马晓茜
- 作品数：3 被引量：23H指数：2
- 供职机构：上海海洋大学水产与生命学院水产种质资源发掘与利用省部共建教育部重点实验室更多>>
- 发文基金：上海市教育委员会科技发展基金国家公益性行业科研专项上海市教育委员会重点学科基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 团头鲂主要组织相容性复合体Ⅰ类基因全长cDNA的克隆及组织表达分析被引量：10
- 2011年
- 为了解团头鲂MHCⅠ类基因的结构,采用cDNA末端快速扩增(Rapid-amplification of cDNA ends,RACE)技术,首次成功克隆了团头鲂"浦江Ⅰ号"F0基础群体及选育F8世代的MHCⅠ类基因,共获得3条cDNA全长序列。序列全长为2 040～2 079 bp,含有87～102 bp的5'-UTR,1 035～1 044 bp的编码区(包括信号肽,alpha 1、alpha 2和alpha 3三个结构域,跨膜区和胞质区)及911～946 bp的3'-UTR区,分别编码347、344个氨基酸。F8世代序列的核苷酸/氨基酸的同源性很高,为89.0%/93.0%,而与F0世代的同源性较低(75.3%～77.0%和71.1%～71.4%),呈现出明显的分子多态性。分析表明,团头鲂具有经典的MHCⅠ类分子的空间结构,与人类HLA-A2的抗原肽结合区的晶体结构相比,二者的差异主要集中在5个(I～V)区上。在Neighbor-joining(NJ)法构建的分子进化树中,团头鲂与草鱼的亲缘关系最近,与鲑鳟鱼类、爬行类、鸟类、哺乳类及人类的亲缘关系则渐远。RT-PCR组织表达分析表明,团头鲂MHCⅠ类基因在所检测的的8个组织中均表达,在鳃、头肾和血液中有较强的转录本,中等强度表达于肝脏和脾脏,在后肾、肠和肌肉中表达较弱。
- 马晓茜刘至治李思发唐文乔杨金权
- 关键词：团头鲂主要组织相容性复合体克隆
- “全红”体色瓯江彩鲤MHC-DAB基因多态性及其与鱼体抗病力关系的分析被引量：17
- 2011年
- 利用一对特异性引物DABF和DABR,分别从21尾感病和16尾抗病"全红"体色瓯江彩鲤的cDNA中,扩增出长度为624 bp的MHC-DAB基因片段。共测序185个有效克隆,获得76个不同的核苷酸序列。MHC-DAB基因片段包括第1～4外显子,分别编码信号肽、β1和β2结构域及跨膜区。长度为276 bp的β1结构域有144个核苷酸变异位点(52.17%)和70个氨基酸变异位点(76.07%),而长度为282 bp的β2结构域只有98个核苷酸变异位点(34.75%)和50个氨基酸变异位点(53.19%),显示β1结构域的变异要明显大于β2结构域。在β1结构域的24个抗原结合位点(PBR)上,有23个发生了变异。β1结构域的PBR、非抗原结合位点(non-PBR)及β2结构域的ω值(ω=dN/dS)分别为1.367、0.886和0.754,表明"全红"体色瓯江彩鲤MHC-DAB基因(特别是β1结构域)在进化过程中受到正向选择作用。在所得的20个不同的等位基因中,基因DAB3*15在抗病群体中出现的频率(13.75%)显著高于感病群体中出现的频率(3.81%)(P<0.05);基因DAB3*09和DAB3*10的出现频率都为3.75%(P<0.05),仅存在于抗病群体中;而基因DAB3*02和DAB3*14的出现频率分别为7.62%(P<0.05)和8.57%(P<0.01),仅存在于感病群体中。
- 李雪松刘至治赵雪锦马晓茜冯维王成辉
- 关键词：瓯江彩鲤主要组织相容性复合体多态性
- 大弹涂鱼微卫星引物的开发
- 应用5'-锚定PCR技术直接从大弹涂鱼基因组DNA中扩增SSR序列.采用PCR法快速筛选阳性克隆，随机挑取134个克隆进行测序，发现均含有微卫星序列，阳性克隆的得率达到了100％.设计出39对大弹涂鱼微卫星引物，...
- 刘至治马晓茜冯维陆桑倪
- 关键词：大弹涂鱼微卫星引物
