刘伟
- 作品数：1 被引量：0H指数：0
- 供职机构：甘肃省草食动物生物技术重点实验室更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 藏绵羊FAM134B基因克隆与表达分析
- 2017年
- 采用RT-PCR技术克隆了藏绵羊FAM134B(family with sequence similarity 134,member B)基因,利用生物学软件进行相关生物信息学分析,同时用实时荧光定量PCR(real-time fluorescence quantitative PCR,qRT-PCR)研究组织表达水平。克隆获得FAM134B基因全长1 144 bp(Gen Bank登录号:KX580309),开放阅读框1 071 bp,编码356个氨基酸。系统进化树表明,藏绵羊FAM134B和绵羊、山羊关系较近。藏绵羊FAM134B基因编码蛋白的分子式为C_(1717)H_(2696)N_(448)O_(572)S_(12),分子量为39 151.72 u,理论等电点(pI)为4.49,消光系数为24 450,不稳定系数为43,疏水指数为80.31,平均亲水性为-0.422,属不稳定可溶性酸性蛋白质。二级结构主要是α-螺旋(45.51%)、无规卷曲(41.85%)和延伸链(12.64%),属于混合类蛋白质。亚细胞定位和功能分析结果显示,FAM134B编码的蛋白在内质网、细胞质膜概率分别为30.4%和21.7%,主要在蛋白质运输和结合(77.3%)方面起作用。系统发育树表明,藏绵羊FAM134B氨基酸序列与绵羊、山羊同源性非常高。qRT-PCR结果表明,FAM134B基因网胃中表达最高,十二指肠表达量最低。研究结果可为进一步研究藏绵羊FAM134B基因结构和生理功能及其遗传特性提供理论依据。
- 李文丽杜晓华刘霞高景波申超超张超张超
- 关键词：藏绵羊生物信息学分析
