郑建洲
- 作品数：2 被引量：8H指数：2
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- 发文基金：江苏省高校自然科学研究项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 河豚4SNc-Tudor蛋白的鉴定及生物信息分析被引量：6
- 2010年
- [目的]对河豚4SNc-Tudor蛋白(SN4TDR)进行序列与结构相关的生物信息分析,为认识该蛋白结构与功能提供借鉴。[方法]应用双向电泳及基质辅助激光解吸离子化-飞行时间质谱(MALD I-TOFMS)技术,从河豚肝脏总蛋白中鉴定到河豚的4SNc-Tudor结构域蛋白。并对其进行生物信息学分析。[结果]首次从河豚肝脏总蛋白中鉴定到河豚的4SNc-Tudor结构域蛋白SN4TDR。河豚SN4TDR定位于细胞质,无信号肽,为非分泌蛋白,有多个磷酸化位点。蛋白SN4TDR存在α-螺旋、β-折叠和无规则卷曲结构,有一个可能形成跨膜结构的片段。并用同源建模的方法,预测了河豚SN4TDR的三维结构模型。[结论]分析河豚SN4TDR基因及蛋白结构,有助于进一步研究该蛋白及其基因的分子和生物学功能。
- 徐庆刚陆健郑建洲陈华友陈克平
- 关键词：河豚MS
- 河豚鱼骨骼肌蛋白组分析被引量：2
- 2009年
- 为了建立一套对河豚骨骼肌总蛋白进行蛋白组分析的技术体系,采用高分辨率的双向电泳技术对河豚骨骼肌总蛋白进行分离,银染后用IMAGEMASTERTM软件分析2D凝胶图谱,共检测出112种以上的蛋白。利用基质辅助质量飞行时间质谱(MALDITOFMS)对分离较好的33个蛋白点进行肽质量指纹图谱分析,并用MASCOT在线软件通过检索NCBInr,MSDB及UniProtKB/TrEMBL等数据库,鉴定其中的21个蛋白点,包括原肌球蛋白等结构蛋白以及各种与代谢相关的酶、与信号传导和细胞凋亡相关的蛋白等。该体系为动态监测河豚鱼骨骼肌在不同水环境及饲料的不当添加等情况下蛋白表达谱的变化提供了新的方法。
- 陆健郑建洲刘海军李军陈克平
- 关键词：河豚骨骼肌双向电泳蛋白质组学
