霍向然
- 作品数：17 被引量：35H指数：3
- 供职机构：河北医科大学第四医院更多>>
- 发文基金：河北省自然科学基金河北省医学科学研究重点课题河北省杰出青年科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 食管鳞状细胞癌相关miRNA的生物信息学分析被引量：3
- 2020年
- 目的:应用生物信息学方法,分析食管鳞状细胞癌miRNA表达谱,筛选差异miRNA并预测其靶基因,分析其生物学功能。方法:下载GEO数据库食管鳞状细胞癌miRNA表达谱芯片数据GSE114110,应用GEO2R软件对数据进行处理分析,筛选差异表达miRNA;应用GEO数据库食管鳞状细胞癌miRNA表达谱芯片数据GSE97049、GSE59973、GSE55856、GSE43732对所筛选出的差异表达miRNA进行验证;应用miRNet预测其靶基因;采用DAVID进行生物功能富集分析;通过String、Cytoscape构建靶基因的蛋白-蛋白互作网络并筛选Hub基因,进一步构建miRNA-Hub gene网络;利用starBase在线分析工具分析Hub基因的表达情况。结果:分析GSE114110芯片数据共筛选出159个DE-miRNAs,在食管癌组织中表达上调的86个,下调的73个。预测上调幅度前三名和下调幅度前三名miRNA的靶基因1700个,它们参与癌症通路、黏着斑、p53信号通路等。在PPI网络中,靶基因连通度最高的前十名为Hub基因,如MAPK1等。通过构建miRNA-Hub gene网络,我们发现大部分Hub基因都可能被hsa-miR-196a-5p和hsa-miR-1调控。hsa-miR-1调控的7个靶基因CDC42、POLR2K、PIK3CA、POLR2I、HIST2H2AC、FN1、VEGFA的表达在ESCC组织中较正常组织明显上调,hsa-miR-1与靶基因之间存在着负相关关系。因此,显著上调的7个基因可能是下调hsa-miR-1的靶点。结论:通过生物信息学方法分析食管鳞癌组织和正常上皮组织的差异DE-miRNAs表达,最终筛选出2个差异显著的miRNA和7个关键的Hub基因为进一步研究食管鳞癌的分子标志物和分子机制提供指导。
- 曹诗茹李琰周荣秒黄茜霍向然王娜
- 关键词：食管鳞状细胞癌MICRORNA生物信息学分析
- XPF基因多态与食管鳞状细胞癌、贲门腺癌的关联研究
- :DNA修复系统对于维持基因组的稳定性和完整性、预防肿瘤发生有不可或缺的作用.DNA修复基因多态可能改变个体的DNA修复能力,因而与多种肿瘤的发病风险相关. 本研究旨在探讨核苷酸切除修复基因XPF -357A/C多态与...
- 周荣秒牛朝旭王娜霍向然李琰
- 关键词：XPFESOPHAGEALSQUAMOUSADENOCARCINOMASUSCEPTIBILITY
- 乳腺癌组织中syk基因的表达及其临床病理意义被引量：5
- 2006年
- 目的探讨syk基因在人乳腺癌组织中及其乳腺癌细胞株中的表达及其生物学意义。方法采用荧光定量PCR方法和免疫组织化学方法分别检测乳腺癌细胞株MCF-7、MDA-MB-231、人乳腺癌癌组织和配对癌旁正常乳腺组织中sykmRNA与蛋白表达及其临床病理特征的关系。结果乳腺癌细胞株MCF-7中SYK蛋白表达为阳性;MDA-MB-231的SYK蛋白为阴性;乳腺癌组织、正常乳腺组织sykmRNA表达阳性率分别为63.3%(19/30)、93.3%(28/30)。乳腺癌癌组织sykmRNA的平均水平〔(6.17±0.0.65)×104〕明显低于配对的癌旁乳腺组织〔(80.37±0.125)×104〕(P<0.01)。SYK蛋白在乳腺癌、癌旁正常组织表达阳性率分别为60%(18/30)、90%(27/30)(P<0.01)。SYK表达下调与乳腺癌淋巴结转移和临床TNM分期显著相关(P<0.05),而与肿瘤的大小、病例分级、ER和PR状况无关(P>0.05)。结论SYK基因低表达或缺失与肿瘤的浸润、转移有关。
- 史健单保恩周艳宋小珍霍向然丁春艳肖冰
- 关键词：乳腺癌细胞株SYK荧光定量PCR免疫组织化学法
- 凋亡相关基因FAS及其配体FASL基因多态性与贲门癌发病风险相关性研究被引量：3
- 2010年
- 目的:探讨FAS基因-1377G/A、-670A/G和FASL基因-844T/C单核苷酸多态(SNP)与贲门腺癌(GCA)遗传易感性的关系。方法:采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析方法检测244例GCA患者和244名健康对照的FAS基因-1377G/A、-670A/G和FASL基因-844T/CSNP的基因型。结果:对照组FAS基因-1377G/A、-670A/G和FASL基因-844T/CSNP基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。FAS基因-1377G/A和-670A/GSNP可能与GCA的发病风险无关。GCA患者组FASL基因-844T/CSNPT等位基因频率为26.4%,明显高于对照组的20.5%(χ2=4.80,P=0.03),但两组的基因型频率分布差异无统计学意义(P>0.05)。与FASL基因-844C/C基因型相比,携带C/T或T/T基因型显著增加贲门癌的发病风险(经性别、年龄和吸烟状况校正的OR=1.53,95%CI=1.06～2.21)。FAS基因-1377G/A、-670A/GSNP的单体型分布在GCA患者组和对照组之间差异无统计学意义(P>0.05)。结论:FASL基因-844T/CSNPT等位基因型可能是GCA发病的潜在危险因素;而FAS基因-1377G/A、-670A/GSNP与GCA遗传易感性无明显相关。
- 周荣秒王娜孙东兰段亚男霍向然郭继红李琰
- 关键词：贲门腺癌FASFASL基因多态性肿瘤易感性
- 基质金属蛋白酶基因多态性与慢性阻塞性肺疾病患病风险的Meta分析被引量：1
- 2017年
- 目的:运用Meta分析的方法综合评价基质金属蛋白酶-9(matrix metalloproteinase-9)-1562C/T(rs3918242)基因多态性与慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)易感性的关系。方法:通过计算机检索Pub Med、EMBASE、FMJS和CNKI数据库,并结合文献追溯、手工检索等方法 ,收集所有符合纳入标准的病例对照研究。应用Meta分析合并MMP-9-1562C/T多态性与COPD易感性关系的OR值,并进行亚组分析、敏感性分析和文献的发表偏倚检验。结果:本次Meta分析共纳入13篇文献,累计病例2 295例,对照2 539例。结果显示,MMP-9-1562C/T多态性与COPD患病风险有关(显性遗传模型:OR=1.40,95%CI:1.03~1.91,P=0.03);按人种行亚组分析,结果表明MMP-9-1562C/T多态性可增加亚洲人COPD患病风险(显性遗传模型:OR=1.80,95%CI:1.04~3.11,P=0.04)。本研究所纳入的研究均可靠且没有发表偏倚。结论:本Meta分析结果表明,MMP-9-1562C/T多态性与COPD的易感性有关,并以显性遗传模型发挥作用。
- 邵之霆张天骄苏秋铭陈天骄周荣秒黄茜曹诗茹霍向然王娜
- 关键词：META分析基质金属蛋白酶-9基因多态性慢性阻塞性肺疾病
- 凋亡相关基因FAS及其配体FASL基因多态性与贲门癌发病风险的关联研究
- 背景与目的:凋亡相关基因FAS与其配体FASL系统在细胞凋亡过程中发挥重要作用,其启动子区多态与多种肿瘤的发病风险相关。本研究旨在探讨FAS基因-1377G/A、-670A/G和FASL基因-844T/C SNPs与河北...
- 周荣秒王娜段亚男孙东兰霍向然李琰
- 关键词：贲门腺癌FASFASL基因多态性肿瘤易感性
- 文献传递
- 沉默PLCε1基因对食管癌Eca109细胞凋亡和侵袭的影响及其作用机制被引量：2
- 2014年
- 目的 :研究沉默磷脂酶Cε1(phospholipase C epsilon 1,PLCε1)基因对食管癌Eca109细胞凋亡和侵袭的影响,并探讨其可能的作用机制。方法 :采用阳离子脂质体法将构建有特异性针对PLCε1基因的短发夹RNA(short hairpin RNA,sh RNA)表达载体(p Genesil-1-PLCε1-sh RNA1、p Genesil-1-PLCε1-sh RNA2和p Genesil-1-PLCε1-sh RNA3)转入Eca109细胞,并筛选出干扰效果最好的表达载体。分别采用FCM和Transwell小室法于PLCε1-sh RNA转染48 h后检测PLCε1基因沉默后对Eca109细胞凋亡和侵袭能力的影响。半定量反转录聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)法检测PLCε1基因沉默后Eca109细胞中自杀相关因子(factor-associated suicide,Fas)及其配体Fas L(Fas ligand)、CD44、基质金属蛋白酶9(matrix metalloproteinase-9,MMP-9)和血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)m RNA表达的改变。结果 :PLCε1-sh RNA2对PLCε1基因的干扰效果最好。PLCε1-sh RNA2转入Eca109细胞48 h后,PLCε1-sh RNA2组Eca109细胞的凋亡率为(30.27±5.13)%,明显高于阴性对照组的(22.06±4.47)%(P<0.05);阴性对照组和PLCε1-sh RNA2组穿过Transwell小室聚碳酸酯膜的Eca109细胞数分别为(82.00±2.00)个和(62.67±3.06)个,PLCε1-sh RNA2组穿过Transwell小室膜的细胞数明显低于阴性对照组(P<0.05)。PLCε1-sh RNA2组Eca109细胞中Fas m RNA的表达水平较阴性对照组明显上调(P<0.05),而Fas L、MMP-9和VEGF m RNA的表达水平均较阴性对照组明显下调(P均<0.05),CD44 m RNA的表达水平未发生改变。结论:沉默PLCε1基因的表达可能通过上调Fas的表达和下调Fas L的表达而促进Eca109细胞的凋亡;并通过下调MMP-9和VEGF的表达抑制Eca109细胞的侵袭能力。
- 周荣秒牛朝旭李宾王娜黄茜霍向然李琰
- 关键词：食管肿瘤RNA干扰
- PLCε1基因多态性与食管癌遗传易感性的关联研究被引量：1
- 2014年
- 目的:探讨PLCε1基因rs2274223 A/G单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)和rs11599672 T/G SNP与河北省磁县高发区人群食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)遗传易感性之间的关系。方法:采用聚合酶链反应-连接酶检测反应(polymerase chain reaction-ligase detection reaction,PCR-LDR)方法对527例ESCC患者和527例健康对照PLCε1基因rs2274223 A/G SNP和rs11599672 T/G SNP进行基因分型。结果:ESCC患者组上消化道肿瘤(upper gastrointestinal can-cer,UGIC)家族史阳性个体比例为48.6%,显著高于健康对照组(39.3%,χ2=9.25,P=0.002)。ESCC患者组及健康对照组PLCε1基因rs2274223 A/G SNP AA、AG、GG基因型频率分别为48.0%、43.9%、8.1%和57.1%、37.5%、5.4%。与AA基因型相比,携带AG、GG、AG/GG基因型可能增加ESCC的发病风险,经年龄、性别、吸烟状况、UGIC家族史校正后的OR值分别为1.41(95%CI=1.09~1.83)、1.71(95%CI=1.03~2.86)、1.45(95%CI=1.13~1.85)。PLCε1基因rs11599672 T/G SNP等位基因频率和基因型频率总体分布在ESCC患者组及健康对照组之间无显著性差异(P>0.05)。应用2LD软件对PLCε1基因rs2274223 A/G SNP和rs11599672 T/GSNP进行联合分析显示,两个多态性位点间不存在连锁不平衡现象(D'=0.11)。与最常见的AT单体型相比,GT单体型增加了ES-CC的发病风险(OR=1.36,95%CI=1.08~1.71)。结论:PLCε1基因rs2274223 A/G SNP可以作为高发区人群ESCC遗传易感性的标志物。UGIC家族史阳性个体、携带PLCε1基因rs2274223 A/G SNP AG、GG基因型的个体罹患ESCC的风险较高,应定期接受食管内镜检查,以便真正实现ESCC的早期诊断、早期治疗。
- 周荣秒王娜牛朝旭黄茜霍向然李琰
- 关键词：单核苷酸多态性食管鳞状细胞癌遗传易感性
- XPG基因多态性与贲门癌遗传易感性关系被引量：1
- 2016年
- 目的 探讨着色性干皮病基因组G（XPG）rs751402 C/T与rs873601 G/A单核苷酸多态性（SNP）与河北省磁县高发区人群贲门腺癌（GCA）遗传易感性之间的关系。方法 采用聚合酶链反应-连接酶检测反应（PCR-LDR）方法对431例GCA患者和432名健康对照XPG基因rs751402 C/T和rs873601 G/A SNP进行基因分型。结果 XPG基因rs751402 C/T SNP T/T基因型增加了≤61岁年龄组个体GCA的发病风险（OR=1.77,95%CI=1.12~3.30）。XPG基因rs873601 G/A SNP与GCA的发病风险无关。结论 携带XPG基因rs751402 C/T SNP T/T基因型个体GCA的发病风险明显增加,应定期接受上消化道内镜检查,以便实现GCA的早诊早治。
- 周荣秒王娜黄茜刘亮李宏霍向然李琰
- 关键词：贲门腺癌遗传易感性
- XRCC1 DNA修复基因单核苷酸多态性与卵巢癌铂类药物敏感性关系的研究
- 目的:上皮性卵巢癌是女性生殖系统恶性肿瘤中死亡率最高的肿瘤。以铂类药物DDP和CBP为基础的化疗在卵巢癌的治疗中占有重要地位。铂类药物对肿瘤细胞的杀伤作用主要通过与DNA结合,形成铂-DNA加合物。导致DNA的链间交联或...
- 李琰段亚男李静霞孙东兰王娜周荣秒霍向然
- 关键词：XRCC1单核苷酸多态性卵巢上皮性癌铂类药物化疗敏感性
- 文献传递
