丁奕
- 作品数：7 被引量：28H指数：2
- 供职机构：福建农林大学林学院更多>>
- 发文基金：福建省财政厅资助项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 桉树焦枯病菌内参基因的筛选被引量：4
- 2018年
- 为筛选出桉树焦枯病菌在盐胁迫及侵染桉树叶片两种条件下表达稳定的内参基因,采用实时荧光定量聚合酶链式扩增反应(RT-q PCR)技术分析了桉树焦枯病菌中7个常用内参基因(GAPDH、α-tubulin-1、α-tubulin-2、18S rRNA、ubiquitin、β-actin、β-tubulin)的mRNA差异表达情况,并采用ge Norm软件分析了它们在两种条件下的表达稳定性。结果表明,ubiquitin和α-tubulin-2为桉树焦枯病菌在NaCl胁迫下表达最稳定的基因,且不需要引入第3个基因;18S rRNA和α-tubulin-1为侵染桉树叶片下表达最稳定的基因,但需引入第3个基因GAPDH。因此,ubiquitin和α-tubulin-2为桉树焦枯病菌在NaCl胁迫下较适合的内参基因,而18S rRNA、α-tubulin-1和GAPDH为侵染桉树叶片较适合的内参基因。
- 陈慧洁冯丽贞冯丽贞李慧敏李慧敏杨泽慧
- 关键词：盐胁迫侵染内参基因
- 促进桉树焦枯病菌大量产孢的方法被引量：1
- 2018年
- 为了促进桉树焦枯病菌(Calonectria pseudoreteaudii YA51)在人工培养基上快速、大量的产生分生孢子,本试验在查彼特培养基(Czapek-Dox Medium)的基础上添加桉树叶煎汁、维生素B_1、维生素B_6或南美蟛蜞菊(Wedelia trilobata(L.)Hitchc.)煎汁,测定不同处理对Ca.pseudoreteaudii YA51产孢的影响。结果表明:在查彼特培养基中加入桉树叶煎汁和4g/L的维生素B_1,或者在查彼特培养基中加入南美蟛蜞菊煎汁均可促进Ca.pseudoreteaudii YA51大量产孢,产孢量依次为3.23×10~6、1.43×10~6个/mL。查彼特培养基明确的化学成分比不同时间配出的马铃薯葡萄糖琼脂培养基(Potato Dextrose Agar Medium,PDA)更利于Ca.pseudoreteaudii YA51生长,此方法时间短,操作简单,产孢量高,可满足分子生物学试验要求。
- 郭朦朦丁奕杨泽慧张清华冯丽贞宋漳
- 关键词：蟛蜞菊
- 桉树焦枯病菌CpSit1基因的鉴定与表达被引量：2
- 2017年
- 利用Blast及TCDB数据库对桉树焦枯病菌(Calonectria pseudoreteaudii)的Cpsit1基因进行鉴定;再利用SMART数据库和Prot Param、TMHMM、PHD、Pro Comp 9.0在线分析工具对Cpsit1基因编码蛋白的理化性质、跨膜螺旋、蛋白质二级结构和亚细胞定位进行预测分析;最后采用qRT-PCR方法对CpSit1基因在焦枯病菌侵染桉树过程中的表达情况进行分析.结果表明:CpSit1基因长度为1 780 bp,其编码的蛋白序列共有592个氨基酸残基组成,并将其鉴定为铁载体-铁:H+同向转运蛋白.其保守结构域为MFS_1;共含有14个跨膜螺旋;在二级结构中α螺旋占45.10%,延伸链占26.01%,无规则卷曲占28.89%.通过qRT-PCR相对定量的方法分析焦枯病菌侵染桉树24、48和72 h后CpSit1基因的表达情况,结果显示,CpSit1基因在这3个时段均发生上调表达,但24 h的表达量明显大于48和72 h.说明桉树焦枯病菌CpSit1基因在病原菌侵染寄主的过程中通过调控铁载体-铁化合物的转运来完成铁元素的摄入,协助其在寄主中的定植.
- 刘宏毅叶小真陈慧洁李慧敏丁奕杨泽慧冯丽贞
- 关键词：桉树焦枯病生物信息学分析
- 桉树焦枯病菌MDR基因生物信息学分析及功能解析被引量：1
- 2019年
- 通过生物信息软件及qPCR对桉树焦枯病菌MDR蛋白的序列特征、蛋白结构、理化性质及MDR基因在不同条件下的表达情况进行分析.结果表明,MDR转运蛋白均由α-折叠、无规则卷曲、β-转角,所占百分比α-折叠>β-转角>无规则卷曲.三级与二级结构预测均显示桉树焦枯病菌MDR具有典型的MDR蛋白结构,说明该蛋白家族的进化比较保守;CpABCB10基因参与调控分生孢子稳定性和萌发,CpABCB4和CpABCB9基因参与调控金属离子的转运,CpABCB7和CpABCB8基因参与调控桉树焦枯病菌的抗药机制.此外,CpABCB7基因还能参与调控桉树焦枯病菌的整个致病过程.
- 张清华陆芝张晓阳刘宏毅丁奕叶小真冯丽贞
- 关键词：MDR基因生物信息学
- 闽楠叶斑病病原鉴定及其生物学特性测定被引量：17
- 2018年
- 闽楠是我国特有珍稀优良用材乡土树种,市场前景广阔。叶斑病是闽楠推广种植过程中新出现的叶部病害,可影响树木正常生长。闽楠叶斑病病原鉴定及生物学特性等研究,有助于明确病原分类地位和病害发生流行规律,从而科学有效地指导防治。通过形态学特征观测和r DNA-ITS序列分析,确定闽楠叶斑病病原为小孢拟盘多毛孢(Pestalotiopsis microspora)。生物学特性测定结果表明:闽楠小孢拟盘多毛孢ZZ-03菌株以Czapek或PDA+PBL培养基(pH 6.0)28℃黑暗恒温培养有利于菌丝生长;以PDA培养基(pH 8.0)28℃黑暗恒温培养有利于菌株产孢;以pH 8.0、28℃、全黑暗有利于分生孢子萌发;以葡萄糖为C源、牛肉浸膏为N源有利于菌丝生长,以葡萄糖为C源、蛋白胨为N源有利于产孢;分生孢子萌发与相对湿度呈正相关。
- 陈全助金亚杰郭朦朦宋漳冯丽贞丁奕陈金顺
- 关键词：闽楠叶斑病病原鉴定生物学特性
- 鄂西红豆枝干枯萎病病原菌分离与鉴定被引量：1
- 2021年
- 为了明确鄂西红豆枝干枯萎病的病原菌,对福建省华安县采集获得的鄂西红豆枝干枯萎病样本进行分离、纯化,共分离出23株菌株,将分离到的菌株依据菌落生长特征、菌丝生长状态和孢子特征等进行比较和分类,23株菌株归为6种菌株:HA-1、HA-3、HA-5、HA-7、HA-16和HA-18。经致病性分析,HA-1能够使鄂西红豆产生枝干枯萎病症状,发病症状与野外发病症状相同。结合形态学特征鉴定、及核糖体基因内转录间隔区(ITS)构建系统进化发育树,初步鉴定为砖红镰刀菌,后又结合RPB1基因和RPB2基因串联构建系统进化树的结果,最终将HA-1菌株鉴定为束梗镰刀菌(Fusariumstilboides Wollenw.),此病菌侵染鄂西红豆树尚属首次发现。
- 韩森汇丁奕陈全助邹华南陈清根宋漳
- 关键词：病原鉴定
- 桉树焦枯病菌MAPK的鉴定与生物信息学分析被引量：2
- 2019年
- 利用多种生物信息学网站与软件,从全基因组水平鉴定桉树焦枯病菌的促分裂原活化蛋白激酶(MAPK),并对其理化性质、亚细胞定位、结构域、二级结构、三级结构等进行分析,并构建系统发育树。结果表明,在桉树焦枯病菌中发现4个MAPK,分别命名为CpKss1、CpSlt2、CpHog1和CpIme2,均属于亲水蛋白,亚细胞定位均在细胞核。拥有高度保守的结构域STKc及位于活化环上的双重磷酸化位点T-X-Y,三级结构显示拥有蛋白特异性底物结合口袋特征。通过系统进化分析,这4个MAPK相应基因分别与酵母Fus3/Kss1、Slt2、Hog1和Ime2类基因同源,均和禾谷镰刀菌中相应的MAPK亲缘关系最近。该研究结果为进一步了解桉树焦枯病菌中MAPK的生物学功能和构建MAPK级联途径奠定基础。同时对桉树焦枯病菌致病、桉树抗病相关重要基因功能及分子机制等研究具有重要意义,最终为桉树焦枯病防治工作提供技术支持。
- 陈慧洁陆芝丁奕丁奕宋漳杨泽慧
- 关键词：桉树焦枯病MAPK促分裂原活化蛋白激酶生物信息学分析
