朱颖
- 作品数:26 被引量:205H指数:6
- 供职机构:福建省疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金:国家科技重大专项福建省医学创新课题福建省科技创新平台建设项目更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 肠道病毒71型3D蛋白潜在毒力位点的序列分析被引量:2
- 2019年
- 目的分析不同临床严重程度感染者肠道病毒71型的3D蛋白氨基酸序列,了解潜在毒力相关变异位点。方法从NCBI数据库下载不同临床严重程度C4亚型EV71感染者3D区核苷酸序列;对推导的氨基酸序列进行比对和分析,查找不同临床严重程度病毒感染者在3D蛋白存在差异有统计学意义的氨基酸位点。结果共下载序列113株,其中来自于重症及死亡患者序列共67株、轻症患者序列46株。分析显示病毒3D区的256位和370位氨基酸残基,在不同临床严重病例中的分布差异有统计学意义,其中部分重症患者在256位为非异亮氨酸,部分轻症患者在370位为非甘氨酸。结论 C4亚型EV71病毒的3D区256位和370位氨基酸的变异,可能与病毒毒力相关。
- 朱颖陈炜翁育伟
- 关键词:肠道病毒71型基因突变病毒毒力
- 2011-2014年福建省手足口病相关病原柯萨奇病毒A组4型的分子流行病学分析被引量:8
- 2017年
- 目的分析福建省手足口病患者中柯萨奇病毒A组4型(Coxsackievirus A4,CVA4)的流行病学、基因变异及遗传进化等特征。方法应用细胞培养方法获得病毒分离株,RT-PCR方法进行分子分型及扩增CVA4血清型完整VP1区全长序列,并进行序列变异及遗传进化分析。结果 2011-2014年,从福建省手足口病其它肠道病毒病例标本中分子分型33例CVA4病例,在407例的其它肠道病毒病例中的构成比为8.1%,其中2012年31例,2014年2例。CVA4病例在性别、年龄组分布特征,与一般手足口病流行特征相比,没有特异性。VP1区序列差异比较表明,2011-2014年福建省CVA4分离株之间VP1核苷酸及氨基酸序列相似性分别在92.6%~100%、95.7%~100%;与原型株及国外地方株的核苷酸序列相似性较低,分别为83.7%~85.4%、82.1%~89.1%,氨基酸序列相似性分别为96.1%~99.0%、90.4%~99.6%;与国内地方株核苷酸及氨基酸序列相似性较高,分别为87.9%~99.2%、96.1%~100%。进化树结果表明福建CVA4分离株与原型株及国外代表株的遗传距离远,与国内代表株的遗传距离近。福建CVA4分离株在进化树的分布呈多个分支。结论 CVA4已成为近年来福建省除EV71、CVA16、CVA6、CVA10外导致手足口病的又一重要病原体。福建CVA4分离株与国内地方株同进化共循环,在福建省各个地区同时流行多条亲缘关系接近的传播链。
- 陈炜翁育伟何文祥朱颖黄萌张拥军谢剑锋郑奎城严延生
- 关键词:手足口病分子流行病学
- 人感染H7N9禽流感病毒全基因组扩增与测序方法的建立被引量:4
- 2015年
- 目的为了解人感染H7N9禽流感病毒基因特征从而更有效地防控疫情,需建立获得人感染H7N9禽流感病毒全基因序列的扩增和测序方法。方法采用鸡胚分离H7N9禽流感病毒,提取标本和毒株病毒RNA,自行设计引物,通过一步法RT-PCR扩增其全基因组片段,纯化PCR产物后测定核苷酸序列,利用生物信息学软件拼接各节段序列并初步分析其特征。结果本研究中的引物能特异地扩增各基因的目的片段,通过序列拼接可以获得H7N9禽流感全基因组序列。经分析8个节段序列与近期国内流行的人感染H7N9禽流感病毒序列高度同源。结论该方法能有效地获得人感染H7N9禽流感病毒全基因组序列,可为进一步分析其基因特征奠定基础。
- 谢剑锋赵琳张炎华翁育伟陈炜王金章何文祥吴冰珊黄萌黄枝妙朱颖郑奎城严延生
- 关键词:全基因组
- 福建省2011-2014年手足口病相关病原柯萨奇病毒A组10型的分子流行病学研究被引量:38
- 2016年
- 目的 了解2011-2014年福建省手足口病相关病原其他肠道病毒中优势血清型柯萨奇病毒A组10型(Cox A10)的分子流行病学特征。方法 对2011-2014年福建省确诊为其他肠道病毒感染的1525例手足口病病例咽拭子和肛拭子标本进行病毒培养和鉴定分型,扩增、测序并分析其中优势血清型Cox A10的完整VP1区基因片段。结果 共分型鉴定出407例其他肠道病毒病例,包括Cox A10病例103例(占25.3%)。Cox A10病例在2011-2014年福建省手足口病病原谱的年度构成比分别为11.0%、6.0%、18.4%和9.2%。与手足口病总体疫情相比,Cox A10病例在地区、性别、年龄组的分布上没有特异性,致重症率较高。VP1区基因序列分析显示,Cox A10福建分离株与原型株的核苷酸序列同源性较低(76.0%-77.1%),氨基酸序列同源性为91.9%-93.6%。进化分析显示,Cox A10福建分离株与原型株及国外地区分离株的亲缘关系远,与国内地区分离株的亲缘关系近。Cox A10福建分离株分布在进化树上的多个分支。结论 Cox A10为2011-2014年福建省手足口病的主要病原之一。Cox A10福建分离株与国内相应分离株同进化共循环。
- 陈炜翁育伟何文祥朱颖张拥军黄萌谢剑锋郑奎城严延生
- 关键词:手足口病分子流行病学
- H9N2亚型禽流感病毒血凝素基因的分子进化分析
- 2021年
- 目的揭示H9N2亚型禽流感病毒(avian influenza virus,AIV)血凝素(hemagglutinin,HA)基因氨基酸位点的变异情况并探讨其分子进化趋势。方法收集并比对EpiFlu数据库中2020年4月以前H9N2 AIV毒株HA基因序列信息,采用生物信息学的方法分析HA蛋白关键受体结合位点、裂解位点、糖基化位点的氨基酸差异。结果84.92%(4067/4809)序列HA226位点的谷氨酰胺(glutamine,Q)被亮氨酸(leucine,L)替代;来自禽类的序列发生HA-Q226 L突变的占84.75%(4013/4735),来自哺乳动物的序列发生HA-Q226 L突变的占72.97%(54/74);96.26%(4629/4809)序列HA蛋白裂解位点基序模式仍保持低致病性AIV的特点,但有180条来自禽类的序列HA蛋白裂解位点插入了2个碱性氨基酸;58.68%(2822/4809)序列新增1个或者2个潜在糖基化位点,而66.44%序列(3195/4809)丢失糖基化位点HA210-212。结论H9N2亚型AIV HA蛋白受体结合位点趋于结合人类受体,对哺乳动物的适应性增加,HA蛋白裂解位点和糖基化位点有向高致病性AIV的序列特征突变的倾向。
- 游丽斌朱颖阚乃鹏王金章
- 关键词:H9N2禽流感病毒血凝素分子进化
- 福建省2010—2015年手足口病流行情况及EV71 VP1区基因特征被引量:3
- 2017年
- 目的了解福建省手足口病流行概况及2015年相关肠道病毒71型(EV71)分离株的遗传特性,为完善手足口病的防治策略提供参考。方法对福建省2010年至2015年手足口病监测数据进行描述性流行病学分析,并选取2015年分离的40株EV71毒株进行VP1区基因序列测定、进化树分析和序列比较。结果 2010、2011、2013年度福建省手足口病仅出现一次流行高峰(5—7月),2012、2014、2015年度出现两次流行高峰(4—6月,9—10月),1年中病毒优势流行型别发生改变的年份(2012、2014、2015年)发病率较以单一型别病毒为优势流行型别的年份(2010、2011、2013年)高;发病人群主要集中在1到3岁年龄段的低龄儿童;重症率及病死率随流行型别中EV71比例的增加而相应增高。2015年流行的EV71病毒属于C4a亚型,可分为3个进化分支。与EU703814相比,福建省2015年流行毒株的核苷酸差异性较前几年有扩大趋势。结论福建省同一年份中肠道病毒的优势流行型别是否发生改变可能是导致手足口病不同的发病率及不同季节性分布特征的主要原因。2015年福建省EV71流行毒株仍以C4a亚型为主,存在多个传播链同时流行。3处氨基酸位点上(98,249,283)氨基酸的改变对病毒的意义尚需进一步研究。
- 何文祥陈光敏朱颖
- 关键词:手足口病肠道病毒71型
- 2011-2020年福建省手足口病相关柯萨奇病毒A9型基因特征及重组分析
- 2023年
- 目的了解福建地区手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)相关柯萨奇病毒A9型(coxsackievirus A9,CV-A9)的基因特征及重组情况。方法对2011-2020年福建省各地市上送的HFMD阳性标本进行CV-A9筛查、VP1区全长序列测定和基因型别鉴定及分析。对CV-A9阳性标本利用人横纹肌肉瘤细胞(rhabdomyosarcoma,RD)及人喉癌上皮细胞(Human laryngeal carcinoma epithelial cells,HEp-2)进行病毒分离,对分离毒株进行全基因组测序及重组分析。结果2011-2020年福建省各地市上送的HFMD阳性标本中共鉴定出HFMD相关CV-A9阳性7份,获得6条VP1区全长序列。基于VP1序列将CV-A9划分为A~O 15个基因型,其中G基因型又可分为G1及G2两个基因亚型。福建省CV-A9均属于G2基因亚型,在系统进化树上呈散在分布。分离并测序获得3条CV-A9全基因组序列,分析显示毒株2014FJFZ463与福建地区流行的ECHO30毒株存在重组。结论G2基因亚型是我国现阶段流行的优势型别。2011-2020年福建省HFMD相关CV-A9流行呈散发状态,未发现本土传播链的形成,但存在基因重组株。
- 何文祥李林丰朱颖翁育伟陈炜
- 关键词:基因分析
- 2019年福州市急性呼吸道感染病例病毒病原谱调查被引量:15
- 2021年
- 目的了解福州市病毒性急性呼吸道感染(acute respiratory infection, ARI)病原谱及其流行特征。方法收集2019年福州市三家不同类型医院的ARI病例信息并采集呼吸道标本,采用实时定量荧光PCR(polymerase chain reaction,PCR)对标本进行腺病毒(adenovirus, AdV)、博卡病毒(human bocavirus,HBoV)的检测,采用实时定量荧光RT-PCR(reverse transcription-PCR,RT-PCR)对标本进行甲型、乙型流感病毒(influenza virus A/B, IFV-A/B)、呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)、副流感病毒1~4型(parainfluenza virus 1~4,PIV-1~4)、偏肺病毒(human metapneumovirus,HmpV)、冠状病毒(coronavirus,CoV)-229E/OC43/HKU1/NL63、鼻病毒(rhinovirus,RV)的检测,应用卡方检验、Fisher精确检验分析ARI病例流行病学特征。结果 726例ARI病例的316例(43.53%)标本中检出病毒,其中40例为双重感染,9例为三重感染,不同年龄组的病毒检出率差异有统计学意义。检出的主要病毒病原体为IFV(12.40%),其次为Adv(10.61%)、RV(8.82%)、RSV(5.51%)等。AdV在男性ARI病例中的感染更为常见,IFV-B、PIV、RSV、RV、AdV在儿童中的检出率更高,IFV、RSV、RV有明显的季节性分布。结论福州市ARI病例的主要病毒病原包括IFV、AdV、RV、RSV等,不同病毒检出率存在年龄和季节分布差异。
- 林思娴游丽斌张炎华朱颖朱颖翁育伟郑奎城
- 关键词:急性呼吸道感染病毒病原流行病学
- 福建省1例不明原因肺炎病例中甲型H1N1流感病毒的全基因组特征分析被引量:3
- 2017年
- 目的了解1例不明原因肺炎病例中甲型H1N1流感病毒的生物学特性和变异情况,为临床治疗与疫情防控提供依据。方法利用MDCK细胞分离不明原因肺炎病例中的甲型H1N1流感病毒,分离的毒株经全基因组测序后分析其抗原性、致病性和耐药性等特征。结果从该病例的咽拭子标本中分离得到1株甲型H1N1流感病毒并命名为A/FujianGulou/SWL64/2016(H1N1),其8个节段的核苷酸和氨基酸序列与A/California/07/2009(H1N1)疫苗株的相似性分别为96.9%~98.9%和96.7%~99.5%。氨基酸序列分析显示HA蛋白共有18个位点发生突变,其中K163Q、S185T、S203T和D222N变异涉及到3个不同的抗原位点,提示病毒发生抗原漂移;与受体结合位点相关的D222N突变还提示病毒感染下呼吸道的能力增强。耐药性分析显示该病毒对金刚烷胺耐药,对达菲仍然敏感。结论本次研究的甲型H1N1流感病毒具有抗原漂移现象,且具备引发重症肺炎的分子特征,应进一步加强监测,为疫情防控奠定基础。
- 张炎华翁育伟张建明修文琼陈宏彬赵琳何文祥朱颖谢剑锋郑奎城
- 关键词:不明原因肺炎甲型H1N1流感
- 一起腺病毒引起的聚集性呼吸道感染的实验室调查被引量:2
- 2017年
- 目的对一起幼儿园聚集性发热事件开展病原学调查,为疫情处置提供依据。方法采集部分患者呼吸道样品,应用real-time RT-PCR法筛查,腺病毒核酸阳性样品接种HEp-2细胞系,PCR扩增部分腺病毒Hexon高变区基因片段并测序,确定病毒型别并进行变异分析。结果从10份咽拭子标本中检测到7份腺病毒核酸阳性。经分离培养得到7株人腺病毒毒株。系统进化分析确定均为人腺病毒7型。推导的氨基酸序列分析显示,与近年来国内外流行株相比,分离株的Hexon蛋白高变区无氨基酸位点突变。结论结合病例临床表现以及流行病学调查结果,此事件证实系人腺病毒7型引起的急性呼吸道感染聚集性事件。
- 朱颖林琦游丽斌黄枝妙陈敏红姚栩张拥军欧剑鸣翁育伟
- 关键词:人腺病毒病毒分离