟松材线虫14-3-3蛋白基因全长cDNA克隆与分析被引量：5
- 2011年
- [目的]对松材线虫和拟松材线虫的14-3-3蛋白基因进行全长cDNA克隆,并进行序列分析。[方法]根据GenBank数据库中14-3-3蛋白EST序列BXC56(登录号为FG589472)、BMC120(登录号为FG589351),采用RACE技术获取松材线虫和拟松材线虫14-3-3蛋白的全长cDNA克隆Bx14-3-3a和Bm14-3-3a,并对克隆片段序列进行分析。[结果]Bx14-3-3a全长1 039 bp,包含一个756 bp的开放阅读框,编码蛋白含有251个氨基酸残基,包含2个14-3-3蛋白标签,编码蛋白分子量为61.43 kD,等电点为4.88。Bx14-3-3a基因组结构中包含4个外显子和3个内含子序列。Bm14-3-3a全长992 bp,有与Bx14-3-3a编码完全相同的氨基酸序列。序列比对结果表明,14-3-3在真核生物间高度保守,Bx14-3-3A和Bm14-3-3A蛋白在系统进化上与线形动物门(Nematomorpha)的物种近缘关系较近,与植物线虫南方根结线虫(Meloidogyne incognita)系统发育关系上最为亲近。[结论]Bx14-3-3a和Bm14-3-3a的成功克隆,为进一步研究其功能及其调控因子对形态、致病力、繁殖力和环境适应性等方面的分子调控机制奠定了重要基础。
- 黄麟许剑涛付涵予吴小芹叶建仁
- 关键词：松材线虫拟松材线虫基因结构生物信息学分析
- 根癌农杆菌介导的异角状拟盘多毛孢菌转化系统研究被引量：5
- 2012年
- 以携带潮霉素B磷酸转移酶抗性基因(hph)的pBHt1作为转化载体,根癌农杆菌AGL-1作为转化介体,实施转化异角状拟盘多毛孢菌。研究发现,异角状拟盘多毛孢菌的最优转化体系为:异角状拟盘多毛孢菌分生孢子悬浮液浓度为1×106个/mL,根癌农杆菌OD600为0.3,共培养时间48 h,共培养温度为25℃,诱导培养基中乙酰丁香酮(AS)浓度为200μmol/L,选择培养基添加250μg/mL潮霉素B、250μg/mL头孢噻肟钠。1×106个异角状拟盘多毛孢菌分生孢子可以产生200～300个转化子,随机挑选10个转化子进行PCR检测,均能扩增出预期条带,且在不含潮霉素B的PDA培养基平板上转化子连续培养5代后,hph基因仍能稳定遗传,这表明T-DNA已经插入到异角状拟盘多毛孢菌的基因组中。此次建立的异角状拟盘多毛孢菌的转化体系可为该病菌的功能基因研究和寄主与病原菌的互作研究提供有效的工具。
- 张林平叶建仁李月阳黄麟许剑涛张扬
- 关键词：根癌农杆菌
- 松材线虫与拟松材线虫hsp70和hsp90基因结构特征及其分子进化被引量：1
- 2015年
- 转录组的多态性是探讨物种多样性与分子进化的重要方面。笔者选取物种间保守性较高的HSP70、HSP90蛋白作为研究对象,探讨二者在松材线虫和拟松材线虫基因组中的结构差异,探明他们在松材线虫和拟松材线虫中的特点,并试图揭示两种线虫的系统发育关系。结果表明二者内含子具有丰富的多态性,内含子中的G+C含量也显著不同。核酸序列gABG和gmc2分别编码松材线虫和拟松材线虫HSP70的642个氨基酸,相似性高达99%,仅存在9个氨基酸的差异,并且这种差异是由13个碱基的多态性造成的。gABO和gmc19分别编码松材线虫和拟松材线虫的HSP90,其氨基酸序列相似性为92%。对同义密码子的偏好性分析表明,17种氨基酸对应的58个密码子中,gABG和gmc2存在10个密码子差异,gABO和gmc19存在5个密码子差异。采用邻接法分别构建的系统进化树表明松材线虫与拟松材线虫hsp70和hsp90在系统发育关系上最为接近,并与其他线性动物门物种高度同源。
- 许剑涛黄麟叶建仁
- 关键词：松材线虫拟松材线虫同义密码子分子进化
