于畅宇
- 作品数：2 被引量：1H指数：1
- 供职机构：大连理工大学更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 基于ISC-SVR方法预测Th细胞表位被引量：1
- 2013年
- 外源性抗原蛋白被抗原提呈细胞(APC)摄取送入溶酶体中被降解为长度不一的肽段.在HLA-DM分子辅助下,MHC II类分子相关恒定链多肽(class II-associated invariant chain peptide,CLIP)从MHC II类分子的肽结合槽解离,使得外源性抗原降解的肽段进入MHC II类分子空的肽结合槽中,形成稳定的抗原肽-MHC II类分子复合物.之后再被提呈到APC细胞表面供CD4+Th细胞的TCR识别,激活Th细胞分泌细胞因子,促进CTL细胞特异性杀伤靶细胞或辅助B细胞产生抗体.Th细胞的活化对机体的细胞免疫和体液免疫功能都有重要的辅助作用.本工作基于迭代自洽策略与支持向量回归机(ISC-SVR)方法建立了MHC II类分子与外源性抗原肽结合亲合力预测模型,采用13mer扩展核心结合序列可以提高预测模型的性能,分别按照均值法、最大值法、结合法、加权平均值法4种方法计算MHC II类分子与抗原肽的结合亲合力值.对17种MHC II类分子配型进行了回归分析,与其他预测模型相比较,本工作模型都得到了最佳AUC值.最后,以HLA DRB1*0101分子为例,分析讨论了MHC II类分子与抗原肽的结合特异性.
- 于畅宇刘伟刘涛宋哲朱鸣华
- 关键词：T细胞表位MHCII类分子支持向量回归机
- 基于ISC-SVR方法预测Th细胞表位
- 外源性抗原蛋白被抗原提呈细胞(APC)摄取送入溶酶体中被降解为长度不一的肽段。在HLA-DM分子辅助下，MHCⅡ类分子相关恒定链多肽(CLIP)从MHCⅡ类分子的肽结合槽解离，使得外源性抗原降解的肽段进入MHCⅡ类分子空...
- 于畅宇
- 关键词：抗原蛋白细胞免疫
- 文献传递
