刘伟
- 作品数：2 被引量：2H指数：1
- 供职机构：甘肃农业大学生命科学技术学院更多>>
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- 相关领域：农业科学更多>>
- PRRSV感染猪肺泡巨噬细胞后对Ⅲ型干扰素应答的调控被引量：2
- 2019年
- Ⅲ型干扰素(IFN-λ)是一种新发现的抗病毒因子,在天然免疫和获得性免疫应答方面具有多重功能;猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)感染后造成猪的免疫抑制状态,Ⅰ型和Ⅱ型干扰素的应答受到抑制,IFN-λ的应答情况还不清楚。为揭示PRRSV感染猪后IFN-λ的应答情况与调控机制,以期进一步揭示PRRSV抑制宿主抗病毒免疫应答的分子机理。利用PRRSV强毒与弱毒株感染猪肺泡巨噬细胞(PAM),通过实时荧光定量PCR(real-time PCR)和Western blot检测IFN-λ在mRNA与蛋白水平的差异,并检测了不同非结构蛋白(NSP)对IFN-λ的调控作用。结果发现PRRSV感染PAM细胞后均在mRNA水平上诱导IFN-λ1和IFN-λ3表达上调,且IFN-λ3比IFN-λ1上调更明显;然而在蛋白水平上二者均为表达下调。人源IFN-λ3比IFN-λ1显示出更强的抑制PRRSV复制的作用,且对强毒株GSWW/15的抑制效果更明显。PRRSV NSP7b和NSP9转染PK-15细胞后能使IFN-λ3的mRNA上调表达,但蛋白水平无变化;而NSP7a对IFN-λ3的mRNA和蛋白水平均无影响,提示NSP7b和NSP9可能通过某种机制抑制IFN-λ3的应答。
- 刘伟刘伟张婧孙普孙普刘在新卢曾军
- 关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒
- 藏绵羊FAM134B基因克隆与表达分析
- 2017年
- 采用RT-PCR技术克隆了藏绵羊FAM134B(family with sequence similarity 134,member B)基因,利用生物学软件进行相关生物信息学分析,同时用实时荧光定量PCR(real-time fluorescence quantitative PCR,qRT-PCR)研究组织表达水平。克隆获得FAM134B基因全长1 144 bp(Gen Bank登录号:KX580309),开放阅读框1 071 bp,编码356个氨基酸。系统进化树表明,藏绵羊FAM134B和绵羊、山羊关系较近。藏绵羊FAM134B基因编码蛋白的分子式为C_(1717)H_(2696)N_(448)O_(572)S_(12),分子量为39 151.72 u,理论等电点(pI)为4.49,消光系数为24 450,不稳定系数为43,疏水指数为80.31,平均亲水性为-0.422,属不稳定可溶性酸性蛋白质。二级结构主要是α-螺旋(45.51%)、无规卷曲(41.85%)和延伸链(12.64%),属于混合类蛋白质。亚细胞定位和功能分析结果显示,FAM134B编码的蛋白在内质网、细胞质膜概率分别为30.4%和21.7%,主要在蛋白质运输和结合(77.3%)方面起作用。系统发育树表明,藏绵羊FAM134B氨基酸序列与绵羊、山羊同源性非常高。qRT-PCR结果表明,FAM134B基因网胃中表达最高,十二指肠表达量最低。研究结果可为进一步研究藏绵羊FAM134B基因结构和生理功能及其遗传特性提供理论依据。
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- 关键词：藏绵羊生物信息学分析
