孙苗
- 作品数：7 被引量：17H指数：3
- 供职机构：中国科学院上海生命科学研究院更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 两株中和性抗hTNFα单抗可变区与hTNFα相互作用的计算机模拟及实验研究
- 2000年
- 在SGI图形工作站上,用同源蛋白结构预测的方法,建立了2株中和性抗hTNFα小鼠单抗(1C3E6,3F6A10)可变区的三维结构模型;并在实验研究2株单抗表位特异性的基础上,根据2株单抗与hTNFα分子表面的形状、静电性、疏水性、氢键等性质,对2株单抗可变区与hTNFα分子的可能结合模式进行了模拟和分析。再根据结合模型,设计并制备了2个hTNFα突变体,然后从实验与计算机模拟两方面着手,对比研究了hTNFα突变前后与两株单抗的结合能力与结合方式的变化。对比研究结果支持了结合模型,该结合模型的建立,为下一步的抗体人源化或小分子化改造等打下了基础。
- 陈建军孙苗方佳刘惠陈常庆王德宝
- 关键词：HTNFΑ单克隆抗体
- hTNF-α单克隆抗体轻、重链可变区基因的克隆和序列及分子结构分析被引量：3
- 1997年
- 从两株具有高亲和力及中和活性的抗人肿瘤坏死因子－α（ｈＴＮＦ－α）的单抗杂交瘤细胞株１Ｃ３、３Ｆ６中分别提取总ＲＮＡ，通过ＲＴ－ＰＣＲ扩增并克隆了抗体的ＶＬ、ＶＨ基因。核苷酸序列分析表明，所克隆基因均为抗体的ＶＬ、ＶＨ基因，并分别属于Ｋａｐｐａ链Ⅳ亚组和重链Ⅲ（Ｄ）亚组。此外，两抗体可变区分子模型及与ｈＴＮＦ－α的结合模型的建立及分析，为进一步的基因工程抗体研究及抗原－抗体相互作用机理的研究奠定了基础。
- 陈建军徐皓高长寿孙苗陈常庆
- 关键词：HTNF-Α单克隆抗体可变区基因
- 金属螯合四肽与其单克隆抗体可变区相互作用的三维结构的计算机模拟
- 1997年
- 目的：模建两株抗金属螯合四肽单抗２Ｅ３－Ｆ７、１Ａ４－Ｄ１２的可变区与其半抗原分子的三维结构，并对它们之间相互作用的可能模式进行了分析、研究。方法：在ＳＧＩ图形工作站上，利用同源蛋白结构预测的方法模建分子结构，然后根据疏水性、静电性等将半抗原与抗体进行对接。结果：获得了两株抗体和半抗原的分子结构模型，并得到了它们可能的相互作用模式。结论：半抗原与抗体是能够合理结合的，而且这两株抗体具有酶催化活性的可能性。
- 韩丽英孙苗陈建军陈建军陈常庆梁卫平
- 关键词：单克隆抗体可变区空间结构
- 含P_R启动子的原核高效表达载体的构建及应用被引量：3
- 1999年
- 组建了一个仅含ＰＲ 启动子的原核高效表达载体ｐＲＣ， 它同时含有ｃⅠ调控基因、多酶切位点和两个强的转录终止序列． 现已成功地用于表达重组人肿瘤坏死因子α（ｈＴＮＦα）、重组人白细胞介素３ （ｈＩＬ３） 和抗溶菌酶（ＨＥＬ） 抗体Ｆｄ 基因， 表达量均占菌体总蛋白的３６％ 以上． 同时还研究了不同的宿主菌和原核增强子序列等因素对ＰＲ 启动子载体表达的影响． 此外， 还比较了分别以ＰＲ、ＰＬ 或ＰＲＰＬ 作为启动子时表达ｈＴＮＦα的情况，结果表明， 单用ＰＲ 或ＰＬ 启动子可获得与使用ＰＲＰＬ
- 陈建军孙苗陈常庆卢芳王德宝
- 关键词：启动子增强子
- 抗单纯疱疹病毒CHA9-3D8单链抗体三维结构的计算机模建和分析被引量：1
- 1997年
- 将１株分别来自单纯疱疹病毒ＭｃＡｂ（重链）和出血热病毒ＭｃＡｂ（轻链）的杂化单链抗体基因序列，在ＳＧＩ图形工作站上，利用同源蛋白结构预测的方法，建立起了其三维结构模型，以寻找轻、重链空间结构的相互关系，观察抗体的结构及表面静电性和疏水性的变化。结果表明，杂化链抗体的轻、重链位置得当，轻链参与组成了“疏水口袋”的形成，并有约五分之二的“袋口”部分由其围成，Ｌｉｎｋｅｒ链位置贴切，游离于轻、重链之外。轻、重链的３个超变区围绕于疏水口袋附近。这一研究为进一步分析轻、重链在抗体功能中的作用，以及改造抗体并提高抗体活性等方面提供了一种途径。
- 杨乔欣马文煜孙苗陈常庆
- 关键词：单纯疱疹病毒单链抗体空间结构
- 用计算机模拟研究人肿瘤坏死因子的结构功能被引量：2
- 2000年
- 人肿瘤坏死因子(humantumornecrosisfactor,hTNFα)的生物学活性是由两种不同受体(TNFR1/R55和TNFR2/R75)介导的。为了了解hTNFα与这两种受体相互作用的异同之处,以便指导hTNFα的蛋白质工程改造,根据LT与R55受体胞外区复合物的晶体结构及hTNFα和LT与两种受体结合的相似性,预测了hTNFα与其两种受体胞外区形成复合物的三维结构模型。并根据所得的计算机模型,分析了hTNFα和受体结合前后的溶剂可及表面积的变化,以及受体与hTNFα之间可能形成的氢键、明显的静电作用和疏水作用。然后根据模型对hTNFα的结构-功能关系进行了分析,并以此为基础设计了几个新的hTNFα突变体。
- 陈建军孙苗陈常庆王德宝
- 关键词：人肿瘤坏死因子计算机模拟
