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赵雅琳

作品数：3 被引量：8H指数：1
供职机构：军事医学科学院基础医学研究所更多>>
发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
相关领域：生物学更多>>

合作作者

文献类型

  • 2篇期刊文章
  • 1篇学位论文

领域

  • 3篇生物学

主题

  • 3篇靶标
  • 3篇SRNA
  • 1篇细菌
  • 1篇基因
  • 1篇SVM

机构

  • 3篇军事医学科学...

作者

  • 3篇赵雅琳
  • 2篇李伍举
  • 2篇王立贵
  • 1篇曹源
  • 1篇应晓敏
  • 1篇侯妍妍
  • 1篇查磊
  • 1篇李华

传媒

  • 1篇军事医学科学...
  • 1篇微生物学报

年份

  • 1篇2009
  • 2篇2008
共 3 条 记 录，以下是 1-3
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排序方式：
细菌sRNA基因及其靶标预测研究进展被引量：8
2009年
细菌sRNA是一类长度在40-500 nt之间的非编码RNA，主要以不完全碱基配对方式与靶标mRNA5′端相互作用进而发挥其生物学功能。鉴于预测方法可以为细菌sRNA及其靶标的实验发现提供指导，因此，细菌sRNA与靶标预测研究受到了广泛重视。文章首先将sRNA预测方法分为3类，分别是基于比较基因组学的预测方法、基于转录单元的预测方法和基于机器学习的预测方法；其次，将sRNA靶标预测方法分为2类，分别是序列比较方法与基于RNA二级结构的预测方法；最后对各类方法的原理、核心思想、优点和局限性进行了分析，并探讨了进一步的发展方向。
王立贵赵雅琳李伍举
关键词：SRNA靶标细菌
基于机器学习的细菌sRNA靶标预测研究
细菌基因组中存在着许多长度在40-500bp之间,不编码蛋白质的小RNA分子。例如,在大肠杆菌(E. coli)中经实验证实的小的非编码RNA数目已达到70多条。这些sRNA大部分结合于mRNA靶标的起始翻译区(TIR)...
赵雅琳
关键词：SRNA靶标
文献传递
基于SVM方法构建细菌sRNA靶标预测模型
2008年
目的:为实验方法鉴定细菌sRNA靶标和研究sRNA功能提供生物信息学支持。方法:首先以实验证实的132个sRNA与靶标相互作用数据为训练集,其中包含46个阳性数据和86个阴性数据;其次,以实验证实的22个阳性数据和随机生成的1 700个阴性数据为测试集;最后以RNA二级结构谱等特征为变量,运用支持向量机(SVM)方法构建sRNA靶标预测数学模型。结果和结论:构建的模型对训练集的敏感性和特异性均为100%,对测试集的敏感性和特异性分别为72.73%和80.65%。所构建的数学模型为实验发现sRNA靶标提供了生物信息学支持。
赵雅琳李华侯妍妍查磊曹源王立贵应晓敏李伍举
关键词：SRNA靶标SVM
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