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2024年8月16日星期五

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量子化学反应性指数及其应用: 结构与性质(功能)关系研究是计算(量子)化学和计算(量子)生物学研究的中心内容,且体系的结构与性质进一步决定了其化学反应性能。概念密度泛函理论(Conceptual Density Functiontheory,CDFT...; 丁晓琴潘里李大禹丁俊杰陈冀胜

基于量化描述符的QSAR用于化合物的毒性预测: 自1962年Corwin Hansch首次构建定量结构-活性关系(QSARs)模型以来,QSAR发展已有近60年历史。作为药物化学研究中最常用和主流的计算工具之一,QSAR在化合物的毒性预测领域也日益崭露头角,这已被近几...; 王亮亮潘里丁俊杰蒋辉丁晓琴; 关键词：DFT 毒性预测; 文献传递

S-(+)-Wieland-Miescher Ketone振动光学活性(VOA)谱理论计算: S-(+)-Wieland-Miescher Ketone(文中简称S-WMK)是许多高活性天然产物全合成的关键中间体,分子结构见图1(上),为萘二酮型(naphthalenedione)化合物,相对刚性分子,含一个手性...; 丁晓琴潘里丁俊杰李大禹; 文献传递

一种天然有机磷酸酯Anatoxin-a(s)反应性能的理论计算研究: Anatoxin-a(s)是从淡水蓝藻水华鱼腥藻(Anabaenaflos-aquae)株NRC525-17中分离得到的一种天然有机磷酸酯。该化合物的极性较强,属于外周乙酰胆碱酯酶(ACh E)的不可逆抑制剂,毒性与VX...; 王亮亮潘里丁俊杰蒋辉丁晓琴; 关键词：有机磷酸酯乙酰胆碱酯酶相互作用; 文献传递

蓖麻毒素与单链抗体分子识别理论研究: 毒素的单链抗体免疫检测是一种高效且安全的检测方法。我们应用分子模拟技术,采用同源模建及分子动力学方法,构建并优化实验获得的新型蓖麻毒素单链抗体Scfv-16三维结构,结合Profile-3D和拉氏图方法,评价单链抗体三维...; 丁俊杰高川丁晓琴李大禹潘里童朝阳; 关键词：蓖麻毒素单链抗体分子识别分子模拟; 文献传递

计算化学与化学武器公约（CWC）: 1997年正式生效的《关于禁止发展、生产、储存和使用化学武器及销毁此种武器的公约》（简称化学武器公约（CWC））,至今已有22年。CWC制定了严格的宣布与核查措施（包括常规例行视察和质疑性视察）,并要求在其生效后全面执行...; 丁晓琴丁俊杰潘里李大禹王亮亮; 文献传递

葡萄球菌肠毒素B亲和体的分子设计研究: 亲和体是一种新型的蛋白质配体,可作为抗体的替代品,用于蛋白质识别、实验诊断、分子显像及靶向治疗等。本文采用分子模拟的方法,对应用噬菌体展示方法获得的9个亲和体和葡萄球菌肠毒素B（SEB）进行三维结构搭建和优化,应用蛋白-...; 丁俊杰高川潘里王亮亮丁晓琴; 关键词：分子对接分子设计; 文献传递

基于概念密度泛函理论磷酸酯类反应性物质毒性预测被引量：3: 2018年; 磷酸酯类反应性物质是乙酰胆碱酯酶不可逆抑制剂。本文应用概念密度泛函理论(CDFT),采用四组条件(B3LYP/6-311++G(2d,3p)/gas,B3LYP/6-311++G(2d,3p)/CPCM/water,MP2/6-311++G(2d,3p)/gas,MP2/6-311++G(2d,3p)/CPCM/water),对20多个磷酸酯反应性物质进行反应性描述指数计算,包括分子的化学势μ,绝对硬度η、亲电性指数ω、分子的前线轨道能量等分子整体描述参数,以及原子福井函数、自然键轨道(NBO)电荷、Wiberg键级、NBO键级等分子局域描述参数。通过对反应性描述指数以及定量构性关系(QSPR)方程预测结果的比较分析,得出结论:大多数化合物亲电进攻的反应中心发生在磷原子上;磷酸酯类化合物侧链乙胺基叔氮的质子化,将显著增强反应中心磷原子的亲电进攻能力;B3LYP/6-311++G(2d,3p)/gas为最合理的计算条件;应用反应性描述指数建立的QSPR模型明显优于常规的2D-QSPR模型,能够用于乙酰胆碱酯酶不可逆抑制剂的精确毒性预测。; 丁晓琴丁俊杰李大禹潘里裴承新; 关键词：定量构性关系

蓖麻毒素与单链抗体分子识别理论研究: 毒素的单链抗体免疫检测是一种高效且安全的检测方法。我们应用分子模拟技术，采用同源模建及分子动力学方法，构建并优化实验获得的新型蓖麻毒素单链抗体Scfv-16三维结构，结合Profile-3D和拉氏图方法，评价单链抗体三维...; 丁俊杰高川丁晓琴李大禹潘里童朝阳; 关键词：蓖麻毒素单链抗体分子识别分子模拟

ω-芋螺毒素的定量构效关系与虚拟筛选被引量：2: 2014年; ω-芋螺毒素属于海洋生物活性多肽,由24-31个氨基酸残基组成.特异性作用于电压敏感的钙离子通道(VGCCs),能够直接开发成药物或作为先导化合物进行新药开发.本文应用新型氨基酸残基结构描述符cscales和遗传偏最小二乘算法,对ω-芋螺毒素进行定量构效关系(QSAR)研究,并设计、构建了容量为2244个化合物的N-型和P/Q-型VGCC拮抗剂虚拟组合多肽库,然后分别采用QSAR模型预测和相似性搜索方法对组合多肽库进行了虚拟筛选.研究结果表明,建立的N-型和P/Q-型VGCC拮抗剂QSAR模型均具有较好的预测能力,交叉验证相关系数(CV-r2)均大于0.89.主成分分析和聚类分析结果表明,虚拟组合多肽库中化合物具有较好的结构多样性和差异性.通过虚拟筛选,得到了具有高预测活性的6个N-型和19个P/Q-型钙离子通道拮抗剂,为进一步的合成和活性评价奠定了理论基础.同时,本文建立的多肽QSAR预测模型和虚拟筛选策略,为其它多肽类化合物的定量构效关系研究和虚拟筛选提供了参考.; 丁俊杰丁晓琴李大禹潘里陈冀胜; 关键词：钙离子通道拮抗剂 QSAR

潘里