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2024年7月15日星期一

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PLS方法应用于T细胞表位定量构效关系研究: T细胞是最重要的免疫细胞,它的主要功能是介导细胞免疫和调节机体的免疫功能。细胞毒性T细胞能够直接对肿瘤细胞进行特异性杀伤。要使T细胞发挥它的免疫功能,需要激活T细胞的免疫应答,使T细胞活化、增殖、分化。可是T细胞不能直接...; 宋哲; 关键词：主要组织相容性复合体抗原肽定量构效关系偏最小二乘法; 文献传递

PLS方法应用于T细胞表位定量构效关系的研究被引量：7: 2007年; 目的研究了CTL表位与MHC分子结合的定量构效关系模型。方法采用偏最小二乘法(PLS)对校正集进行校正,并对预测集中的样本进行预测。结果得到比较满意的短肽-MHC分子结合亲合力与短肽氨基酸序列之间的关系式;模型的预测精确度达到66.8%。结论偏最小二乘方法可作为CTL表位预测方法。用该模型对预测样本进行短肽-MHC分子的结合亲合力的预测,结果令人满意,说明这种模型在预测CTL表位方面是可行的。; 宋哲刘涛王雪莹刘伟; 关键词：CTL表位定量构效关系偏最小二乘法

日中两国语中“的”字的对照研究: 2004年在参与《中国日语学习者对译作文语料库》（DLUT）的构建过程中,发现了不少有关日语中结尾辞“的”的误用现象。迄今为止,从日语或汉语单方面的角度出发,对“的”字进行研究的比较多。但是...; 宋哲; 文献传递

基于SVM方法分析蛋白酶体裂解位点的特异性被引量：2: 2008年; 真核细胞中的泛素-蛋白酶体系统在抗原肽加工呈递途径中发挥着重要作用.为了进一步研究蛋白酶体的酶切位点特异性,采用支持向量机(support vector machine,SVM)方法建立了蛋白酶体的酶切位点预测模型.在相同检验集下,将本模型性能指标与其他预测模型方法比较,结果是本模型性能指标优先,预测准确度为83.1%.由样本数据相应氨基酸对酶切位点形成的权重系数,得出蛋白酶体酶切位点及其两侧区域氨基酸的裂解特异性,反映了蛋白酶体裂解抗原蛋白的相互作用信息,这表明蛋白酶体对抗原蛋白的酶切处理不是随机的,而是有一定模式和选择性的.; 刘涛宋哲焦春波刘伟朱鸣华王晓钢; 关键词：支持向量机蛋白酶体抗原肽

承销商行为及声誉对IPO抑价影响的研究: 本文基于中国发行市场背景，从承销商行为与声誉的角度研究了中国新股发行市场长期存在的IPO抑价现象。　　通过研究我国询价配售制度下的承销商行为，发现目前询价配售机制容易使得承销商与机构投资者因利益捆绑而达成“询价配售联盟”...; 宋哲; 关键词：IPO抑价承销商声誉新股发行金融市场; 文献传递

应用独立成分分析方法预测CTL表位: 2010年; 基于独立成分分析方法分别采用3 z-scale和5 z-scale氨基酸结构描述符,建立了抗原肽与MHC分子(major histocompatibility complex,MHC)相互作用结合的定量构效关系模型.该两个模型训练集样本数是316,预测集样本数是786.结果表明:3z-scale模型的预测准确度和AUC值分别为70.3%,0.70;5 z-scale模型的预测准确度和AUC值分别为70.9%,0.79.本文建立CTL表位预测模型对进一步了解抗原肽与MHCI类分子相互作用机理具有一定的帮助.; 董素梅宋哲刘涛朱鸣华刘伟; 关键词：CTL表位定量构效关系

基于ISC-SVR方法预测Th细胞表位被引量：1: 2013年; 外源性抗原蛋白被抗原提呈细胞(APC)摄取送入溶酶体中被降解为长度不一的肽段.在HLA-DM分子辅助下,MHC II类分子相关恒定链多肽(class II-associated invariant chain peptide,CLIP)从MHC II类分子的肽结合槽解离,使得外源性抗原降解的肽段进入MHC II类分子空的肽结合槽中,形成稳定的抗原肽-MHC II类分子复合物.之后再被提呈到APC细胞表面供CD4+Th细胞的TCR识别,激活Th细胞分泌细胞因子,促进CTL细胞特异性杀伤靶细胞或辅助B细胞产生抗体.Th细胞的活化对机体的细胞免疫和体液免疫功能都有重要的辅助作用.本工作基于迭代自洽策略与支持向量回归机(ISC-SVR)方法建立了MHC II类分子与外源性抗原肽结合亲合力预测模型,采用13mer扩展核心结合序列可以提高预测模型的性能,分别按照均值法、最大值法、结合法、加权平均值法4种方法计算MHC II类分子与抗原肽的结合亲合力值.对17种MHC II类分子配型进行了回归分析,与其他预测模型相比较,本工作模型都得到了最佳AUC值.最后,以HLA DRB1*0101分子为例,分析讨论了MHC II类分子与抗原肽的结合特异性.; 于畅宇刘伟刘涛宋哲朱鸣华; 关键词：T细胞表位 MHCII类分子支持向量回归机

基于改进的人工神经网络方法预测CTL表位被引量：7: 2007年; 为简化细胞病毒T细胞(cytotoxicity T lymphocytek,CTL)表位鉴定方法,应用改进的人工神经网络方法定量研究了短肽与MHC(major histocompatibility complex)分子结合亲合力的关系,并建立了CTL表位的预测模型,得到了预测模型最优性能参数.用此模型对短肽与HLA-A*0201分子结合的805个预测样本进行了预测,预测准确度达到73.8%.对来自黑色素MAGE-2的短肽与MHC分子的结合亲合力也进行了预测,结果较好.; 刘涛宋哲刘伟王雪颖邱晓明; 关键词：人工神经网络 BP网络 CTL表位

蛋白酶体对抗原蛋白酶切特异性的研究: 2008年; 在MHCI类分子结合的抗原表位加工呈递途径中,泛素-蛋白酶体系统对抗原蛋白的降解发挥着重要作用.为了进一步研究蛋白酶体的酶切特异性,采用偏最小二乘方法(partial least squares method,PLS)建立了蛋白酶体的酶切位点预测模型,预测准确度为82.8%;由样本数据相应氨基酸对酶切位点形成的权重系数,得出蛋白酶体酶切位点及其两侧区域氨基酸的裂解特异性,它反映了蛋白酶体对抗原蛋白酶切的相互作用信息,也表明蛋白酶体对抗原蛋白酶切处理不是随机的,而是有一定模式和选择性的.; 宋哲刘涛焦春波刘伟朱鸣华王晓刚; 关键词：蛋白酶体抗原表位偏最小二乘法

PLS方法在T细胞表位预测中的应用: T细胞表位能够激活T细胞的免疫应答，在特异性免疫应答中发挥重要的作用。而T细胞表位的产生依赖于抗原加工提呈过程。细胞毒性T细胞(cytotoxicy T lymphocyte，CTL)表位的产生需要经过内源性抗原蛋白被蛋...; 宋哲; 关键词：细胞免疫应答; 文献传递

宋哲