夏凯
- 作品数：9 被引量：16H指数：2
- 供职机构：浙江工商大学食品与生物工程学院更多>>
- 发文基金：浙江省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：轻工技术与工程农业科学医药卫生生物学更多>>
- 大肠杆菌毒素Nissle1917-抗毒素系统研究
- 大肠杆菌Nissle1917(E.coli Nissle 1917,EcN 1917)作为一种常见的肠道益生菌,与常规大肠杆菌相比,在治疗胃肠道疾病方面有重要活性或应用前景,而毒素与抗毒系统在其他大肠杆菌中已分析透彻.本...
- 徐君李品毅夏凯梁新乐
- 关键词：毒素-抗毒素系统
- 醋酸菌中CRISPR位点的比较基因组学与进化分析被引量：1
- 2015年
- CRISPR(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats)是近几年发现的一种广泛存在于细菌和古菌中,能够应对外源DNA干扰(噬菌体、病毒、质粒等),并提供免疫机制的重复序列结构。CRISPR系统通常由同向重复序列、前导序列、间隔序列和CRISPR相关蛋白组成。本研究以醋酸发酵中常见3个属醋杆菌属(Acetobacter)、葡糖醋杆菌属(Gluconacetobacter)和葡糖杆菌属(Gluconobacter)的48个菌株为研究对象,通过其基因组上CRISPR相关基因序列的生物信息学分析,探索CRISPR位点在醋酸菌中的多态性及其进化模式。结果表明48株醋酸菌中有32株存在CRISPR结构,大部分CRISPR-Cas结构属于type I-E和type I-C类型。除了葡糖杆菌属外,葡糖醋杆菌属和醋杆菌属中的部分菌株含有II类的CRISPR-Cas系统结构(CRISPR-Cas9)。来自不同属菌株的CRISPR结构中重复序列具有较强的保守性,而且部分菌株CRISPR结构中的前导序列具有保守的motif(与基因的转录调控有关)及启动子序列。进化树分析表明cas1适合用于醋酸菌株的分类,而不同菌株间cas1基因的进化与重复序列的保守性相关,预示它们可能受相似的功能选择压力。此外,间隔序列的数量与噬菌体数量及插入序列(Insertion sequence,IS)数量有正相关的趋势,说明醋酸菌在进化过程中可能正不断受新的外源DNA入侵。醋酸菌中CRISPR结构位点的分析,为进一步研究不同醋酸菌株对醋酸胁迫耐受性差异及其基因组稳定性的分子机制奠定了基础。
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- 关键词：醋酸菌CRISPR遗传进化
- 醋杆菌中群体感应分布与遗传进化分析
- 2020年
- 醋杆菌耐酸性能是制约高酸度食醋发酵的关键因素,为更好地探究醋杆菌耐酸调控机制,笔者选取巴氏醋杆菌为主要研究对象,采用指示菌生物检测和仪器分析方法研究了其群体感应特性。同时,结合生物信息学分析,在基因组水平揭示醋杆菌中群体感应的分布与遗传进化。结果表明,巴氏醋杆菌Ab3和CICC 20001不能合成AHLs类和AI2信号分子。AHLs合成酶LuxI和受体蛋白LuxR的编码基因在巴氏醋杆菌遗传进化过程中普遍丢失,同时也未在其基因组中发现AI2合成和响应体系中关键蛋白的编码序列。相比于巴氏醋杆菌,在其他菌种(如A.malorum和A.tropicalis)中同样不存在AI2合成体系,但拥有完整的AHLs合成和感受体系,表明这些菌株中群体感应仍发挥重要的调控作用。群体感应系统在醋杆菌中的分布与生存环境和基因组稳定性密切相关,其中分离于自然环境和宿主肠道内的菌株拥有更多完整的群体感应体系。
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- 关键词：遗传进化信号分子
- 巴氏醋杆菌酸诱导型启动子的筛选
- 巴氏醋杆菌(Acetobacter pasteurianus)是食醋发酵过程中重要的醋酸菌,但由于其为非模式微生物,其基因克隆表达系统不完善,大大限制限制了醋酸力的代谢改造.启动子工程是实现基因精细表达调控的重要工具之一...
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- 关键词：巴氏醋杆菌
- 醋酸菌耐酸机理及其群体感应研究新进展被引量：13
- 2017年
- 醋酸菌(acetic acid bacteria,AAB)是一类严格好氧的革兰氏阴性细菌,因其乙醇氧化生成醋酸能力强、高耐醋酸等特性而成为食醋发酵的主要工业菌种。醋酸菌的耐酸性对于高酸度食醋生产具有重要意义。随着醋酸菌的蛋白组学及基因组学研究的深入,其糖代谢、蛋白质代谢、脂代谢及应激响应等分子机制或过程也得到更多的阐释;葡糖醋杆菌中有关群体感应系统的研究报道则为从信号通路角度探索醋酸菌的耐酸机制提供了新的思路,进而对于高耐酸醋酸菌的选育以及醋酸发酵工艺的优化具重要的参考意义。本文在简介蛋白组、基因组研究的基础上,着重综述醋酸菌群体感应的研究进展。
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- 关键词：醋酸菌信号分子
- 巴氏醋杆菌酸诱导型启动子的筛选
- 巴氏醋杆菌（Acetobacter pasteurianus）是食醋发酵过程中重要的醋酸菌,但由于其为非模式微生物,其基因克隆表达系统不完善,大大限制限制了醋酸力的代谢改造。启动子工程是实现基因精细表达调控的重要工具之一...
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- 关键词：巴氏醋杆菌
- 文献传递
- 醋酸菌耐酸性后转录调控分子机制TAS研究
- 醋酸菌是食醋发酵的工业菌种,其高耐性能在高浓度食醋的生产中具有重要作用。目前,比较基因组学、转录组及蛋白组学等多组学研究已报道了与菌种耐酸性相关的多种关键基因或关键蛋白及生物过程。然而,转录组数据往往不能完全对映于蛋白组...
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- 关键词：醋酸菌TAS
- 文献传递
- 适于检测非洲猪瘟病毒的点亮Spinach-p54 RNA适配体的设计及应用被引量：2
- 2021年
- 非洲猪瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)是近年来流行的一种主要致病病毒,对我国的国民经济生活造成了严重影响。本研究以非洲猪瘟病毒的编码保守蛋白p54基因序列片段为检测目标,结合点亮Spinach RNA适配体的开关功能,设计了Spinach-p54的嵌合式RNA适配体。其特异地结合目标序列并产生荧光,实现了在RNA水平上对非洲猪瘟病毒的快速检测。研究结果表明,核酸适配体浓度200 nmol/L,反应温度为37℃,该方法检出限为200 nmol/L,线性范围为200~400 nmol/L。该方法特异性强,操作简单,灵敏度高等特点,可用于市场和养殖场的现场快速检测。
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- 关键词：核酸适配体TURN-ON非洲猪瘟
- 大肠杆菌Nissle1917毒素-抗毒素系统研究
- 大肠杆菌Nissle1917（E.coli Nissle 1917,EcN 1917）作为一种常见的肠道益生菌,与常规大肠杆菌相比,在治疗胃肠道疾病方面有重要活性或应用前景,而毒素与抗毒系统在其他大肠杆菌中已分析透彻。本...
- 徐君李品毅夏凯梁新乐
- 关键词：毒素-抗毒素系统
- 文献传递
