叶佳丽
- 作品数：1 被引量：4H指数：1
- 供职机构：新疆农业大学农学院更多>>
- 发文基金：新疆维吾尔自治区高技术研究发展计划项目中国博士后科学基金新疆维吾尔自治区自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 海岛棉GbHCT基因克隆及生物信息学分析被引量：4
- 2016年
- 克隆海岛棉木质素合成关键酶基因GbHCT全长cDNA序列,分析其在纤维不同发育时期的表达情况。根据海岛棉转录组数据中的HCT序列设计引物,采用RT-PCR技术克隆基因,通过生物信息学方法分析GbHCT的cDNA序列和氨基酸序列。通过分析转录组数据研究GbHCT在纤维不同发育时期的表达。从海岛棉中克隆了1个编码HCT的基因GbHCT,开放阅读框长度为1311bp,编码436个氨基酸,蛋白质分子量为48.58kD,等电点为6.03。GbHCT氨基酸序列中含有HTLGD和DFGWG2个保守基序。GbHCT氨基酸与陆地棉、亚洲棉和雷蒙德氏棉HCT一致性较高,与其他植物中的HCT氨基酸的一致性为55.7%-60.7%。转录组数据分析发现GbHCT在纤维不同发育阶段都有表达,在5DPA的纤维中表达量最高,表明该基因可能参与棉花纤维的发育。
- 崔雪加得拉.吐留汗于月华陈全家申丽婕叶佳丽杨飓立陶顺倪志勇
- 关键词：海岛棉HCT基因克隆生物信息学
