吕贯廷
- 作品数：7 被引量：8H指数：2
- 供职机构：中国科学院北京基因组研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金北京市自然科学基金教育部科学技术研究重点项目更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生自动化与计算机技术更多>>
- miR-424和miR-503对人直肠癌细胞系增殖的影响被引量：1
- 2017年
- 目的探讨miR-424和miR-503对人直肠癌细胞株SW620和SW480细胞增殖的影响,并筛选其靶基因。方法直肠癌细胞株SW620和SW480分为SW480组、SW480-miR-424组、SW480-miR-503组、SW620组、SW620-miR-424组、SW620-miR-503组;SW480组和SW620组细胞正常培养,SW480-miR-424组、SW480-miR-503组、SW620-miR-424组和SW620-miR-503组细胞分别采用慢病毒载体pSLIK-Zeo构建miR-424和miR-503直肠癌细胞系;SW620细胞系各组于不同培养时间进行细胞计数并绘制细胞生长曲线;采用荧光定量PCR法检测SW480组、SW620组细胞中miR-424和miR-503表达水平;采用RNA-seq法筛选miR-424和miR-503的靶基因,并采用Western blot对靶基因进行验证。结果miR-424和miR-503在SW480细胞中呈高表达,在SW620细胞中呈低表达;SW480组miR-424-3p(9.572±2.171)、miR-424-5p(13.891±1.124)和miR-503(6.792±1.412)表达水平高于SW620组(1.026±2.874、1.103±0.411、0.984±0.847),差异有统计学意义(P<0.01);各时间点SW620-miR-424组和SW620-miR-503组细胞数量均少于SW620组(P<0.01),SW620-miR-503组少于SW620-miR-424组(P<0.01);RNA-seq测序分析结果显示,SW620和SW480细胞共有1 413个差异表达基因,其中有50个肿瘤标志物,WEE1蛋白为极高表达者,miR-424和miR-503均可与WEE1的3UTR序列结合,且miR-424的结合能力高于miR-503;SW620组细胞WEE1蛋白表达水平(8.69±3.24)高于SW480组(5.94±2.37)(P<0.01),SW480-miR-424组和SW480-miR-503组细胞WEE1蛋白表达水平(2.19±1.72、3.45±2.16)明显低于SW480组(P<0.01),SW620-miR-424组和SW620-miR-503组细胞WEE1蛋白表达水平(4.31±2.63、5.37±3.25)明显低于SW620组(P<0.01)。结论miR-424和miR-503抑制细胞周期检查点激酶WEE1的表达,进而调节细胞的增殖能力,参与肿瘤发生、发展过程。
- 刘畅李枫崔伟阮新建刘彦芳亢玺刚张建伟吕贯廷张侠
- 关键词：直肠癌RNA-SEQ
- 人类基因组中巢式基因对的系统分析
- 2010年
- 基因组上一个基因的所有或大部分外显子位于另一基因内含子和UTR中被称为巢式基因(Nested gene)。巢式基因对(Nested gene pair)是由主基因(Host gene)和巢式基因组成的基因对。文章针对人类基因组上的顺式巢式基因对(简称为巢式基因对)进行全基因组鉴定,并通过比较巢式基因对在人和小鼠基因组上的保守性分布,研究巢式基因对的进化方式。保守性分析表明基因转座、序列原位突变和主基因转录起始/终止位点突变是巢式基因对进化的主要原因,其中主基因转录起始/终止位点突变是巢式基因对独特的一种进化方式。Gene On-tology分析揭示大部分巢式基因与主基因的产物在功能上没有相关性。
- 屠鞠传礼吕贯廷曾长青
- 关键词：主基因进化机制
- 中国遗传性神经性肌强直家系调查和遗传学特征分析被引量：5
- 2011年
- 目的寻找遗传性神经性肌强直表型缺陷,并进行家系分析。方法对家系成员进行实地调查,并绘制系谱图;对调查的家系成员进行病史、神经系统检查3,例患者进行了肌电图检查。结果收集到一个5代53人的遗传性神经性肌强直家系1,7人患有该病症,其中男性13人,女性4人,发病年龄为10～20岁。临床主要表现为肌肉强直和肌肉颤搐,受累肌群包括颈部、腹部、四肢和咽喉肌肉,无发作性共济失调和癫痫发作。家系分析表明为常染色体显性遗传。结论该家系为常染色体显性遗传,主要累及周围神经系统,无中枢神经系统异常表现。受累肌肉广泛,包括极为罕见的咽喉肌。不能除外为新的致病基因所致。
- 伍文清陈伟李继梅曾长青吕贯廷易立仇叶萍肖玉莲
- 关键词：常染色体显性遗传家系
- 一种对接口芯片的元器件进行布局的方法
- 本发明公开了一种对接口芯片的元器件进行布局的方法，特别涉及对单片机的一种接口芯片中的各个元器件进行布局的方法。该方法首先为目标值构造目标函数、并引入拉格朗日乘子对目标函数进行松弛、定义了松弛后的目标函数的对偶形式、利用次...
- 吕聪颖张凌晓赵刚彬万小磊吕贯廷
- 文献传递
- 哺乳动物基因组中共转录和基因间拼接产生的转录复杂度研究
- 蛋白编码基因的转录通常从启动子开始，在该基因的转录终止位点结束，这个过程是受到精细调节的。偶有报道表明，基因的转录有时可以通读与其相邻基因之间的基因间区，在其下游基因终止转录活动，从而产生大的包含两个基因外显子的融合转录...
- 吕贯廷
- 关键词：哺乳动物
- 动态规划法求解加工顺序问题的研究
- 2012年
- 提出动态规划法求解加工顺序问题的方法,分析最优子结构性质,建立最优值的递归关系式,分析Johnson-Bell-man’s Rule并设计算法流程,最后通过构造实例表明了算法的有效性。
- 王保胜吕聪颖吕贯廷马艳阳
- 关键词：动态规划
- 真核生物基因组转录诱导融合基因的研究进展被引量：2
- 2007年
- 真核生物的基因组由基因和基因间区组成.基因转录时,从转录起始点开始到该基因的转录终止点结束,形成独立的转录单元.然而有少量的文献表明,转录有时会通读基因间区,产生包含上游基因、基因间区和下游基因的融合基因转录本.融合转录本经基因间剪接而成为有功能的成熟转录本.对真核生物转录诱导融合基因的基因间剪接方式、产生机制和意义进行了综述.
- 吕聪颖赵刚彬吕贯廷
- 关键词：转录
