徐忠能
- 作品数：1 被引量：15H指数：1
- 供职机构：暨南大学生命科学技术学院水生生物研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金广东省自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 12种石鲈科鱼类线粒体16S rRNA基因的部分序列分析被引量：15
- 2007年
- 分析了5属12种石鲈科鱼类的线粒体16S rRNA基因部分序列特征,并参照RNA二级结构模型区分配对区和非配对区。结果表明,配对区对G有偏好(33.5%),非配对区对A有偏好(38.5%);与配对区相比,非配对区存在更多的变异和系统发育信息。从序列的Jukes-Cantor遗传距离结果看,石鲈科胡椒鲷属Plectorhynchus、矶鲈属Parapristipoma、石鲈属Hapalogenys、髭鲷属Pomadasys、Haemulon属5个属属间的差异水平都接近或超过了其与外类群科间的差异水平。从构建的ME系统发育树结果看,石鲈科鱼类分成二大分支,未能形成单一类群。在亲缘关系上,胡椒鲷属和矶鲈属较近,石鲈属和Haemulon属较近,髭鲷属与其它4个属较远,髭鲷属在鲈亚目中的分类地位可能应提高到科的水平。初步确定研究中选用的16S rRNA基因片段基本适用于石鲈科属间和属内种间关系的研究。
- 任岗章群钱开诚徐忠能林小涛
- 关键词：线粒体16SRRNA基因RNA二级结构
