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文献类型

  • 2篇期刊文章
  • 1篇学位论文

领域

  • 3篇生物学
  • 1篇农业科学

主题

  • 3篇蛋白
  • 3篇蛋白酶
  • 3篇蛋白酶体
  • 3篇抗原
  • 2篇特异
  • 2篇特异性
  • 1篇支持向量
  • 1篇支持向量机
  • 1篇偏最小二乘
  • 1篇偏最小二乘法
  • 1篇肿瘤
  • 1篇肿瘤疫苗
  • 1篇向量
  • 1篇向量机
  • 1篇裂解位点
  • 1篇酶切
  • 1篇抗原表位
  • 1篇抗原蛋白
  • 1篇抗原肽
  • 1篇SVM

机构

  • 3篇大连理工大学

作者

  • 3篇焦春波
  • 2篇刘涛
  • 2篇朱鸣华
  • 2篇宋哲
  • 2篇刘伟
  • 1篇王晓刚
  • 1篇王晓钢

传媒

  • 1篇中国科学(B...
  • 1篇化学学报

年份

  • 3篇2008
3 条 记 录,以下是 1-3
排序方式:
ANN方法在蛋白酶体酶切研究中的应用
蛋白酶体(Proteasome)在抗原肽加工提呈过程中发挥着重要的酶切功能。为了进一步研究蛋白酶体酶切特异性,本文基于神经网络方法预测蛋白酶体的酶切位点,采用10折交叉验证法得到预测准确度为80.21%。在相同检验集下,...
焦春波
关键词:蛋白酶体抗原蛋白肿瘤疫苗
文献传递
基于SVM方法分析蛋白酶体裂解位点的特异性被引量:2
2008年
真核细胞中的泛素-蛋白酶体系统在抗原肽加工呈递途径中发挥着重要作用.为了进一步研究蛋白酶体的酶切位点特异性,采用支持向量机(support vector machine,SVM)方法建立了蛋白酶体的酶切位点预测模型.在相同检验集下,将本模型性能指标与其他预测模型方法比较,结果是本模型性能指标优先,预测准确度为83.1%.由样本数据相应氨基酸对酶切位点形成的权重系数,得出蛋白酶体酶切位点及其两侧区域氨基酸的裂解特异性,反映了蛋白酶体裂解抗原蛋白的相互作用信息,这表明蛋白酶体对抗原蛋白的酶切处理不是随机的,而是有一定模式和选择性的.
刘涛宋哲焦春波刘伟朱鸣华王晓钢
关键词:支持向量机蛋白酶体抗原肽
蛋白酶体对抗原蛋白酶切特异性的研究
2008年
在MHCI类分子结合的抗原表位加工呈递途径中,泛素-蛋白酶体系统对抗原蛋白的降解发挥着重要作用.为了进一步研究蛋白酶体的酶切特异性,采用偏最小二乘方法(partial least squares method,PLS)建立了蛋白酶体的酶切位点预测模型,预测准确度为82.8%;由样本数据相应氨基酸对酶切位点形成的权重系数,得出蛋白酶体酶切位点及其两侧区域氨基酸的裂解特异性,它反映了蛋白酶体对抗原蛋白酶切的相互作用信息,也表明蛋白酶体对抗原蛋白酶切处理不是随机的,而是有一定模式和选择性的.
宋哲刘涛焦春波刘伟朱鸣华王晓刚
关键词:蛋白酶体抗原表位偏最小二乘法
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