丁勤学
- 作品数：19 被引量：188H指数：6
- 供职机构：北京师范大学生命科学学院细胞增殖及调控生物学实验室更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划北京市自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学理学更多>>
- 高氧液对大鼠烫伤后肠黏膜下调蛋白质的影响被引量：3
- 2005年
- 目的观察高氧液对烫伤大鼠肠黏膜下调蛋白质的影响,为伤后早期应用高氧液治疗提供理论依据。方法制作大鼠35%TBSAⅢ度烫伤模型,设烫伤后普通补液组(烫伤组)、伤后输入高氧液为干扰因素组(高氧液组)和正常对照组,每组6只。利用高分辨双向电泳(2DE)对肠黏膜组织进行蛋白质分离,采用Imagemaster2DElite图像分析软件进行分析,应用生物质谱、蛋白质库及文献分析等方法研究高氧液对大鼠烫伤后肠黏膜下调蛋白质的影响。结果烫伤组大鼠明确下调的34个蛋白质点中,高氧液组出现明确上调的蛋白质点数为9。它们是线粒体乌头酸酶、丙酰辅酶A羧化酶、短链羟酰基辅酶A脱氢酶、雌二醇安息香酸盐转录因子、磷酸丙糖异构酶1、T淋巴细胞受体Vδ6和类动力蛋白5。结论高氧液可以上调大鼠严重烧伤后早期肠黏膜中的下调蛋白质,进而部分恢复肠黏膜的屏障功能。
- 王晓军孙永华王建宁丁勤学张莉萍宋国成肖宏
- 关键词：高氧液烫伤蛋白质生物质谱动力蛋白T淋巴细胞受体
- 赤芍治疗热毒血瘀证的血清蛋白质组变化的初步研究被引量：62
- 2005年
- 目的研究赤芍对大鼠热毒血瘀证的血清蛋白质组变化的影响。方法用双向电泳(two-di-mensionalelectrophoresis,2DE)分析正常组、内毒素组〔用脂多糖(Lipopolysaccharide,LPS)静脉注射〕、赤芍组(灌胃给药)、LPS(静脉注射)+赤芍(灌胃给药)组之间的血清蛋白质组表达差异。结果(1)LPS致热毒血瘀证大鼠的血清在2DE胶上13个蛋白点(xPr)出现非常明显的含量变化,与正常组比较,LPS组的xPr16、xPr19的点容量值均显著降低,xPr1、xPr2、xPr3、xPr4、xPr6、xPr7、xPr8、xPr9、xPr11、xPr12、xPr23的点容量值均显著增高。(2)LPS+赤芍组与LPS组比较,LPS引起增高的xPr1、xPr2、xPr3、xPr4、xPr9的点容量值均显著降低,LPS引起降低的xPr16的点容量值显著增高,但xPr16的点容量值仍显著低于正常组,xPr1、xPr4、xPr9的点容量值均显著高于正常组;LPS+赤芍组的xPr2、xPr3两个蛋白点已被明显调节到正常状态;赤芍组除xPr2、xPr4外,在xPr1,xPr3,xPr9,xPr16点均表现对LPS显著的交互作用。(3)对xPr19,赤芍和LPS两因素显著的交互作用有协同性。(4)赤芍组xPr13、xPr14的点容量值均显著高于正常组,xPr15、xPr17的点容量值均显著低于正常组,这4个蛋白点LPS组与正常组比较差异均无显著性。结论通过调节xPr1、xPr2、xPr3、xPr4、xPr9、xPr16蛋白点,可能是赤芍治疗热毒血瘀证的疗效的分子基础。
- 谢文光马晓昌邵宁生丁勤学赵馨刘农乐魏钰书王会信陈可冀
- 关键词：血清蛋白质组热毒血瘀证赤芍灌胃给药正常组分子基础
- 神经蛋白质组学关键技术的创新、改进和应用
- 刘少君丁勤学郭尧君王光辉贾宇峰赵从建阙海萍林秋霞
- 为改进蛋白质样品制备技术中2DE的重复性、灵敏度、影响匹配性的诸多因素以及质谱鉴定蛋白质等几个关键环节而开展此次项目。建立了从蛋白质样品制备到MALDI-TOF分析的一整套神经蛋白质组学技术；采用三步法提取神经组织蛋白质...
- 关键词：
- 关键词：蛋白质组学蛋白质磷酸化
- 肽质量指纹图谱中实验因素引起的氨基酸修饰以及相应肽段的质量变化被引量：1
- 2006年
- 目的:肽质量指纹图谱是蛋白质组研究中最重要的蛋白鉴定手段之一,而氨基酸残基的化学修饰会导致图谱中肽质量的改变。本文对实验性因素可能引起的这种质量改变进行了较为系统的观察和小结。方法:本文分析了多个标准蛋白基于SDS-PAGE分离的肽质量指纹图谱的实验结果,综合报道由各种实验因素引起的氨基酸残基体外化学修饰以及相应的肽质量变化。结果:这些化学修饰至少包括:①半胱氨酸残基丙烯酰胺加合物生成或乙酰基烷基化修饰,相应的肽段质量数分别增加71.04和57.02;②甲硫氨酸残基的氧化修饰,相应肽段质量数增加15.99(单甲硫氨酸氧化)或其倍数(多甲硫氨酸氧化);③酸性氨基酸残基的成盐反应,相应肽段质量数增加21.98(加钠盐)或37.95(加钾盐);④酸性氨基酸残基的酯化反应,相应肽段质量数增加14.03(甲醇固定)或28.03(乙醇固定);⑤碱性氨基酸(赖氨酸)残基与甲醛发生西佛碱反应,相应肽段质量数增加27.99。以上各种氨基酸的体外修饰,以甲硫氨酸的氧化修饰最为常见;酸性氨基酸的酯化反应通常发生在蛋白固定步骤;碱性氨基酸(赖氨酸)的西佛碱反应是由于蛋白质银染时增色剂甲醛的引入。特别注意的是,某些肽段可以同时发生多种化学修饰,使得肽质量指纹图谱的解析复杂化。结论:以上实验因素引起的氨基酸修饰以及相应的肽质量变化在蛋白质数据库检索和蛋白质鉴定时必须加以考虑。
- 丁勤学熊少祥刘进赵馨阙海萍刘少君
- 关键词：肽质量指纹图谱化学修饰体外
- 成年和老年小鼠脑蛋白质组双向电泳图谱比较被引量：34
- 2001年
- 使用双向电泳 (2 DE)比较成年和老年小鼠脑蛋白质差异 ,从分子水平初步探索老年脑蛋白整体变化规律 .以固相 pH梯度等电聚焦为第一向 ,SDS 聚丙烯酰胺凝胶水平电泳 (PAGE)为第二向进行 2 DE .图象分析软件Imagemaster 2DElite分析电泳图谱 .重复性实验结果显示 ,同组样品在三次不同实验中所得蛋白质斑点数目的相对标准差 (变异系数 )为 4 43%± 0 2 5 % ;同一蛋白质斑点在三次实验中等电点、分子质量和蛋白质量的相对标准差分别为 8 76 %± 5 14% ,13 0 0 %± 4 2 2 %和 10 84%± 9 16 % .成年和老年小鼠脑组织 2 DE图谱分别获得 996和 12 5 6个蛋白质斑点 ,其中 8个蛋白质在老年脑组织中含量降低 ,2 0个蛋白质斑点含量增加 .另至少有 4个蛋白质斑点在老年脑组织中缺失 ,14个蛋白质点为老年脑特有 .
- 丁勤学阙海萍郭尧君景书谦刘少君
- 关键词：脑蛋白固相PH梯度双向电泳图谱成年小鼠脑老化
- 大鼠烫伤后肠黏膜上调蛋白质组的分离鉴定及其功能分析被引量：4
- 2004年
- 目的 观察严重烧伤后早期肠黏膜上调蛋白的整体变化特性 ,并对明确的蛋白质进行功能分析 ,为探讨严重烧伤后肠黏膜损害的发病机制提供理论依据。 方法 采用大鼠Ⅲ度烫伤模型 ,利用高分辨双向电泳 ( 2 -DE)对肠黏膜组织进行蛋白质分离 ,ImageMaster 2DElite图像分析软件进行分析 ,应用生物质谱、蛋白质库及文献分析等技术对差异蛋白质中的上调蛋白质组进行鉴定、功能和临床意义分析。 结果 ( 1)烧伤后 6和 12h两组明确下调的蛋白质点数为34,进行检测及功能分析的蛋白质 2 2个 ;( 2 )糖调控蛋白前体 78、蛋白质二硫化物异构酶A3(PDIA3)前体、基质金属蛋白酶 11、α -烯醇酶和鸟氨酸转化酶等参与了对应激反应的调控。有其他蛋白质 ,如白蛋白、乳酸脱氢酶A、T细胞活化连接蛋白、辅酶Q和eps8捆绑蛋白呈现上调表达。 结论 这些上调的蛋白质的表达改变主要参与了肠黏膜的应激反应及其他病理反应的调控。
- 王晓军孙永华丁勤学宋国成景燕茹张莉萍曹原
- 关键词：上调烫伤严重烧伤蛋白质组生物质谱
- 肽指纹图谱中未匹配质量数据的实验因素分析
- ＜正＞ 肽指纹图谱（PMF）是快速灵敏鉴定蛋白的新的有效方法。由于种种原因,实验得到的一整套质量数据与蛋白数据库中该蛋白的一整套理论值相比,存在或多或少的差异,许多肽片段的实验质量值无法与理论值相匹配。本文分析了导致肽指...
- 丁勤学肖林熊少祥刘少君
- 文献传递
- 生物质谱在蛋白质组学研究中的应用被引量：22
- 2004年
- 本文简述了生物质谱的发展以及在蛋白质组学研究中的应用。
- 黄凌云赵和平丁勤学何大澄
- 关键词：蛋白质组学生物质谱基因测序电喷雾质谱
- 中枢神经蛋白质组分析中双向电泳技术的建立被引量：20
- 2000年
- 建立和优化了中枢神经组织蛋白质组分析所需的双向电泳及相关技术 .由于中枢神经组织结构的特殊性 ,样品处理非常困难 .对样品液组成、样品处理、上样方式、上样量、IPG胶条和SDS 聚丙烯酰胺凝胶电泳染色方法和保存等相关技术进行了比较研究和条件优化后 ,以固相 pH梯度等电聚焦为第一向和SDS均一胶 (T =12 5 % )的水平电泳为第二向 。
- 赵从建贾宇峰丁勤学阙海萍刘少君郭尧君
- 关键词：蛋白质组双向电泳PC12细胞中枢神经组织
- 烫伤大鼠肠粘膜下调蛋白质组的分离及鉴定被引量：6
- 2003年
- 目的 对烫伤后大鼠肠粘膜下调蛋白质组进行分离鉴定 ,探讨其在严重烫伤后肠粘膜损害发生中的作用。 方法 采用大鼠Ⅲ度烫伤模型 ,利用高分辨双向电泳 (2 DE)对肠粘膜组织进行蛋白质分离 ,用ImageMaster 2DElite图像分析软件对差异蛋白质中的下调蛋白质组进行鉴定。 结果 烧伤后 6、12h两组明确下调的蛋白质点数为 34,进行鉴定及分析的蛋白质 2 2个 ;与线粒体有关的下调蛋白质有线粒体乌头酸酶、丙酰辅酶A羧化酶、肝脏F1ATP酶重链A、肌钙蛋白 1、短链羟酰基辅酶A脱氢酶、P 电子转移 [传递 ]黄素蛋白α亚基等 6种 ;参与代谢的下调蛋白质有磷酸丙糖异构酶 1和细胞溶质环氧化物水解酶 ;与细胞骨架蛋白及基质蛋白有关的下调蛋白质有纤维单元素、类动力蛋白 5、肌钙蛋白 2和碱性肌浆球蛋白轻链 3共 4种 ;参与调控的下调蛋白质有糖皮质激素诱导蛋白、核因子 1 B2、BRCA1、雌二醇安息香酸盐转录因子、G 蛋白 β 2亚基、N 甲基 D 天门冬氨酸受体 1等 6种 ;与免疫调控有关的下调蛋白质有T细胞受体 V δ6和Ig重链V区蛋白 1。 结论 在大鼠烫伤后肠粘膜表达下调蛋白质中 ,以与线粒体有关及参与激素和细胞因子调控的蛋白质数量居多 ,说明大鼠烫伤后早期损伤发生机制与线粒体功能改变以及激素、细胞因子表达?
- 王晓军孙永华丁勤学冯喆曹原
- 关键词：烫伤肠粘膜蛋白质组
