唐楠
- 作品数：3 被引量：14H指数：1
- 供职机构：大连理工大学计算机科学与技术学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划中央高校基本科研业务费专项资金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术生物学更多>>
- 蛋白质关系网络中的络合物发现算法的研究
- 随着生物医学界大量生物医学实验的实现,产生了海量的蛋白质关系数据,这些蛋白质关系构成了现有的蛋白质关系数据库。而海量的蛋白质关系能够形成复杂的网络,在复杂的关系网络中抽取有效的信息成为当前的研究热点,其中络合物预测和模块...
- 唐楠
- 文献传递
- 基于多核学习的医学文献蛋白质关系抽取被引量：13
- 2011年
- 从生物医学文献中抽取蛋白质交互作用关系对蛋白质知识网络的建立、新药的研制等均具有重要的意义。为此,提出一种基于多核学习的方法,用于从文献中自动抽取蛋白质关系信息。该方法融合基于特征的核、树核以及图核,并扩展最短路径依存树以及依存路径以利用更多的上下文关系信息。在AImed语料上的实验得到63.9%的F值和87.83%的AUC值,表明该方法具有较好的性能。
- 唐楠杨志豪林鸿飞李彦鹏
- 关键词：文本挖掘信息抽取蛋白质关系抽取核方法多核学习
- 基于监督学习的蛋白质络合物抽取方法被引量：1
- 2011年
- 蛋白质关系网络中存在着大量的蛋白质络合物,络合物对有利于深入探索生物细胞的组织原理和功能有着重要意义。然而传统的络合物发现算法多基于网络的拓扑结构,没有融合络合物本身的结构信息。针对这个问题,提出了监督学习的络合物发现方法,将多种能够标示络合物的信息作为特征,使用监督学习方法对样本集进行训练,将训练得到的模型应用在络合物发现算法中。实验证明,该方法能有效地从蛋白质关系网络中发现络合物。
- 唐楠杨志豪吴佳金王艳华林鸿飞
